RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.93■■■■■ 7.02
NBPF3-211ENST00000485941 ABCC9O60706 1549 aa52.95■■■■■ 6.07
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.86■■■■■ 6.05
NBPF3-211ENST00000485941 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.34■■■■■ 5.65
NBPF3-211ENST00000485941 NACADO15069 1562 aa50.03■■■■■ 5.6
NBPF3-211ENST00000485941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.94■■■■■ 5.59
NBPF3-211ENST00000485941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.56■■■■■ 5.52
NBPF3-211ENST00000485941 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.4■■■■■ 5.5
NBPF3-211ENST00000485941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.29■■■■■ 5.48
NBPF3-211ENST00000485941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.23■■■■■ 5.47
NBPF3-211ENST00000485941 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.02■■■■■ 5.44
NBPF3-211ENST00000485941 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
NBPF3-211ENST00000485941 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.71■■■■■ 5.39
NBPF3-211ENST00000485941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
NBPF3-211ENST00000485941 SCRIBQ14160 1630 aa48.09■■■■■ 5.29
NBPF3-211ENST00000485941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.85■■■■■ 5.25
NBPF3-211ENST00000485941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
NBPF3-211ENST00000485941 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.72■■■■■ 5.23
NBPF3-211ENST00000485941 NCAPD3P42695 1498 aa46.26■■■■■ 5
NBPF3-211ENST00000485941 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.07■■■■■ 4.97
NBPF3-211ENST00000485941 SMARCA4P51532 1647 aa45.94■■■■■ 4.94
NBPF3-211ENST00000485941 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.88■■■■■ 4.94
NBPF3-211ENST00000485941 SMARCA2P51531 1590 aa45.86■■■■■ 4.93
NBPF3-211ENST00000485941 HMGXB3Q12766 1538 aa45.84■■■■■ 4.93
NBPF3-211ENST00000485941 CUX2O14529 1486 aa45.71■■■■■ 4.91
NBPF3-211ENST00000485941 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
NBPF3-211ENST00000485941 ERCC6Q03468 1493 aa45.63■■■■■ 4.9
NBPF3-211ENST00000485941 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.59■■■■■ 4.89
NBPF3-211ENST00000485941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
NBPF3-211ENST00000485941 NESP48681 1621 aa45.51■■■■■ 4.88
NBPF3-211ENST00000485941 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.4■■■■■ 4.86
NBPF3-211ENST00000485941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.14■■■■■ 4.82
NBPF3-211ENST00000485941 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
NBPF3-211ENST00000485941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.86■■■■■ 4.77
NBPF3-211ENST00000485941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.85■■■■■ 4.77
NBPF3-211ENST00000485941 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.8■■■■■ 4.76
NBPF3-211ENST00000485941 WIZO95785 1651 aa44.79■■■■■ 4.76
NBPF3-211ENST00000485941 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.5■■■■■ 4.71
NBPF3-211ENST00000485941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
NBPF3-211ENST00000485941 WDR62O43379 1518 aa44.44■■■■■ 4.7
NBPF3-211ENST00000485941 CFTRP13569 1480 aa44.29■■■■■ 4.68
NBPF3-211ENST00000485941 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.27■■■■■ 4.68
NBPF3-211ENST00000485941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.24■■■■■ 4.67
NBPF3-211ENST00000485941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
NBPF3-211ENST00000485941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.63
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.77■■■■■ 4.6
NBPF3-211ENST00000485941 PRDM2Q13029 1718 aa43.7■■■■■ 4.59
NBPF3-211ENST00000485941 TRIM41Q8WV44 630 aa43.63■■■■■ 4.57
NBPF3-211ENST00000485941 OSCARQ8IYS5 282 aa43.58■■■■■ 4.57
NBPF3-211ENST00000485941 IFT140Q96RY7 1462 aa43.43■■■■■ 4.54
NBPF3-211ENST00000485941 TOPBP1Q92547 1522 aa43.42■■■■■ 4.54
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
NBPF3-211ENST00000485941 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
NBPF3-211ENST00000485941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.22■■■■■ 4.51
NBPF3-211ENST00000485941 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
NBPF3-211ENST00000485941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
NBPF3-211ENST00000485941 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
NBPF3-211ENST00000485941 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
NBPF3-211ENST00000485941 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
NBPF3-211ENST00000485941 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.98■■■■■ 4.47
NBPF3-211ENST00000485941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGEF11O15085 1522 aa42.9■■■■■ 4.46
NBPF3-211ENST00000485941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.81■■■■■ 4.44
NBPF3-211ENST00000485941 CHD1O14646 1710 aa42.76■■■■■ 4.44
NBPF3-211ENST00000485941 SOGA1O94964 1423 aa42.74■■■■■ 4.43
NBPF3-211ENST00000485941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
NBPF3-211ENST00000485941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
NBPF3-211ENST00000485941 CUX1P39880 1505 aa42.65■■■■■ 4.42
NBPF3-211ENST00000485941 WDR97A6NE52 1622 aa42.58■■■■■ 4.41
NBPF3-211ENST00000485941 FBLN2P98095 1184 aa42.56■■■■■ 4.4
NBPF3-211ENST00000485941 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.54■■■■■ 4.4
NBPF3-211ENST00000485941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.5■■■■■ 4.39
NBPF3-211ENST00000485941 ARAP1Q96P48 1450 aa42.5■■■■■ 4.39
NBPF3-211ENST00000485941 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
NBPF3-211ENST00000485941 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.39■■■■■ 4.38
NBPF3-211ENST00000485941 GRIN2BQ13224 1484 aa42.38■■■■■ 4.38
NBPF3-211ENST00000485941 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
NBPF3-211ENST00000485941 SYNJ2O15056 1496 aa42.27■■■■■ 4.36
NBPF3-211ENST00000485941 SYNJ1O43426 1573 aa42.23■■■■■ 4.35
NBPF3-211ENST00000485941 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.22■■■■■ 4.35
NBPF3-211ENST00000485941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.21■■■■■ 4.35
NBPF3-211ENST00000485941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
NBPF3-211ENST00000485941 PBRM1Q86U86 1689 aa42.15■■■■■ 4.34
NBPF3-211ENST00000485941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.14■■■■■ 4.34
NBPF3-211ENST00000485941 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
NBPF3-211ENST00000485941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.95■■■■■ 4.31
NBPF3-211ENST00000485941 TOP2BQ02880 1626 aa41.91■■■■■ 4.3
NBPF3-211ENST00000485941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.91■■■■■ 4.3
NBPF3-211ENST00000485941 GRIN2AQ12879 1464 aa41.85■■■■■ 4.29
NBPF3-211ENST00000485941 ADAMTS12P58397 1594 aa41.8■■■■■ 4.28
NBPF3-211ENST00000485941 NUP160Q12769 1436 aa41.78■■■■■ 4.28
NBPF3-211ENST00000485941 CEP170Q5SW79 1584 aa41.72■■■■■ 4.27
NBPF3-211ENST00000485941 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.71■■■■■ 4.27
NBPF3-211ENST00000485941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.69■■■■■ 4.27
NBPF3-211ENST00000485941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.65■■■■■ 4.26
NBPF3-211ENST00000485941 SHROOM2Q13796 1616 aa41.59■■■■■ 4.25
NBPF3-211ENST00000485941 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
NBPF3-211ENST00000485941 JPH4Q96JJ6 628 aa41.3■■■■■ 4.2
NBPF3-211ENST00000485941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.22■■■■■ 4.19
NBPF3-211ENST00000485941 IGF1RP08069 1367 aa41.16■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 207.3 ms