RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484647.1

TIMM17A-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM17A, Length 661 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17A-204ENST00000484647 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.82■■■■□ 3
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TIMM17A-204ENST00000484647 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.35■■■□□ 2.45
TIMM17A-204ENST00000484647 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
TIMM17A-204ENST00000484647 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.97■■■□□ 2.23
TIMM17A-204ENST00000484647 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.78■■■□□ 2.2
TIMM17A-204ENST00000484647 NACADO15069 1562 aa28.75■■■□□ 2.19
TIMM17A-204ENST00000484647 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM17A-204ENST00000484647 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.51■■■□□ 2.15
TIMM17A-204ENST00000484647 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
TIMM17A-204ENST00000484647 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.34■■■□□ 2.13
TIMM17A-204ENST00000484647 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM17A-204ENST00000484647 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.14■■■□□ 2.1
TIMM17A-204ENST00000484647 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
TIMM17A-204ENST00000484647 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.9■■■□□ 2.06
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TIMM17A-204ENST00000484647 SCRIBQ14160 1630 aa27.67■■■□□ 2.02
TIMM17A-204ENST00000484647 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.55■■■□□ 2
TIMM17A-204ENST00000484647 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.5■■□□□ 1.99
TIMM17A-204ENST00000484647 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
TIMM17A-204ENST00000484647 NCAPD3P42695 1498 aa26.56■■□□□ 1.84
TIMM17A-204ENST00000484647 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.5■■□□□ 1.83
TIMM17A-204ENST00000484647 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.46■■□□□ 1.83
TIMM17A-204ENST00000484647 SMARCA4P51532 1647 aa26.39■■□□□ 1.81
TIMM17A-204ENST00000484647 SMARCA2P51531 1590 aa26.36■■□□□ 1.81
TIMM17A-204ENST00000484647 ERCC6Q03468 1493 aa26.34■■□□□ 1.81
TIMM17A-204ENST00000484647 CUX2O14529 1486 aa26.31■■□□□ 1.8
TIMM17A-204ENST00000484647 HMGXB3Q12766 1538 aa26.31■■□□□ 1.8
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TIMM17A-204ENST00000484647 NESP48681 1621 aa26.18■■□□□ 1.78
TIMM17A-204ENST00000484647 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMM17A-204ENST00000484647 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.06■■□□□ 1.76
TIMM17A-204ENST00000484647 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.96■■□□□ 1.75
TIMM17A-204ENST00000484647 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
TIMM17A-204ENST00000484647 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.83■■□□□ 1.73
TIMM17A-204ENST00000484647 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.83■■□□□ 1.73
TIMM17A-204ENST00000484647 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.76■■□□□ 1.71
TIMM17A-204ENST00000484647 WIZO95785 1651 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMM17A-204ENST00000484647 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMM17A-204ENST00000484647 WDR62O43379 1518 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM17A-204ENST00000484647 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TIMM17A-204ENST00000484647 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM17A-204ENST00000484647 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.45■■□□□ 1.66
TIMM17A-204ENST00000484647 CFTRP13569 1480 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM17A-204ENST00000484647 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TIMM17A-204ENST00000484647 TRIM41Q8WV44 630 aa25.29■■□□□ 1.64
TIMM17A-204ENST00000484647 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TIMM17A-204ENST00000484647 OSCARQ8IYS5 282 aa25.18■■□□□ 1.62
TIMM17A-204ENST00000484647 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM17A-204ENST00000484647 PRDM2Q13029 1718 aa25.14■■□□□ 1.61
TIMM17A-204ENST00000484647 IFT140Q96RY7 1462 aa24.97■■□□□ 1.59
TIMM17A-204ENST00000484647 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TIMM17A-204ENST00000484647 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TIMM17A-204ENST00000484647 TOPBP1Q92547 1522 aa24.95■■□□□ 1.58
TIMM17A-204ENST00000484647 ABCC8Q09428 1581 aa24.9■■□□□ 1.58
TIMM17A-204ENST00000484647 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TIMM17A-204ENST00000484647 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMM17A-204ENST00000484647 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
TIMM17A-204ENST00000484647 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
TIMM17A-204ENST00000484647 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
TIMM17A-204ENST00000484647 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TIMM17A-204ENST00000484647 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.551e-7■■■□□ 16.6
TIMM17A-204ENST00000484647 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TIMM17A-204ENST00000484647 ARHGEF11O15085 1522 aa24.71■■□□□ 1.55
TIMM17A-204ENST00000484647 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TIMM17A-204ENST00000484647 CHD1O14646 1710 aa24.64■■□□□ 1.54
TIMM17A-204ENST00000484647 FBLN2P98095 1184 aa24.64■■□□□ 1.54
TIMM17A-204ENST00000484647 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM17A-204ENST00000484647 SOGA1O94964 1423 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM17A-204ENST00000484647 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM17A-204ENST00000484647 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TIMM17A-204ENST00000484647 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.51■■□□□ 1.51
TIMM17A-204ENST00000484647 CUX1P39880 1505 aa24.47■■□□□ 1.51
TIMM17A-204ENST00000484647 ARAP1Q96P48 1450 aa24.45■■□□□ 1.5
TIMM17A-204ENST00000484647 WDR97A6NE52 1622 aa24.44■■□□□ 1.5
TIMM17A-204ENST00000484647 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.44■■□□□ 1.5
TIMM17A-204ENST00000484647 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TIMM17A-204ENST00000484647 GRIN2BQ13224 1484 aa24.38■■□□□ 1.49
TIMM17A-204ENST00000484647 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TIMM17A-204ENST00000484647 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TIMM17A-204ENST00000484647 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TIMM17A-204ENST00000484647 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.34■■□□□ 1.49
TIMM17A-204ENST00000484647 SYNJ1O43426 1573 aa24.32■■□□□ 1.48
TIMM17A-204ENST00000484647 SYNJ2O15056 1496 aa24.31■■□□□ 1.48
TIMM17A-204ENST00000484647 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMM17A-204ENST00000484647 PBRM1Q86U86 1689 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM17A-204ENST00000484647 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.24■■□□□ 1.47
TIMM17A-204ENST00000484647 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.19■■□□□ 1.46
TIMM17A-204ENST00000484647 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
TIMM17A-204ENST00000484647 GRIN2AQ12879 1464 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMM17A-204ENST00000484647 TOP2BQ02880 1626 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMM17A-204ENST00000484647 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.05■■□□□ 1.44
TIMM17A-204ENST00000484647 ADAMTS12P58397 1594 aa23.99■■□□□ 1.43
TIMM17A-204ENST00000484647 NUP160Q12769 1436 aa23.98■■□□□ 1.43
TIMM17A-204ENST00000484647 CEP170Q5SW79 1584 aa23.98■■□□□ 1.43
TIMM17A-204ENST00000484647 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.98■■□□□ 1.43
TIMM17A-204ENST00000484647 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.97■■□□□ 1.43
TIMM17A-204ENST00000484647 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.92■■□□□ 1.42
TIMM17A-204ENST00000484647 SHROOM2Q13796 1616 aa23.88■■□□□ 1.41
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