RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493894.1

RHBDD3-206, Transcript of rhomboid domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RHBDD3, Length 999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3-206ENST00000493894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.91■■■■■ 7.02
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RHBDD3-206ENST00000493894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.08■■■■■ 5.61
RHBDD3-206ENST00000493894 NACADO15069 1562 aa49.79■■■■■ 5.56
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RHBDD3-206ENST00000493894 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.24■■■■■ 5.47
RHBDD3-206ENST00000493894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
RHBDD3-206ENST00000493894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.91■■■■■ 5.42
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RHBDD3-206ENST00000493894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.72■■■■■ 5.39
RHBDD3-206ENST00000493894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.72■■■■■ 5.39
RHBDD3-206ENST00000493894 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.55■■■■■ 5.36
RHBDD3-206ENST00000493894 SCRIBQ14160 1630 aa48.1■■■■■ 5.29
RHBDD3-206ENST00000493894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.04■■■■■ 5.28
RHBDD3-206ENST00000493894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.37■■■■■ 5.17
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RHBDD3-206ENST00000493894 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.17■■■■■ 5.14
RHBDD3-206ENST00000493894 NCAPD3P42695 1498 aa45.93■■■■■ 4.94
RHBDD3-206ENST00000493894 SMARCA4P51532 1647 aa45.92■■■■■ 4.94
RHBDD3-206ENST00000493894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.84■■■■■ 4.93
RHBDD3-206ENST00000493894 SMARCA2P51531 1590 aa45.78■■■■■ 4.92
RHBDD3-206ENST00000493894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.92
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RHBDD3-206ENST00000493894 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.47■■■■■ 4.87
RHBDD3-206ENST00000493894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
RHBDD3-206ENST00000493894 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.38■■■■■ 4.86
RHBDD3-206ENST00000493894 ERCC6Q03468 1493 aa45.26■■■■■ 4.84
RHBDD3-206ENST00000493894 NESP48681 1621 aa45.08■■■■■ 4.81
RHBDD3-206ENST00000493894 CUX2O14529 1486 aa45.07■■■■■ 4.81
RHBDD3-206ENST00000493894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.9■■■■■ 4.78
RHBDD3-206ENST00000493894 WIZO95785 1651 aa44.86■■■■■ 4.77
RHBDD3-206ENST00000493894 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
RHBDD3-206ENST00000493894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.6■■■■■ 4.73
RHBDD3-206ENST00000493894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.57■■■■■ 4.73
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RHBDD3-206ENST00000493894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.55■■■■■ 4.72
RHBDD3-206ENST00000493894 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.55■■■■■ 4.72
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RHBDD3-206ENST00000493894 CFTRP13569 1480 aa44.13■■■■■ 4.65
RHBDD3-206ENST00000493894 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.11■■■■■ 4.65
RHBDD3-206ENST00000493894 WDR62O43379 1518 aa44.1■■■■■ 4.65
RHBDD3-206ENST00000493894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.07■■■■■ 4.65
RHBDD3-206ENST00000493894 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.79■■■■■ 4.6
RHBDD3-206ENST00000493894 PRDM2Q13029 1718 aa43.78■■■■■ 4.6
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RHBDD3-206ENST00000493894 TOPBP1Q92547 1522 aa43.27■■■■■ 4.52
RHBDD3-206ENST00000493894 ABCC8Q09428 1581 aa43.21■■■■■ 4.51
RHBDD3-206ENST00000493894 IFT140Q96RY7 1462 aa43.2■■■■■ 4.51
RHBDD3-206ENST00000493894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.17■■■■■ 4.5
RHBDD3-206ENST00000493894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
RHBDD3-206ENST00000493894 OSCARQ8IYS5 282 aa42.98■■■■■ 4.47
RHBDD3-206ENST00000493894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
RHBDD3-206ENST00000493894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
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RHBDD3-206ENST00000493894 CUX1P39880 1505 aa42.63■■■■■ 4.42
RHBDD3-206ENST00000493894 SOGA1O94964 1423 aa42.63■■■■■ 4.41
RHBDD3-206ENST00000493894 WDR97A6NE52 1622 aa42.53■■■■■ 4.4
RHBDD3-206ENST00000493894 CHD1O14646 1710 aa42.51■■■■■ 4.4
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RHBDD3-206ENST00000493894 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.45■■■■■ 4.39
RHBDD3-206ENST00000493894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.45■■■■■ 4.39
RHBDD3-206ENST00000493894 ARHGEF11O15085 1522 aa42.36■■■■■ 4.37
RHBDD3-206ENST00000493894 FBLN2P98095 1184 aa42.34■■■■■ 4.37
RHBDD3-206ENST00000493894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.33■■■■■ 4.37
RHBDD3-206ENST00000493894 GRIN2BQ13224 1484 aa42.26■■■■■ 4.36
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RHBDD3-206ENST00000493894 PBRM1Q86U86 1689 aa42.15■■■■■ 4.34
RHBDD3-206ENST00000493894 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.15■■■■■ 4.34
RHBDD3-206ENST00000493894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.1■■■■■ 4.33
RHBDD3-206ENST00000493894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
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RHBDD3-206ENST00000493894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.08■■■■■ 4.33
RHBDD3-206ENST00000493894 TOP2BQ02880 1626 aa42.07■■■■■ 4.33
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RHBDD3-206ENST00000493894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.93■■■■■ 4.3
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RHBDD3-206ENST00000493894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.67■■■■■ 4.26
RHBDD3-206ENST00000493894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.63■■■■■ 4.26
RHBDD3-206ENST00000493894 NUP160Q12769 1436 aa41.56■■■■■ 4.24
RHBDD3-206ENST00000493894 CEP170Q5SW79 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
RHBDD3-206ENST00000493894 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
RHBDD3-206ENST00000493894 SHROOM2Q13796 1616 aa41.36■■■■■ 4.21
RHBDD3-206ENST00000493894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.35■■■■■ 4.21
RHBDD3-206ENST00000493894 KIF27Q86VH2 1401 aa41.25■■■■■ 4.19
RHBDD3-206ENST00000493894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.18■■■■■ 4.18
RHBDD3-206ENST00000493894 CUL7Q14999 1698 aa41.17■■■■■ 4.18
RHBDD3-206ENST00000493894 IGF1RP08069 1367 aa41.12■■■■■ 4.17
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