RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.58■■■■■ 4.73
GTF3C4-202ENST00000483873 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.52■■■■■ 4.72
GTF3C4-202ENST00000483873 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.51■■■■■ 4.72
GTF3C4-202ENST00000483873 PRXQ9BXM0 1461 aa44.46■■■■■ 4.71
GTF3C4-202ENST00000483873 JPH4Q96JJ6 628 aa44.45■■■■■ 4.71
GTF3C4-202ENST00000483873 EEA1Q15075 1411 aa44.41■■■■■ 4.7
GTF3C4-202ENST00000483873 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
GTF3C4-202ENST00000483873 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.37■■■■■ 4.69
GTF3C4-202ENST00000483873 IQGAP2Q13576 1575 aa44.34■■■■■ 4.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.29■■■■■ 4.68
GTF3C4-202ENST00000483873 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.08■■■■■ 4.65
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF21BO75037 1637 aa44.07■■■■■ 4.64
GTF3C4-202ENST00000483873 DISP1Q96F81 1524 aa44.02■■■■■ 4.64
GTF3C4-202ENST00000483873 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.01■■■■■ 4.64
GTF3C4-202ENST00000483873 KIAA0556O60303 1618 aa43.94■■■■■ 4.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.88■■■■■ 4.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PTPRGP23470 1445 aa43.85■■■■■ 4.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.81■■■■■ 4.6
GTF3C4-202ENST00000483873 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.81■■■■■ 4.6
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA3Q08378 1498 aa43.78■■■■■ 4.6
GTF3C4-202ENST00000483873 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SAMD9Q5K651 1589 aa43.67■■■■■ 4.58
GTF3C4-202ENST00000483873 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
GTF3C4-202ENST00000483873 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
GTF3C4-202ENST00000483873 P3H3Q8IVL6 736 aa43.57■■■■■ 4.57
GTF3C4-202ENST00000483873 UACAQ9BZF9 1416 aa43.57■■■■■ 4.56
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCC2Q92887 1545 aa43.54■■■■■ 4.56
GTF3C4-202ENST00000483873 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.53■■■■■ 4.56
GTF3C4-202ENST00000483873 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.48■■■■■ 4.55
GTF3C4-202ENST00000483873 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.48■■■■■ 4.55
GTF3C4-202ENST00000483873 MAPKBP1O60336 1514 aa43.45■■■■■ 4.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCA8O94911 1581 aa43.44■■■■■ 4.55
GTF3C4-202ENST00000483873 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.42■■■■■ 4.54
GTF3C4-202ENST00000483873 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.4■■■■■ 4.54
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.36■■■■■ 4.53
GTF3C4-202ENST00000483873 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
GTF3C4-202ENST00000483873 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.34■■■■■ 4.53
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.26■■■■■ 4.52
GTF3C4-202ENST00000483873 DIP2BQ9P265 1576 aa43.24■■■■■ 4.51
GTF3C4-202ENST00000483873 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.24■■■■■ 4.51
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.23■■■■■ 4.51
GTF3C4-202ENST00000483873 ASXL2Q76L83 1435 aa43.21■■■■■ 4.51
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.1■■■■■ 4.49
GTF3C4-202ENST00000483873 ARID3CA6NKF2 412 aa43.09■■■■■ 4.49
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP10BO94823 1461 aa43.06■■■■■ 4.48
GTF3C4-202ENST00000483873 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43■■■■■ 4.47
GTF3C4-202ENST00000483873 CLIP1P30622 1438 aa42.97■■■■■ 4.47
GTF3C4-202ENST00000483873 FMN1Q68DA7 1419 aa42.97■■■■■ 4.47
GTF3C4-202ENST00000483873 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
GTF3C4-202ENST00000483873 TSPOAP1O95153 1857 aa42.95■■■■■ 4.47
GTF3C4-202ENST00000483873 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.95■■■■■ 4.47
GTF3C4-202ENST00000483873 GLI2P10070 1586 aa42.94■■■■■ 4.47
GTF3C4-202ENST00000483873 HECW1Q76N89 1606 aa42.85■■■■■ 4.45
GTF3C4-202ENST00000483873 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
GTF3C4-202ENST00000483873 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
GTF3C4-202ENST00000483873 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.82■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CEP162Q5TB80 1403 aa42.81■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNH8Q96L42 1107 aa42.79■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.77■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.7■■■■■ 4.43
GTF3C4-202ENST00000483873 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.68■■■■■ 4.42
GTF3C4-202ENST00000483873 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.6■■■■■ 4.41
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.6■■■■■ 4.41
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.59■■■■■ 4.41
GTF3C4-202ENST00000483873 CD109Q6YHK3 1445 aa42.57■■■■■ 4.41
GTF3C4-202ENST00000483873 KDM6BO15054 1643 aa42.51■■■■■ 4.4
GTF3C4-202ENST00000483873 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.51■■■■■ 4.4
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.5■■■■■ 4.39
GTF3C4-202ENST00000483873 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.5■■■■■ 4.39
GTF3C4-202ENST00000483873 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.44■■■■■ 4.389e-9■■■■■ 31
GTF3C4-202ENST00000483873 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.43■■■■■ 4.38
GTF3C4-202ENST00000483873 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF14Q15058 1648 aa42.39■■■■■ 4.38
GTF3C4-202ENST00000483873 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
GTF3C4-202ENST00000483873 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
GTF3C4-202ENST00000483873 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.28■■■■■ 4.36
GTF3C4-202ENST00000483873 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.21■■■■■ 4.35
GTF3C4-202ENST00000483873 NEO1Q92859 1461 aa42.17■■■■■ 4.34
GTF3C4-202ENST00000483873 FANCAO15360 1455 aa42.13■■■■■ 4.33
GTF3C4-202ENST00000483873 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.13■■■■■ 4.33
GTF3C4-202ENST00000483873 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.12■■■■■ 4.33
GTF3C4-202ENST00000483873 PLCH2O75038 1416 aa42.12■■■■■ 4.33
GTF3C4-202ENST00000483873 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
GTF3C4-202ENST00000483873 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.08■■■■■ 4.33
GTF3C4-202ENST00000483873 TIAM1Q13009 1591 aa42.07■■■■■ 4.32
GTF3C4-202ENST00000483873 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.06■■■■■ 4.32
GTF3C4-202ENST00000483873 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.05■■■■■ 4.32
GTF3C4-202ENST00000483873 AKNAQ7Z591 1439 aa42.04■■■■■ 4.32
GTF3C4-202ENST00000483873 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.03■■■■■ 4.32
GTF3C4-202ENST00000483873 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.03■■■■■ 4.32
GTF3C4-202ENST00000483873 PREX2Q70Z35 1606 aa42.02■■■■■ 4.32
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.99■■■■■ 4.31
GTF3C4-202ENST00000483873 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms