RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492567.2

SLC22A18-210, Transcript of solute carrier family 22 member 18, humanhuman

TSL 2

Gene SLC22A18, Length 684 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18-210ENST00000492567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.2■■■■■ 5.31
SLC22A18-210ENST00000492567 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.16■■■■■ 4.5
SLC22A18-210ENST00000492567 ABCC9O60706 1549 aa42.7■■■■■ 4.43
SLC22A18-210ENST00000492567 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.82■■■■■ 4.13
SLC22A18-210ENST00000492567 NACADO15069 1562 aa40.62■■■■■ 4.09
SLC22A18-210ENST00000492567 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.38■■■■■ 4.05
SLC22A18-210ENST00000492567 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC22A18-210ENST00000492567 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC22A18-210ENST00000492567 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
SLC22A18-210ENST00000492567 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.82■■■■□ 3.97
SLC22A18-210ENST00000492567 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.76■■■■□ 3.96
SLC22A18-210ENST00000492567 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.68■■■■□ 3.94
SLC22A18-210ENST00000492567 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.65■■■■□ 3.94
SLC22A18-210ENST00000492567 SCRIBQ14160 1630 aa39.36■■■■□ 3.89
SLC22A18-210ENST00000492567 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.09■■■■□ 3.85
SLC22A18-210ENST00000492567 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
SLC22A18-210ENST00000492567 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.63■■■■□ 3.78
SLC22A18-210ENST00000492567 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.39■■■■□ 3.74
SLC22A18-210ENST00000492567 SMARCA4P51532 1647 aa37.58■■■■□ 3.61
SLC22A18-210ENST00000492567 NCAPD3P42695 1498 aa37.45■■■■□ 3.59
SLC22A18-210ENST00000492567 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.44■■■■□ 3.58
SLC22A18-210ENST00000492567 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
SLC22A18-210ENST00000492567 SMARCA2P51531 1590 aa37.35■■■■□ 3.57
SLC22A18-210ENST00000492567 HMGXB3Q12766 1538 aa37.29■■■■□ 3.56
SLC22A18-210ENST00000492567 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.18■■■■□ 3.54
SLC22A18-210ENST00000492567 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.17■■■■□ 3.54
SLC22A18-210ENST00000492567 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
SLC22A18-210ENST00000492567 NESP48681 1621 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC22A18-210ENST00000492567 WIZO95785 1651 aa36.8■■■■□ 3.48
SLC22A18-210ENST00000492567 ERCC6Q03468 1493 aa36.8■■■■□ 3.48
SLC22A18-210ENST00000492567 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC22A18-210ENST00000492567 CUX2O14529 1486 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC22A18-210ENST00000492567 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
SLC22A18-210ENST00000492567 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.46■■■■□ 3.43
SLC22A18-210ENST00000492567 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SLC22A18-210ENST00000492567 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC22A18-210ENST00000492567 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
SLC22A18-210ENST00000492567 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC22A18-210ENST00000492567 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.05■■■■□ 3.36
SLC22A18-210ENST00000492567 CFTRP13569 1480 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC22A18-210ENST00000492567 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC22A18-210ENST00000492567 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC22A18-210ENST00000492567 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC22A18-210ENST00000492567 WDR62O43379 1518 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC22A18-210ENST00000492567 PRDM2Q13029 1718 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC22A18-210ENST00000492567 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC22A18-210ENST00000492567 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
SLC22A18-210ENST00000492567 TOPBP1Q92547 1522 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC22A18-210ENST00000492567 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC22A18-210ENST00000492567 ABCC8Q09428 1581 aa35.21■■■■□ 3.23
SLC22A18-210ENST00000492567 IFT140Q96RY7 1462 aa35.21■■■■□ 3.23
SLC22A18-210ENST00000492567 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
SLC22A18-210ENST00000492567 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
SLC22A18-210ENST00000492567 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
SLC22A18-210ENST00000492567 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
SLC22A18-210ENST00000492567 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
SLC22A18-210ENST00000492567 CUX1P39880 1505 aa34.91■■■■□ 3.18
SLC22A18-210ENST00000492567 OSCARQ8IYS5 282 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC22A18-210ENST00000492567 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.87■■■■□ 3.17
SLC22A18-210ENST00000492567 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.17
SLC22A18-210ENST00000492567 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.85■■■■□ 3.17
SLC22A18-210ENST00000492567 SOGA1O94964 1423 aa34.79■■■■□ 3.16
SLC22A18-210ENST00000492567 CHD1O14646 1710 aa34.78■■■■□ 3.16
SLC22A18-210ENST00000492567 WDR97A6NE52 1622 aa34.7■■■■□ 3.15
SLC22A18-210ENST00000492567 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
SLC22A18-210ENST00000492567 TRIM41Q8WV44 630 aa34.66■■■■□ 3.14
SLC22A18-210ENST00000492567 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.59■■■■□ 3.13
SLC22A18-210ENST00000492567 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.59■■■■□ 3.13
SLC22A18-210ENST00000492567 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.59■■■■□ 3.13
SLC22A18-210ENST00000492567 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.55■■■■□ 3.12
SLC22A18-210ENST00000492567 PBRM1Q86U86 1689 aa34.52■■■■□ 3.12
SLC22A18-210ENST00000492567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.51■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 ARHGEF11O15085 1522 aa34.48■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 SYNJ1O43426 1573 aa34.48■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 FBLN2P98095 1184 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 TOP2BQ02880 1626 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 GRIN2BQ13224 1484 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.45■■■■□ 3.11
SLC22A18-210ENST00000492567 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
SLC22A18-210ENST00000492567 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.41■■■■□ 3.1
SLC22A18-210ENST00000492567 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
SLC22A18-210ENST00000492567 SYNJ2O15056 1496 aa34.32■■■■□ 3.08
SLC22A18-210ENST00000492567 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.3■■■■□ 3.08
SLC22A18-210ENST00000492567 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
SLC22A18-210ENST00000492567 ARAP1Q96P48 1450 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC22A18-210ENST00000492567 ADAMTS12P58397 1594 aa34.16■■■■□ 3.06
SLC22A18-210ENST00000492567 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.08■■■■□ 3.05
SLC22A18-210ENST00000492567 GRIN2AQ12879 1464 aa34.06■■■■□ 3.04
SLC22A18-210ENST00000492567 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
SLC22A18-210ENST00000492567 CEP170Q5SW79 1584 aa33.98■■■■□ 3.03
SLC22A18-210ENST00000492567 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.96■■■■□ 3.03
SLC22A18-210ENST00000492567 NUP160Q12769 1436 aa33.92■■■■□ 3.02
SLC22A18-210ENST00000492567 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.83■■■■□ 3.01
SLC22A18-210ENST00000492567 SHROOM2Q13796 1616 aa33.8■■■■□ 3
SLC22A18-210ENST00000492567 KIF27Q86VH2 1401 aa33.7■■■□□ 2.98
SLC22A18-210ENST00000492567 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.68■■■□□ 2.98
SLC22A18-210ENST00000492567 CUL7Q14999 1698 aa33.68■■■□□ 2.98
SLC22A18-210ENST00000492567 IGF1RP08069 1367 aa33.63■■■□□ 2.97
SLC22A18-210ENST00000492567 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
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