RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482458.1

STK40-208, Transcript of serine/threonine kinase 40, humanhuman

TSL 3

Gene STK40, Length 900 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK40-208ENST00000482458 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.66■■■■■ 4.74
STK40-208ENST00000482458 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.56■■■■■ 4.72
STK40-208ENST00000482458 IGF1RP08069 1367 aa44.53■■■■■ 4.72
STK40-208ENST00000482458 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.5■■■■■ 4.71
STK40-208ENST00000482458 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.5■■■■■ 4.71
STK40-208ENST00000482458 KIF27Q86VH2 1401 aa44.5■■■■■ 4.71
STK40-208ENST00000482458 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.49■■■■■ 4.71
STK40-208ENST00000482458 MAPKBP1O60336 1514 aa44.45■■■■■ 4.71
STK40-208ENST00000482458 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.44■■■■■ 4.7
STK40-208ENST00000482458 CUL7Q14999 1698 aa44.42■■■■■ 4.7
STK40-208ENST00000482458 DIP2BQ9P265 1576 aa44.35■■■■■ 4.69
STK40-208ENST00000482458 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.23■■■■■ 4.67
STK40-208ENST00000482458 PTPRGP23470 1445 aa44.19■■■■■ 4.66
STK40-208ENST00000482458 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
STK40-208ENST00000482458 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.09■■■■■ 4.65
STK40-208ENST00000482458 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.07■■■■■ 4.65
STK40-208ENST00000482458 KDM6BO15054 1643 aa44.07■■■■■ 4.65
STK40-208ENST00000482458 TSPOAP1O95153 1857 aa44.02■■■■■ 4.64
STK40-208ENST00000482458 IQGAP2Q13576 1575 aa44■■■■■ 4.63
STK40-208ENST00000482458 ABCC2Q92887 1545 aa43.99■■■■■ 4.63
STK40-208ENST00000482458 ASXL2Q76L83 1435 aa43.89■■■■■ 4.62
STK40-208ENST00000482458 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.86■■■■■ 4.61
STK40-208ENST00000482458 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.85■■■■■ 4.61
STK40-208ENST00000482458 DISP1Q96F81 1524 aa43.84■■■■■ 4.61
STK40-208ENST00000482458 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.84■■■■■ 4.61
STK40-208ENST00000482458 UACAQ9BZF9 1416 aa43.83■■■■■ 4.61
STK40-208ENST00000482458 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.77■■■■■ 4.6
STK40-208ENST00000482458 GLI2P10070 1586 aa43.77■■■■■ 4.6
STK40-208ENST00000482458 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.72■■■■■ 4.59
STK40-208ENST00000482458 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
STK40-208ENST00000482458 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.66■■■■■ 4.58
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STK40-208ENST00000482458 KIAA0556O60303 1618 aa43.61■■■■■ 4.57
STK40-208ENST00000482458 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
STK40-208ENST00000482458 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.51■■■■■ 4.56
STK40-208ENST00000482458 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
STK40-208ENST00000482458 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.45■■■■■ 4.55
STK40-208ENST00000482458 ADGRL1O94910 1474 aa43.39■■■■■ 4.54
STK40-208ENST00000482458 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.38■■■■■ 4.54
STK40-208ENST00000482458 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.37■■■■■ 4.53
STK40-208ENST00000482458 GOLGA3Q08378 1498 aa43.34■■■■■ 4.53
STK40-208ENST00000482458 ABCA8O94911 1581 aa43.24■■■■■ 4.51
STK40-208ENST00000482458 PRXQ9BXM0 1461 aa43.22■■■■■ 4.51
STK40-208ENST00000482458 KCNH8Q96L42 1107 aa43.19■■■■■ 4.5
STK40-208ENST00000482458 CD109Q6YHK3 1445 aa43.18■■■■■ 4.5
STK40-208ENST00000482458 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.14■■■■■ 4.5
STK40-208ENST00000482458 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.11■■■■■ 4.49
STK40-208ENST00000482458 P3H3Q8IVL6 736 aa42.98■■■■■ 4.47
STK40-208ENST00000482458 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
STK40-208ENST00000482458 ARID3CA6NKF2 412 aa42.97■■■■■ 4.47
STK40-208ENST00000482458 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
STK40-208ENST00000482458 ATP10BO94823 1461 aa42.9■■■■■ 4.46
STK40-208ENST00000482458 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.9■■■■■ 4.46
STK40-208ENST00000482458 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.81■■■■■ 4.44
STK40-208ENST00000482458 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.81■■■■■ 4.44
STK40-208ENST00000482458 KIF21BO75037 1637 aa42.76■■■■■ 4.44
STK40-208ENST00000482458 SAMD9Q5K651 1589 aa42.76■■■■■ 4.44
STK40-208ENST00000482458 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.73■■■■■ 4.43
STK40-208ENST00000482458 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.69■■■■■ 4.42
STK40-208ENST00000482458 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.69■■■■■ 4.42
STK40-208ENST00000482458 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
STK40-208ENST00000482458 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
STK40-208ENST00000482458 RAPGEF3O95398 923 aa42.59■■■■■ 4.41
STK40-208ENST00000482458 NEO1Q92859 1461 aa42.58■■■■■ 4.41
STK40-208ENST00000482458 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
STK40-208ENST00000482458 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
STK40-208ENST00000482458 EEA1Q15075 1411 aa42.53■■■■■ 4.4
STK40-208ENST00000482458 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.52■■■■■ 4.4
STK40-208ENST00000482458 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.43■■■■■ 4.38
STK40-208ENST00000482458 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.43■■■■■ 4.38
STK40-208ENST00000482458 PTPRMP28827 1452 aa42.43■■■■■ 4.38
STK40-208ENST00000482458 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.4■■■■■ 4.38
STK40-208ENST00000482458 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
STK40-208ENST00000482458 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.3■■■■■ 4.36
STK40-208ENST00000482458 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
STK40-208ENST00000482458 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.28■■■■■ 4.36
STK40-208ENST00000482458 AKNAQ7Z591 1439 aa42.27■■■■■ 4.36
STK40-208ENST00000482458 FANCAO15360 1455 aa42.24■■■■■ 4.35
STK40-208ENST00000482458 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.24■■■■■ 4.352e-9■■■□□ 19.1
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STK40-208ENST00000482458 MADDQ8WXG6 1647 aa42.24■■■■■ 4.35
STK40-208ENST00000482458 RICTORQ6R327 1708 aa42.2■■■■■ 4.35
STK40-208ENST00000482458 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.19■■■■■ 4.34
STK40-208ENST00000482458 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.17■■■■■ 4.34
STK40-208ENST00000482458 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
STK40-208ENST00000482458 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
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STK40-208ENST00000482458 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.05■■■■■ 4.32
STK40-208ENST00000482458 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.04■■■■■ 4.32
STK40-208ENST00000482458 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.03■■■■■ 4.32
STK40-208ENST00000482458 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.03■■■■■ 4.32
STK40-208ENST00000482458 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42■■■■■ 4.31
STK40-208ENST00000482458 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.98■■■■■ 4.31
STK40-208ENST00000482458 PLCH2O75038 1416 aa41.98■■■■■ 4.31
STK40-208ENST00000482458 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
STK40-208ENST00000482458 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
STK40-208ENST00000482458 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.95■■■■■ 4.31
STK40-208ENST00000482458 HECW1Q76N89 1606 aa41.95■■■■■ 4.31
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