RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494710.6

DNAJC6-207, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6, humanhuman

TSL 5

Gene DNAJC6, Length 1,621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC6-207ENST00000494710 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.01■■■■■ 7.2
DNAJC6-207ENST00000494710 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.3■■■■■ 6.12
DNAJC6-207ENST00000494710 ABCC9O60706 1549 aa52.02■■■■■ 5.92
DNAJC6-207ENST00000494710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.16■■■■■ 5.62
DNAJC6-207ENST00000494710 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.1■■■■■ 5.61
DNAJC6-207ENST00000494710 NACADO15069 1562 aa50.06■■■■■ 5.6
DNAJC6-207ENST00000494710 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.99■■■■■ 5.59
DNAJC6-207ENST00000494710 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.78■■■■■ 5.56
DNAJC6-207ENST00000494710 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.63■■■■■ 5.54
DNAJC6-207ENST00000494710 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.06■■■■■ 5.44
DNAJC6-207ENST00000494710 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.65■■■■■ 5.38
DNAJC6-207ENST00000494710 SCRIBQ14160 1630 aa48.65■■■■■ 5.38
DNAJC6-207ENST00000494710 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.58■■■■■ 5.37
DNAJC6-207ENST00000494710 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.02■■■■■ 5.28
DNAJC6-207ENST00000494710 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.64■■■■■ 5.22
DNAJC6-207ENST00000494710 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
DNAJC6-207ENST00000494710 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.08■■■■■ 5.13
DNAJC6-207ENST00000494710 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.74■■■■■ 5.07
DNAJC6-207ENST00000494710 SMARCA4P51532 1647 aa46.54■■■■■ 5.04
DNAJC6-207ENST00000494710 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
DNAJC6-207ENST00000494710 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.26■■■■■ 5
DNAJC6-207ENST00000494710 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.23■■■■■ 4.99
DNAJC6-207ENST00000494710 SMARCA2P51531 1590 aa46.2■■■■■ 4.99
DNAJC6-207ENST00000494710 NCAPD3P42695 1498 aa46.19■■■■■ 4.99
DNAJC6-207ENST00000494710 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.07■■■■■ 4.97
DNAJC6-207ENST00000494710 HMGXB3Q12766 1538 aa45.97■■■■■ 4.95
DNAJC6-207ENST00000494710 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.93
DNAJC6-207ENST00000494710 WIZO95785 1651 aa45.81■■■■■ 4.92
DNAJC6-207ENST00000494710 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
DNAJC6-207ENST00000494710 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
DNAJC6-207ENST00000494710 NESP48681 1621 aa45.07■■■■■ 4.81
DNAJC6-207ENST00000494710 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.96■■■■■ 4.79
DNAJC6-207ENST00000494710 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.86■■■■■ 4.77
DNAJC6-207ENST00000494710 ERCC6Q03468 1493 aa44.82■■■■■ 4.77
DNAJC6-207ENST00000494710 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
DNAJC6-207ENST00000494710 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.76■■■■■ 4.76
DNAJC6-207ENST00000494710 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.66■■■■■ 4.74
DNAJC6-207ENST00000494710 CFTRP13569 1480 aa44.62■■■■■ 4.73
DNAJC6-207ENST00000494710 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.58■■■■■ 4.73
DNAJC6-207ENST00000494710 PRDM2Q13029 1718 aa44.37■■■■■ 4.69
DNAJC6-207ENST00000494710 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.35■■■■■ 4.69
DNAJC6-207ENST00000494710 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
DNAJC6-207ENST00000494710 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.27■■■■■ 4.68
DNAJC6-207ENST00000494710 CUX2O14529 1486 aa44.27■■■■■ 4.68
DNAJC6-207ENST00000494710 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.17■■■■■ 4.66
DNAJC6-207ENST00000494710 WDR62O43379 1518 aa44.02■■■■■ 4.64
DNAJC6-207ENST00000494710 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
DNAJC6-207ENST00000494710 ABCC8Q09428 1581 aa43.66■■■■■ 4.58
