RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480613.5

WDR34-205, Transcript of WD repeat domain 34, humanhuman

TSL 3

Gene WDR34, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR34-205ENST00000480613 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.44■■■■■ 6.63
WDR34-205ENST00000480613 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.19■■■■■ 5.63
WDR34-205ENST00000480613 ABCC9O60706 1549 aa48.99■■■■■ 5.43
WDR34-205ENST00000480613 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.26■■■■■ 5.16
WDR34-205ENST00000480613 NACADO15069 1562 aa47.23■■■■■ 5.15
WDR34-205ENST00000480613 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.15■■■■■ 5.14
WDR34-205ENST00000480613 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
WDR34-205ENST00000480613 MYO15BQ96JP2 1530 aa47■■■■■ 5.12
WDR34-205ENST00000480613 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.79■■■■■ 5.08
WDR34-205ENST00000480613 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.99■■■■■ 4.95
WDR34-205ENST00000480613 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.78■■■■■ 4.92
WDR34-205ENST00000480613 SCRIBQ14160 1630 aa45.7■■■■■ 4.91
WDR34-205ENST00000480613 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.7■■■■■ 4.91
WDR34-205ENST00000480613 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.45■■■■■ 4.87
WDR34-205ENST00000480613 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.87■■■■■ 4.77
WDR34-205ENST00000480613 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
WDR34-205ENST00000480613 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.34■■■■■ 4.69
WDR34-205ENST00000480613 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.08■■■■■ 4.65
WDR34-205ENST00000480613 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
WDR34-205ENST00000480613 SMARCA4P51532 1647 aa43.76■■■■■ 4.6
WDR34-205ENST00000480613 NCAPD3P42695 1498 aa43.57■■■■■ 4.56
WDR34-205ENST00000480613 SMARCA2P51531 1590 aa43.56■■■■■ 4.56
WDR34-205ENST00000480613 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.54■■■■■ 4.56
WDR34-205ENST00000480613 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.43■■■■■ 4.54
WDR34-205ENST00000480613 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.38■■■■■ 4.54
WDR34-205ENST00000480613 HMGXB3Q12766 1538 aa43.34■■■■■ 4.53
WDR34-205ENST00000480613 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
WDR34-205ENST00000480613 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
WDR34-205ENST00000480613 WIZO95785 1651 aa42.94■■■■■ 4.46
WDR34-205ENST00000480613 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
WDR34-205ENST00000480613 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.41■■■■■ 4.38
WDR34-205ENST00000480613 NESP48681 1621 aa42.36■■■■■ 4.37
WDR34-205ENST00000480613 ERCC6Q03468 1493 aa42.33■■■■■ 4.37
WDR34-205ENST00000480613 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.3■■■■■ 4.36
WDR34-205ENST00000480613 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.18■■■■■ 4.34
WDR34-205ENST00000480613 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.05■■■■■ 4.32
WDR34-205ENST00000480613 CFTRP13569 1480 aa42.04■■■■■ 4.32
WDR34-205ENST00000480613 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
WDR34-205ENST00000480613 CUX2O14529 1486 aa41.9■■■■■ 4.3
WDR34-205ENST00000480613 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.87■■■■■ 4.29
WDR34-205ENST00000480613 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.78■■■■■ 4.28
WDR34-205ENST00000480613 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
WDR34-205ENST00000480613 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.75■■■■■ 4.27
WDR34-205ENST00000480613 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.67■■■■■ 4.26
WDR34-205ENST00000480613 PRDM2Q13029 1718 aa41.66■■■■■ 4.26
WDR34-205ENST00000480613 WDR62O43379 1518 aa41.51■■■■■ 4.24
WDR34-205ENST00000480613 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
WDR34-205ENST00000480613 ABCC8Q09428 1581 aa41.24■■■■■ 4.19
