RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475890.5

CSAD-213, Transcript of cysteine sulfinic acid decarboxylase, humanhuman

TSL 5

Gene CSAD, Length 2,080 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAD-213ENST00000475890 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.03■■■□□ 2.88
CSAD-213ENST00000475890 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.58■■■□□ 2.17
CSAD-213ENST00000475890 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CSAD-213ENST00000475890 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.34■■□□□ 1.97
CSAD-213ENST00000475890 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
CSAD-213ENST00000475890 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.2■■□□□ 1.94
CSAD-213ENST00000475890 ABCC9O60706 1549 aa27.01■■□□□ 1.91
CSAD-213ENST00000475890 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.79■■□□□ 1.88
CSAD-213ENST00000475890 NACADO15069 1562 aa26.57■■□□□ 1.84
CSAD-213ENST00000475890 SCRIBQ14160 1630 aa26.5■■□□□ 1.83
CSAD-213ENST00000475890 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CSAD-213ENST00000475890 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.31■■□□□ 1.8
CSAD-213ENST00000475890 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CSAD-213ENST00000475890 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.92■■□□□ 1.74
CSAD-213ENST00000475890 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CSAD-213ENST00000475890 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.75■■□□□ 1.71
CSAD-213ENST00000475890 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.62■■□□□ 1.69
CSAD-213ENST00000475890 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.6■■□□□ 1.69
CSAD-213ENST00000475890 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
CSAD-213ENST00000475890 HRCP23327 699 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAD-213ENST00000475890 MYT1Q01538 1121 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAD-213ENST00000475890 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CSAD-213ENST00000475890 WIZO95785 1651 aa25.42■■□□□ 1.66
CSAD-213ENST00000475890 SMARCA4P51532 1647 aa25.34■■□□□ 1.65
CSAD-213ENST00000475890 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.3■■□□□ 1.64
CSAD-213ENST00000475890 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CSAD-213ENST00000475890 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.97■■□□□ 1.59
CSAD-213ENST00000475890 SMARCA2P51531 1590 aa24.89■■□□□ 1.57
CSAD-213ENST00000475890 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.87■■□□□ 1.57
CSAD-213ENST00000475890 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.87■■□□□ 1.57
CSAD-213ENST00000475890 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CSAD-213ENST00000475890 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CSAD-213ENST00000475890 TRIM41Q8WV44 630 aa24.67■■□□□ 1.54
CSAD-213ENST00000475890 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CSAD-213ENST00000475890 NCAPD3P42695 1498 aa24.56■■□□□ 1.52
CSAD-213ENST00000475890 HMGXB3Q12766 1538 aa24.53■■□□□ 1.52
CSAD-213ENST00000475890 ABCC8Q09428 1581 aa24.51■■□□□ 1.51
CSAD-213ENST00000475890 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CSAD-213ENST00000475890 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAD-213ENST00000475890 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.39■■□□□ 1.5
CSAD-213ENST00000475890 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.36■■□□□ 1.49
CSAD-213ENST00000475890 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CSAD-213ENST00000475890 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CSAD-213ENST00000475890 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
CSAD-213ENST00000475890 SYNJ1O43426 1573 aa24.16■■□□□ 1.46
CSAD-213ENST00000475890 CFTRP13569 1480 aa24.11■■□□□ 1.45
CSAD-213ENST00000475890 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.11■■□□□ 1.45
CSAD-213ENST00000475890 SOGA1O94964 1423 aa24.08■■□□□ 1.45
CSAD-213ENST00000475890 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAD-213ENST00000475890 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 PRDM2Q13029 1718 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 TOP2BQ02880 1626 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CSAD-213ENST00000475890 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAD-213ENST00000475890 CUX1P39880 1505 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAD-213ENST00000475890 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAD-213ENST00000475890 EEA1Q15075 1411 aa23.88■■□□□ 1.41
CSAD-213ENST00000475890 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.84■■□□□ 1.41
CSAD-213ENST00000475890 NESP48681 1621 aa23.82■■□□□ 1.4
CSAD-213ENST00000475890 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CSAD-213ENST00000475890 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAD-213ENST00000475890 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CSAD-213ENST00000475890 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAD-213ENST00000475890 GOLGA3Q08378 1498 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAD-213ENST00000475890 KIF21BO75037 1637 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.62■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.61■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.59■■□□□ 1.37
CSAD-213ENST00000475890 CEP162Q5TB80 1403 aa23.57■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.56■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.54■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 KIF27Q86VH2 1401 aa23.54■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 TOPBP1Q92547 1522 aa23.52■■□□□ 1.36
CSAD-213ENST00000475890 NEUROD1Q13562 356 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 CUX2O14529 1486 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 PRXQ9BXM0 1461 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.45■■□□□ 1.35
CSAD-213ENST00000475890 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.42■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.41■■□□□ 1.34
CSAD-213ENST00000475890 IGF1RP08069 1367 aa23.36■■□□□ 1.33
CSAD-213ENST00000475890 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.33■■□□□ 1.33
CSAD-213ENST00000475890 CLIP1P30622 1438 aa23.31■■□□□ 1.32
CSAD-213ENST00000475890 BCL11AQ9H165 835 aa23.29■■□□□ 1.32
CSAD-213ENST00000475890 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CSAD-213ENST00000475890 WDR97A6NE52 1622 aa23.26■■□□□ 1.31
CSAD-213ENST00000475890 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.23■■□□□ 1.31
CSAD-213ENST00000475890 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.2■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAD-213ENST00000475890 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAD-213ENST00000475890 ARAP1Q96P48 1450 aa23.09■■□□□ 1.29
CSAD-213ENST00000475890 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.08■■□□□ 1.29
CSAD-213ENST00000475890 WDR62O43379 1518 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms