RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476310.5

HDAC10-211, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC10, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-211ENST00000476310 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.17■■■■■ 4.02
HDAC10-211ENST00000476310 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.56■■■■□ 3.28
HDAC10-211ENST00000476310 ABCC9O60706 1549 aa34.77■■■■□ 3.16
HDAC10-211ENST00000476310 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.58■■■□□ 2.97
HDAC10-211ENST00000476310 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
HDAC10-211ENST00000476310 NACADO15069 1562 aa33.47■■■□□ 2.95
HDAC10-211ENST00000476310 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.45■■■□□ 2.95
HDAC10-211ENST00000476310 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.33■■■□□ 2.93
HDAC10-211ENST00000476310 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.23■■■□□ 2.91
HDAC10-211ENST00000476310 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.63■■■□□ 2.81
HDAC10-211ENST00000476310 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.57■■■□□ 2.8
HDAC10-211ENST00000476310 SCRIBQ14160 1630 aa32.49■■■□□ 2.79
HDAC10-211ENST00000476310 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.47■■■□□ 2.79
HDAC10-211ENST00000476310 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.1■■■□□ 2.73
HDAC10-211ENST00000476310 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.9■■■□□ 2.7
HDAC10-211ENST00000476310 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
HDAC10-211ENST00000476310 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.42■■■□□ 2.62
HDAC10-211ENST00000476310 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.31■■■□□ 2.6
HDAC10-211ENST00000476310 SMARCA4P51532 1647 aa31.09■■■□□ 2.57
HDAC10-211ENST00000476310 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
HDAC10-211ENST00000476310 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.96■■■□□ 2.55
HDAC10-211ENST00000476310 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.95■■■□□ 2.55
HDAC10-211ENST00000476310 NCAPD3P42695 1498 aa30.94■■■□□ 2.54
HDAC10-211ENST00000476310 SMARCA2P51531 1590 aa30.88■■■□□ 2.53
HDAC10-211ENST00000476310 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.81■■■□□ 2.52
HDAC10-211ENST00000476310 HMGXB3Q12766 1538 aa30.73■■■□□ 2.51
HDAC10-211ENST00000476310 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
HDAC10-211ENST00000476310 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
HDAC10-211ENST00000476310 WIZO95785 1651 aa30.6■■■□□ 2.49
HDAC10-211ENST00000476310 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
HDAC10-211ENST00000476310 NESP48681 1621 aa30.13■■■□□ 2.41
HDAC10-211ENST00000476310 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.05■■■□□ 2.4
HDAC10-211ENST00000476310 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
HDAC10-211ENST00000476310 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.03■■■□□ 2.4
HDAC10-211ENST00000476310 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.99■■■□□ 2.39
HDAC10-211ENST00000476310 ERCC6Q03468 1493 aa29.93■■■□□ 2.38
HDAC10-211ENST00000476310 CFTRP13569 1480 aa29.87■■■□□ 2.37
HDAC10-211ENST00000476310 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.87■■■□□ 2.37
HDAC10-211ENST00000476310 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.69■■■□□ 2.34
HDAC10-211ENST00000476310 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.67■■■□□ 2.34
HDAC10-211ENST00000476310 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.59■■■□□ 2.33
HDAC10-211ENST00000476310 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
HDAC10-211ENST00000476310 CUX2O14529 1486 aa29.57■■■□□ 2.32
HDAC10-211ENST00000476310 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.54■■■□□ 2.32
HDAC10-211ENST00000476310 PRDM2Q13029 1718 aa29.5■■■□□ 2.31
HDAC10-211ENST00000476310 WDR62O43379 1518 aa29.41■■■□□ 2.3
HDAC10-211ENST00000476310 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
HDAC10-211ENST00000476310 ABCC8Q09428 1581 aa29.21■■■□□ 2.27