DNAJC6-207ENST00000494710 TOPBP1Q92547 1522 aa43.66■■■■■ 4.58
DNAJC6-207ENST00000494710 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.61■■■■■ 4.57
DNAJC6-207ENST00000494710 CUX1P39880 1505 aa43.38■■■■■ 4.54
DNAJC6-207ENST00000494710 IFT140Q96RY7 1462 aa43.33■■■■■ 4.53
DNAJC6-207ENST00000494710 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
DNAJC6-207ENST00000494710 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.21■■■■■ 4.51
DNAJC6-207ENST00000494710 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
DNAJC6-207ENST00000494710 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.15■■■■■ 4.55e-6■■■■■ 29.2
DNAJC6-207ENST00000494710 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
DNAJC6-207ENST00000494710 SOGA1O94964 1423 aa43.14■■■■■ 4.5
DNAJC6-207ENST00000494710 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.11■■■■■ 4.49
DNAJC6-207ENST00000494710 TOP2BQ02880 1626 aa43.06■■■■■ 4.48
DNAJC6-207ENST00000494710 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.06■■■■■ 4.48
DNAJC6-207ENST00000494710 SYNJ1O43426 1573 aa43.05■■■■■ 4.48
DNAJC6-207ENST00000494710 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
DNAJC6-207ENST00000494710 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.94■■■■■ 4.461e-6■■■■■ 28.2
DNAJC6-207ENST00000494710 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
DNAJC6-207ENST00000494710 WDR97A6NE52 1622 aa42.86■■■■■ 4.45
DNAJC6-207ENST00000494710 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.79■■■■■ 4.44
DNAJC6-207ENST00000494710 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.79■■■■■ 4.44
DNAJC6-207ENST00000494710 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.63■■■■■ 4.42
DNAJC6-207ENST00000494710 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.62■■■■■ 4.41
DNAJC6-207ENST00000494710 GRIN2BQ13224 1484 aa42.6■■■■■ 4.41
DNAJC6-207ENST00000494710 PBRM1Q86U86 1689 aa42.57■■■■■ 4.41
DNAJC6-207ENST00000494710 OSCARQ8IYS5 282 aa42.52■■■■■ 4.4
DNAJC6-207ENST00000494710 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.51■■■■■ 4.4
DNAJC6-207ENST00000494710 CHD1O14646 1710 aa42.47■■■■■ 4.39
DNAJC6-207ENST00000494710 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
DNAJC6-207ENST00000494710 FBLN2P98095 1184 aa42.43■■■■■ 4.38
DNAJC6-207ENST00000494710 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
DNAJC6-207ENST00000494710 SYNJ2O15056 1496 aa42.31■■■■■ 4.36
DNAJC6-207ENST00000494710 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.29■■■■■ 4.36
DNAJC6-207ENST00000494710 TRIM41Q8WV44 630 aa42.28■■■■■ 4.36
DNAJC6-207ENST00000494710 KIF27Q86VH2 1401 aa42.25■■■■■ 4.35
DNAJC6-207ENST00000494710 ADAMTS12P58397 1594 aa42.19■■■■■ 4.34
DNAJC6-207ENST00000494710 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.13■■■■■ 4.33
DNAJC6-207ENST00000494710 IGF1RP08069 1367 aa42.07■■■■■ 4.32
DNAJC6-207ENST00000494710 GRIN2AQ12879 1464 aa42.05■■■■■ 4.32
DNAJC6-207ENST00000494710 CUL7Q14999 1698 aa41.95■■■■■ 4.31
DNAJC6-207ENST00000494710 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.94■■■■■ 4.3
DNAJC6-207ENST00000494710 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.94■■■■■ 4.3
DNAJC6-207ENST00000494710 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.86■■■■■ 4.29
DNAJC6-207ENST00000494710 CEP170Q5SW79 1584 aa41.84■■■■■ 4.29
DNAJC6-207ENST00000494710 NUP160Q12769 1436 aa41.84■■■■■ 4.29
DNAJC6-207ENST00000494710 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.82■■■■■ 4.29
DNAJC6-207ENST00000494710 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.81■■■■■ 4.28
DNAJC6-207ENST00000494710 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.81■■■■■ 4.28
DNAJC6-207ENST00000494710 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.81■■■■■ 4.28
DNAJC6-207ENST00000494710 ARHGEF11O15085 1522 aa41.8■■■■■ 4.28
DNAJC6-207ENST00000494710 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.58■■■■■ 4.25
DNAJC6-207ENST00000494710 SHROOM2Q13796 1616 aa41.54■■■■■ 4.24
DNAJC6-207ENST00000494710 EEA1Q15075 1411 aa41.51■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms