RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480312.6

ECHDC2-211, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 2, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC2, Length 804 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC2-211ENST00000480312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.98■■■■■ 4.15
ECHDC2-211ENST00000480312 ABCC9O60706 1549 aa36.97■■■■□ 3.51
ECHDC2-211ENST00000480312 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.76■■■■□ 3.48
ECHDC2-211ENST00000480312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.17■■■■□ 3.22
ECHDC2-211ENST00000480312 NACADO15069 1562 aa34.93■■■■□ 3.18
ECHDC2-211ENST00000480312 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.9■■■■□ 3.18
ECHDC2-211ENST00000480312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.75■■■■□ 3.15
ECHDC2-211ENST00000480312 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.47■■■■□ 3.11
ECHDC2-211ENST00000480312 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHDC2-211ENST00000480312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.07■■■■□ 3.04
ECHDC2-211ENST00000480312 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.05■■■■□ 3.04
ECHDC2-211ENST00000480312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.92■■■■□ 3.02
ECHDC2-211ENST00000480312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
ECHDC2-211ENST00000480312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.8■■■■□ 3
ECHDC2-211ENST00000480312 SCRIBQ14160 1630 aa33.42■■■□□ 2.94
ECHDC2-211ENST00000480312 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.39■■■□□ 2.94
ECHDC2-211ENST00000480312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.35■■■□□ 2.93
ECHDC2-211ENST00000480312 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
ECHDC2-211ENST00000480312 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHDC2-211ENST00000480312 NCAPD3P42695 1498 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHDC2-211ENST00000480312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.11■■■□□ 2.73
ECHDC2-211ENST00000480312 CUX2O14529 1486 aa32.06■■■□□ 2.72
ECHDC2-211ENST00000480312 SMARCA2P51531 1590 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHDC2-211ENST00000480312 ERCC6Q03468 1493 aa32.01■■■□□ 2.71
ECHDC2-211ENST00000480312 HMGXB3Q12766 1538 aa31.95■■■□□ 2.71
ECHDC2-211ENST00000480312 SMARCA4P51532 1647 aa31.92■■■□□ 2.7
ECHDC2-211ENST00000480312 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
ECHDC2-211ENST00000480312 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
ECHDC2-211ENST00000480312 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.69■■■□□ 2.66
ECHDC2-211ENST00000480312 NESP48681 1621 aa31.67■■■□□ 2.66
ECHDC2-211ENST00000480312 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.51■■■□□ 2.64
ECHDC2-211ENST00000480312 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.51■■■□□ 2.64
ECHDC2-211ENST00000480312 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.46■■■□□ 2.63
ECHDC2-211ENST00000480312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
ECHDC2-211ENST00000480312 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHDC2-211ENST00000480312 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHDC2-211ENST00000480312 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.09■■■□□ 2.57
ECHDC2-211ENST00000480312 WIZO95785 1651 aa31.03■■■□□ 2.56
ECHDC2-211ENST00000480312 WDR62O43379 1518 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHDC2-211ENST00000480312 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.94■■■□□ 2.54
ECHDC2-211ENST00000480312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.53
ECHDC2-211ENST00000480312 CFTRP13569 1480 aa30.89■■■□□ 2.53
ECHDC2-211ENST00000480312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.89■■■□□ 2.53
ECHDC2-211ENST00000480312 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
ECHDC2-211ENST00000480312 TRIM41Q8WV44 630 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHDC2-211ENST00000480312 OSCARQ8IYS5 282 aa30.68■■■□□ 2.5
ECHDC2-211ENST00000480312 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
ECHDC2-211ENST00000480312 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHDC2-211ENST00000480312 IFT140Q96RY7 1462 aa30.37■■■□□ 2.45
ECHDC2-211ENST00000480312 ABCC8Q09428 1581 aa30.32■■■□□ 2.45
ECHDC2-211ENST00000480312 PRDM2Q13029 1718 aa30.27■■■□□ 2.44
ECHDC2-211ENST00000480312 TOPBP1Q92547 1522 aa30.25■■■□□ 2.43
ECHDC2-211ENST00000480312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
ECHDC2-211ENST00000480312 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.1■■■□□ 2.41
ECHDC2-211ENST00000480312 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHDC2-211ENST00000480312 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHDC2-211ENST00000480312 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHDC2-211ENST00000480312 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.393e-6■■□□□ 13.8
ECHDC2-211ENST00000480312 ARHGEF11O15085 1522 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHDC2-211ENST00000480312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ECHDC2-211ENST00000480312 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ECHDC2-211ENST00000480312 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ECHDC2-211ENST00000480312 FBLN2P98095 1184 aa29.9■■■□□ 2.38
ECHDC2-211ENST00000480312 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.89■■■□□ 2.38
ECHDC2-211ENST00000480312 SOGA1O94964 1423 aa29.88■■■□□ 2.37
ECHDC2-211ENST00000480312 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
ECHDC2-211ENST00000480312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.8■■■□□ 2.36
ECHDC2-211ENST00000480312 WDR97A6NE52 1622 aa29.73■■■□□ 2.35
ECHDC2-211ENST00000480312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
ECHDC2-211ENST00000480312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.7■■■□□ 2.35
ECHDC2-211ENST00000480312 CHD1O14646 1710 aa29.7■■■□□ 2.34
ECHDC2-211ENST00000480312 ARAP1Q96P48 1450 aa29.67■■■□□ 2.34
ECHDC2-211ENST00000480312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.64■■■□□ 2.34
ECHDC2-211ENST00000480312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
ECHDC2-211ENST00000480312 GRIN2BQ13224 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
ECHDC2-211ENST00000480312 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
ECHDC2-211ENST00000480312 CUX1P39880 1505 aa29.61■■■□□ 2.33
ECHDC2-211ENST00000480312 SYNJ2O15056 1496 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHDC2-211ENST00000480312 SYNJ1O43426 1573 aa29.52■■■□□ 2.32
ECHDC2-211ENST00000480312 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.51■■■□□ 2.32
ECHDC2-211ENST00000480312 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.48■■■□□ 2.31
ECHDC2-211ENST00000480312 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.41■■■□□ 2.3
ECHDC2-211ENST00000480312 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ECHDC2-211ENST00000480312 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
ECHDC2-211ENST00000480312 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.26■■■□□ 2.27
ECHDC2-211ENST00000480312 PBRM1Q86U86 1689 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHDC2-211ENST00000480312 GRIN2AQ12879 1464 aa29.19■■■□□ 2.26
ECHDC2-211ENST00000480312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHDC2-211ENST00000480312 NUP160Q12769 1436 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHDC2-211ENST00000480312 TOP2BQ02880 1626 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHDC2-211ENST00000480312 ADAMTS12P58397 1594 aa29.05■■■□□ 2.24
ECHDC2-211ENST00000480312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.05■■■□□ 2.24
ECHDC2-211ENST00000480312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
ECHDC2-211ENST00000480312 CEP170Q5SW79 1584 aa29■■■□□ 2.23
ECHDC2-211ENST00000480312 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.95■■■□□ 2.22
ECHDC2-211ENST00000480312 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
ECHDC2-211ENST00000480312 JPH4Q96JJ6 628 aa28.94■■■□□ 2.22
ECHDC2-211ENST00000480312 SHROOM2Q13796 1616 aa28.91■■■□□ 2.22
ECHDC2-211ENST00000480312 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
ECHDC2-211ENST00000480312 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
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