RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490105.1

MDH2-207, Transcript of malate dehydrogenase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MDH2, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2-207ENST00000490105 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.53■■■■■ 6.64
MDH2-207ENST00000490105 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.74■■■■■ 5.71
MDH2-207ENST00000490105 ABCC9O60706 1549 aa50.67■■■■■ 5.7
MDH2-207ENST00000490105 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.22■■■■■ 5.31
MDH2-207ENST00000490105 NACADO15069 1562 aa47.91■■■■■ 5.26
MDH2-207ENST00000490105 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.57■■■■■ 5.21
MDH2-207ENST00000490105 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.55■■■■■ 5.2
MDH2-207ENST00000490105 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.3■■■■■ 5.16
MDH2-207ENST00000490105 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.27■■■■■ 5.16
MDH2-207ENST00000490105 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.15■■■■■ 5.14
MDH2-207ENST00000490105 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.94■■■■■ 5.11
MDH2-207ENST00000490105 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.09
MDH2-207ENST00000490105 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.69■■■■■ 5.06
MDH2-207ENST00000490105 SCRIBQ14160 1630 aa46.24■■■■■ 4.99
MDH2-207ENST00000490105 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.18■■■■■ 4.98
MDH2-207ENST00000490105 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.81■■■■■ 4.92
MDH2-207ENST00000490105 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
MDH2-207ENST00000490105 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.62■■■■■ 4.89
MDH2-207ENST00000490105 NCAPD3P42695 1498 aa44.23■■■■■ 4.67
MDH2-207ENST00000490105 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.12■■■■■ 4.65
MDH2-207ENST00000490105 SMARCA4P51532 1647 aa44.12■■■■■ 4.65
MDH2-207ENST00000490105 SMARCA2P51531 1590 aa43.97■■■■■ 4.63
MDH2-207ENST00000490105 HMGXB3Q12766 1538 aa43.93■■■■■ 4.62
MDH2-207ENST00000490105 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
MDH2-207ENST00000490105 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.69■■■■■ 4.58
MDH2-207ENST00000490105 ERCC6Q03468 1493 aa43.67■■■■■ 4.58
MDH2-207ENST00000490105 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
MDH2-207ENST00000490105 CUX2O14529 1486 aa43.63■■■■■ 4.57
MDH2-207ENST00000490105 NESP48681 1621 aa43.59■■■■■ 4.57
MDH2-207ENST00000490105 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.59■■■■■ 4.57
MDH2-207ENST00000490105 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.56■■■■■ 4.56
MDH2-207ENST00000490105 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.24■■■■■ 4.51
MDH2-207ENST00000490105 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
MDH2-207ENST00000490105 WIZO95785 1651 aa43.09■■■■■ 4.49
MDH2-207ENST00000490105 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.07■■■■■ 4.49
MDH2-207ENST00000490105 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.91■■■■■ 4.46
MDH2-207ENST00000490105 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.86■■■■■ 4.45
MDH2-207ENST00000490105 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
MDH2-207ENST00000490105 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.6■■■■■ 4.41
MDH2-207ENST00000490105 WDR62O43379 1518 aa42.54■■■■■ 4.4
MDH2-207ENST00000490105 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
MDH2-207ENST00000490105 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.43■■■■■ 4.38
MDH2-207ENST00000490105 CFTRP13569 1480 aa42.42■■■■■ 4.38
MDH2-207ENST00000490105 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.39■■■■■ 4.38
MDH2-207ENST00000490105 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
MDH2-207ENST00000490105 PRDM2Q13029 1718 aa42.08■■■■■ 4.33
MDH2-207ENST00000490105 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.02■■■■■ 4.32