WDR34-205ENST00000480613 TOPBP1Q92547 1522 aa41.09■■■■■ 4.17
WDR34-205ENST00000480613 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.08■■■■■ 4.17
WDR34-205ENST00000480613 IFT140Q96RY7 1462 aa40.9■■■■■ 4.14
WDR34-205ENST00000480613 CUX1P39880 1505 aa40.76■■■■■ 4.12
WDR34-205ENST00000480613 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
WDR34-205ENST00000480613 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.64■■■■■ 4.1
WDR34-205ENST00000480613 SOGA1O94964 1423 aa40.62■■■■■ 4.09
WDR34-205ENST00000480613 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
WDR34-205ENST00000480613 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.59■■■■■ 4.09
WDR34-205ENST00000480613 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
WDR34-205ENST00000480613 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.54■■■■■ 4.08
WDR34-205ENST00000480613 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.51■■■■■ 4.08
WDR34-205ENST00000480613 TOP2BQ02880 1626 aa40.46■■■■■ 4.07
WDR34-205ENST00000480613 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
WDR34-205ENST00000480613 WDR97A6NE52 1622 aa40.44■■■■■ 4.06
WDR34-205ENST00000480613 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.44■■■■■ 4.06
WDR34-205ENST00000480613 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.067e-14■■■■■ 76.1
WDR34-205ENST00000480613 SYNJ1O43426 1573 aa40.38■■■■■ 4.05
WDR34-205ENST00000480613 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
WDR34-205ENST00000480613 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.3■■■■■ 4.04
WDR34-205ENST00000480613 OSCARQ8IYS5 282 aa40.19■■■■■ 4.02
WDR34-205ENST00000480613 GRIN2BQ13224 1484 aa40.16■■■■■ 4.02
WDR34-205ENST00000480613 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.15■■■■■ 4.02
WDR34-205ENST00000480613 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.08■■■■■ 4.01
WDR34-205ENST00000480613 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
WDR34-205ENST00000480613 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.04■■■■■ 4
WDR34-205ENST00000480613 PBRM1Q86U86 1689 aa39.98■■■■□ 3.99
WDR34-205ENST00000480613 FBLN2P98095 1184 aa39.96■■■■□ 3.99
WDR34-205ENST00000480613 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
WDR34-205ENST00000480613 SYNJ2O15056 1496 aa39.89■■■■□ 3.98
WDR34-205ENST00000480613 CHD1O14646 1710 aa39.89■■■■□ 3.98
WDR34-205ENST00000480613 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.85■■■■□ 3.97
WDR34-205ENST00000480613 KIF27Q86VH2 1401 aa39.79■■■■□ 3.96
WDR34-205ENST00000480613 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.72■■■■□ 3.95
WDR34-205ENST00000480613 ADAMTS12P58397 1594 aa39.7■■■■□ 3.95
WDR34-205ENST00000480613 TRIM41Q8WV44 630 aa39.69■■■■□ 3.94
WDR34-205ENST00000480613 GRIN2AQ12879 1464 aa39.62■■■■□ 3.93
WDR34-205ENST00000480613 IGF1RP08069 1367 aa39.56■■■■□ 3.92
WDR34-205ENST00000480613 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.52■■■■□ 3.92
WDR34-205ENST00000480613 CUL7Q14999 1698 aa39.48■■■■□ 3.91
WDR34-205ENST00000480613 NUP160Q12769 1436 aa39.44■■■■□ 3.9
WDR34-205ENST00000480613 ARHGEF11O15085 1522 aa39.44■■■■□ 3.9
WDR34-205ENST00000480613 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
WDR34-205ENST00000480613 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
WDR34-205ENST00000480613 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
WDR34-205ENST00000480613 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.35■■■■□ 3.89
WDR34-205ENST00000480613 CEP170Q5SW79 1584 aa39.34■■■■□ 3.89
WDR34-205ENST00000480613 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.24■■■■□ 3.87
WDR34-205ENST00000480613 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.14■■■■□ 3.86
WDR34-205ENST00000480613 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.13■■■■□ 3.85
WDR34-205ENST00000480613 SHROOM2Q13796 1616 aa39.11■■■■□ 3.85
WDR34-205ENST00000480613 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms