RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483540.1

ARHGEF7-216, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 7, humanhuman

TSL 4

Gene ARHGEF7, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF7-216ENST00000483540 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.62■■■■■ 6.49
ARHGEF7-216ENST00000483540 ABCC9O60706 1549 aa50.31■■■■■ 5.64
ARHGEF7-216ENST00000483540 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.92■■■■■ 5.58
ARHGEF7-216ENST00000483540 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.71■■■■■ 5.23
ARHGEF7-216ENST00000483540 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.48■■■■■ 5.19
ARHGEF7-216ENST00000483540 NACADO15069 1562 aa47.34■■■■■ 5.17
ARHGEF7-216ENST00000483540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.15■■■■■ 5.14
ARHGEF7-216ENST00000483540 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.86■■■■■ 5.09
ARHGEF7-216ENST00000483540 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.63■■■■■ 5.05
ARHGEF7-216ENST00000483540 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.47■■■■■ 5.03
ARHGEF7-216ENST00000483540 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.32■■■■■ 5.01
ARHGEF7-216ENST00000483540 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
ARHGEF7-216ENST00000483540 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.93■■■■■ 4.94
ARHGEF7-216ENST00000483540 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.72■■■■■ 4.91
ARHGEF7-216ENST00000483540 SCRIBQ14160 1630 aa45.52■■■■■ 4.88
ARHGEF7-216ENST00000483540 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.37■■■■■ 4.85
ARHGEF7-216ENST00000483540 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.36■■■■■ 4.85
ARHGEF7-216ENST00000483540 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
ARHGEF7-216ENST00000483540 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.8■■■■■ 4.6
ARHGEF7-216ENST00000483540 NCAPD3P42695 1498 aa43.76■■■■■ 4.6
ARHGEF7-216ENST00000483540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.58■■■■■ 4.57
ARHGEF7-216ENST00000483540 CUX2O14529 1486 aa43.46■■■■■ 4.55
ARHGEF7-216ENST00000483540 ERCC6Q03468 1493 aa43.46■■■■■ 4.55
ARHGEF7-216ENST00000483540 SMARCA2P51531 1590 aa43.41■■■■■ 4.54
ARHGEF7-216ENST00000483540 SMARCA4P51532 1647 aa43.39■■■■■ 4.54
ARHGEF7-216ENST00000483540 HMGXB3Q12766 1538 aa43.35■■■■■ 4.53
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ARHGEF7-216ENST00000483540 NESP48681 1621 aa43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF7-216ENST00000483540 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF7-216ENST00000483540 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.86■■■■■ 4.45
ARHGEF7-216ENST00000483540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.75■■■■■ 4.43
ARHGEF7-216ENST00000483540 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
ARHGEF7-216ENST00000483540 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.59■■■■■ 4.41
ARHGEF7-216ENST00000483540 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.44■■■■■ 4.38
ARHGEF7-216ENST00000483540 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.43■■■■■ 4.38
ARHGEF7-216ENST00000483540 WIZO95785 1651 aa42.26■■■■■ 4.36
ARHGEF7-216ENST00000483540 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.21■■■■■ 4.35
ARHGEF7-216ENST00000483540 WDR62O43379 1518 aa42.08■■■■■ 4.33
ARHGEF7-216ENST00000483540 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.98■■■■■ 4.31
ARHGEF7-216ENST00000483540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.93■■■■■ 4.3
ARHGEF7-216ENST00000483540 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
ARHGEF7-216ENST00000483540 CFTRP13569 1480 aa41.87■■■■■ 4.29
ARHGEF7-216ENST00000483540 TRIM41Q8WV44 630 aa41.77■■■■■ 4.28
ARHGEF7-216ENST00000483540 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
ARHGEF7-216ENST00000483540 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF7-216ENST00000483540 OSCARQ8IYS5 282 aa41.51■■■■■ 4.24
ARHGEF7-216ENST00000483540 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.33■■■■■ 4.21
ARHGEF7-216ENST00000483540 PRDM2Q13029 1718 aa41.21■■■■■ 4.19