MDH2-207ENST00000490105 TOPBP1Q92547 1522 aa41.63■■■■■ 4.25
MDH2-207ENST00000490105 TRIM41Q8WV44 630 aa41.62■■■■■ 4.25
MDH2-207ENST00000490105 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
MDH2-207ENST00000490105 OSCARQ8IYS5 282 aa41.57■■■■■ 4.25
MDH2-207ENST00000490105 IFT140Q96RY7 1462 aa41.57■■■■■ 4.25
MDH2-207ENST00000490105 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.47■■■■■ 4.23
MDH2-207ENST00000490105 ABCC8Q09428 1581 aa41.45■■■■■ 4.23
MDH2-207ENST00000490105 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
MDH2-207ENST00000490105 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
MDH2-207ENST00000490105 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
MDH2-207ENST00000490105 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.18■■■■■ 4.18
MDH2-207ENST00000490105 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.18■■■■■ 4.18
MDH2-207ENST00000490105 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.18■■■■■ 4.18
MDH2-207ENST00000490105 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.182e-11■■■■■ 29.4
MDH2-207ENST00000490105 CHD1O14646 1710 aa41.07■■■■■ 4.17
MDH2-207ENST00000490105 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.06■■■■■ 4.16
MDH2-207ENST00000490105 ARHGEF11O15085 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
MDH2-207ENST00000490105 SOGA1O94964 1423 aa40.96■■■■■ 4.15
MDH2-207ENST00000490105 CUX1P39880 1505 aa40.95■■■■■ 4.15
MDH2-207ENST00000490105 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.95■■■■■ 4.15
MDH2-207ENST00000490105 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
MDH2-207ENST00000490105 WDR97A6NE52 1622 aa40.81■■■■■ 4.12
MDH2-207ENST00000490105 FBLN2P98095 1184 aa40.78■■■■■ 4.12
MDH2-207ENST00000490105 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.75■■■■■ 4.11
MDH2-207ENST00000490105 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
MDH2-207ENST00000490105 ARAP1Q96P48 1450 aa40.64■■■■■ 4.1
MDH2-207ENST00000490105 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.62■■■■■ 4.09
MDH2-207ENST00000490105 GRIN2BQ13224 1484 aa40.61■■■■■ 4.09
MDH2-207ENST00000490105 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
MDH2-207ENST00000490105 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.58■■■■■ 4.09
MDH2-207ENST00000490105 PBRM1Q86U86 1689 aa40.55■■■■■ 4.08
MDH2-207ENST00000490105 SYNJ1O43426 1573 aa40.48■■■■■ 4.07
MDH2-207ENST00000490105 SYNJ2O15056 1496 aa40.48■■■■■ 4.07
MDH2-207ENST00000490105 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.48■■■■■ 4.07
MDH2-207ENST00000490105 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
MDH2-207ENST00000490105 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.47■■■■■ 4.07
MDH2-207ENST00000490105 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.47■■■■■ 4.07
MDH2-207ENST00000490105 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.32■■■■■ 4.05
MDH2-207ENST00000490105 TOP2BQ02880 1626 aa40.29■■■■■ 4.04
MDH2-207ENST00000490105 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.03
MDH2-207ENST00000490105 ADAMTS12P58397 1594 aa40.14■■■■■ 4.02
MDH2-207ENST00000490105 GRIN2AQ12879 1464 aa40.12■■■■■ 4.01
MDH2-207ENST00000490105 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
MDH2-207ENST00000490105 CEP170Q5SW79 1584 aa40.03■■■■■ 4
MDH2-207ENST00000490105 NUP160Q12769 1436 aa39.99■■■■□ 3.99
MDH2-207ENST00000490105 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.99■■■■□ 3.99
MDH2-207ENST00000490105 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
MDH2-207ENST00000490105 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.95■■■■□ 3.99
MDH2-207ENST00000490105 SHROOM2Q13796 1616 aa39.87■■■■□ 3.97
MDH2-207ENST00000490105 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.59■■■■□ 3.93
MDH2-207ENST00000490105 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.92
MDH2-207ENST00000490105 JPH4Q96JJ6 628 aa39.51■■■■□ 3.92
MDH2-207ENST00000490105 IGF1RP08069 1367 aa39.45■■■■□ 3.91
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