HDAC10-211ENST00000476310 TOPBP1Q92547 1522 aa29.2■■■□□ 2.27
HDAC10-211ENST00000476310 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.14■■■□□ 2.26
HDAC10-211ENST00000476310 CUX1P39880 1505 aa29.03■■■□□ 2.24
HDAC10-211ENST00000476310 IFT140Q96RY7 1462 aa28.98■■■□□ 2.23
HDAC10-211ENST00000476310 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HDAC10-211ENST00000476310 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
HDAC10-211ENST00000476310 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.91■■■□□ 2.22
HDAC10-211ENST00000476310 SOGA1O94964 1423 aa28.88■■■□□ 2.21
HDAC10-211ENST00000476310 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.86■■■□□ 2.21
HDAC10-211ENST00000476310 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
HDAC10-211ENST00000476310 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
HDAC10-211ENST00000476310 TOP2BQ02880 1626 aa28.79■■■□□ 2.2
HDAC10-211ENST00000476310 SYNJ1O43426 1573 aa28.79■■■□□ 2.2
HDAC10-211ENST00000476310 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.76■■■□□ 2.19
HDAC10-211ENST00000476310 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.195e-7■■□□□ 13.1
HDAC10-211ENST00000476310 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HDAC10-211ENST00000476310 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
HDAC10-211ENST00000476310 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.64■■■□□ 2.18
HDAC10-211ENST00000476310 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.61■■■□□ 2.17
HDAC10-211ENST00000476310 WDR97A6NE52 1622 aa28.59■■■□□ 2.17
HDAC10-211ENST00000476310 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.53■■■□□ 2.16
HDAC10-211ENST00000476310 GRIN2BQ13224 1484 aa28.5■■■□□ 2.15
HDAC10-211ENST00000476310 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.47■■■□□ 2.15
HDAC10-211ENST00000476310 OSCARQ8IYS5 282 aa28.45■■■□□ 2.14
HDAC10-211ENST00000476310 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.43■■■□□ 2.14
HDAC10-211ENST00000476310 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
HDAC10-211ENST00000476310 FBLN2P98095 1184 aa28.38■■■□□ 2.13
HDAC10-211ENST00000476310 TRIM41Q8WV44 630 aa28.36■■■□□ 2.13
HDAC10-211ENST00000476310 PBRM1Q86U86 1689 aa28.35■■■□□ 2.13
HDAC10-211ENST00000476310 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HDAC10-211ENST00000476310 SYNJ2O15056 1496 aa28.29■■■□□ 2.12
HDAC10-211ENST00000476310 KIF27Q86VH2 1401 aa28.29■■■□□ 2.12
HDAC10-211ENST00000476310 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.28■■■□□ 2.12
HDAC10-211ENST00000476310 CHD1O14646 1710 aa28.26■■■□□ 2.12
HDAC10-211ENST00000476310 IGF1RP08069 1367 aa28.22■■■□□ 2.11
HDAC10-211ENST00000476310 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.21■■■□□ 2.11
HDAC10-211ENST00000476310 ADAMTS12P58397 1594 aa28.19■■■□□ 2.1
HDAC10-211ENST00000476310 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.13■■■□□ 2.09
HDAC10-211ENST00000476310 GRIN2AQ12879 1464 aa28.13■■■□□ 2.09
HDAC10-211ENST00000476310 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.11■■■□□ 2.09
HDAC10-211ENST00000476310 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.03■■■□□ 2.08
HDAC10-211ENST00000476310 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.02■■■□□ 2.08
HDAC10-211ENST00000476310 NUP160Q12769 1436 aa28.01■■■□□ 2.08
HDAC10-211ENST00000476310 CUL7Q14999 1698 aa28■■■□□ 2.07
HDAC10-211ENST00000476310 CEP170Q5SW79 1584 aa27.96■■■□□ 2.07
HDAC10-211ENST00000476310 ARHGEF11O15085 1522 aa27.92■■■□□ 2.06
HDAC10-211ENST00000476310 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
HDAC10-211ENST00000476310 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
HDAC10-211ENST00000476310 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
HDAC10-211ENST00000476310 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.85■■■□□ 2.05
HDAC10-211ENST00000476310 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.85■■■□□ 2.05
HDAC10-211ENST00000476310 EEA1Q15075 1411 aa27.83■■■□□ 2.05
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