ARHGEF7-216ENST00000483540 IFT140Q96RY7 1462 aa41.17■■■■■ 4.18
ARHGEF7-216ENST00000483540 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
ARHGEF7-216ENST00000483540 TOPBP1Q92547 1522 aa41.08■■■■■ 4.17
ARHGEF7-216ENST00000483540 ABCC8Q09428 1581 aa40.99■■■■■ 4.15
ARHGEF7-216ENST00000483540 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.88■■■■■ 4.13
ARHGEF7-216ENST00000483540 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF7-216ENST00000483540 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF7-216ENST00000483540 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF7-216ENST00000483540 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
ARHGEF7-216ENST00000483540 ARHGEF11O15085 1522 aa40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF7-216ENST00000483540 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
ARHGEF7-216ENST00000483540 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
ARHGEF7-216ENST00000483540 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
ARHGEF7-216ENST00000483540 FBLN2P98095 1184 aa40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF7-216ENST00000483540 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF7-216ENST00000483540 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.52■■■■■ 4.08
ARHGEF7-216ENST00000483540 SOGA1O94964 1423 aa40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF7-216ENST00000483540 CHD1O14646 1710 aa40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF7-216ENST00000483540 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF7-216ENST00000483540 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF7-216ENST00000483540 ARAP1Q96P48 1450 aa40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF7-216ENST00000483540 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.3■■■■■ 4.04
ARHGEF7-216ENST00000483540 CUX1P39880 1505 aa40.28■■■■■ 4.04
ARHGEF7-216ENST00000483540 WDR97A6NE52 1622 aa40.26■■■■■ 4.04
ARHGEF7-216ENST00000483540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
ARHGEF7-216ENST00000483540 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
ARHGEF7-216ENST00000483540 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
ARHGEF7-216ENST00000483540 GRIN2BQ13224 1484 aa40.17■■■■■ 4.02
ARHGEF7-216ENST00000483540 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.12■■■■■ 4.01
ARHGEF7-216ENST00000483540 SYNJ1O43426 1573 aa40.07■■■■■ 4.01
ARHGEF7-216ENST00000483540 SYNJ2O15056 1496 aa40.06■■■■■ 4
ARHGEF7-216ENST00000483540 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.99■■■■□ 3.99
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ARHGEF7-216ENST00000483540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.9■■■■□ 3.98
ARHGEF7-216ENST00000483540 PBRM1Q86U86 1689 aa39.83■■■■□ 3.97
ARHGEF7-216ENST00000483540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.79■■■■□ 3.96
ARHGEF7-216ENST00000483540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.72■■■■□ 3.95
ARHGEF7-216ENST00000483540 GRIN2AQ12879 1464 aa39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF7-216ENST00000483540 NUP160Q12769 1436 aa39.53■■■■□ 3.92
ARHGEF7-216ENST00000483540 ADAMTS12P58397 1594 aa39.53■■■■□ 3.92
ARHGEF7-216ENST00000483540 TOP2BQ02880 1626 aa39.52■■■■□ 3.92
ARHGEF7-216ENST00000483540 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.48■■■■□ 3.91
ARHGEF7-216ENST00000483540 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.48■■■■□ 3.91
ARHGEF7-216ENST00000483540 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.47■■■■□ 3.91
ARHGEF7-216ENST00000483540 CEP170Q5SW79 1584 aa39.46■■■■□ 3.91
ARHGEF7-216ENST00000483540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.37■■■■□ 3.89
ARHGEF7-216ENST00000483540 SHROOM2Q13796 1616 aa39.29■■■■□ 3.88
ARHGEF7-216ENST00000483540 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
ARHGEF7-216ENST00000483540 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
ARHGEF7-216ENST00000483540 JPH4Q96JJ6 628 aa39.18■■■■□ 3.86
ARHGEF7-216ENST00000483540 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.96■■■■□ 3.83
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