RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472949.1

FBXL3-204, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene FBXL3, Length 329 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3-204ENST00000472949 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.43■■■■■ 7.9
FBXL3-204ENST00000472949 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.22■■■■■ 6.75
FBXL3-204ENST00000472949 ABCC9O60706 1549 aa55.93■■■■■ 6.54
FBXL3-204ENST00000472949 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.85■■■■■ 6.21
FBXL3-204ENST00000472949 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.85■■■■■ 6.21
FBXL3-204ENST00000472949 NACADO15069 1562 aa53.82■■■■■ 6.21
FBXL3-204ENST00000472949 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.65■■■■■ 6.18
FBXL3-204ENST00000472949 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.53■■■■■ 6.16
FBXL3-204ENST00000472949 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.32■■■■■ 6.13
FBXL3-204ENST00000472949 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.6■■■■■ 6.01
FBXL3-204ENST00000472949 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.32■■■■■ 5.97
FBXL3-204ENST00000472949 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.2■■■■■ 5.95
FBXL3-204ENST00000472949 SCRIBQ14160 1630 aa52.19■■■■■ 5.95
FBXL3-204ENST00000472949 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.68■■■■■ 5.86
FBXL3-204ENST00000472949 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.34■■■■■ 5.81
FBXL3-204ENST00000472949 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.81■■■■■ 5.72
FBXL3-204ENST00000472949 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.6■■■■■ 5.69
FBXL3-204ENST00000472949 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.27■■■■■ 5.64
FBXL3-204ENST00000472949 SMARCA4P51532 1647 aa49.95■■■■■ 5.59
FBXL3-204ENST00000472949 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.92■■■■■ 5.58
FBXL3-204ENST00000472949 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.69■■■■■ 5.55
FBXL3-204ENST00000472949 NCAPD3P42695 1498 aa49.68■■■■■ 5.54
FBXL3-204ENST00000472949 SMARCA2P51531 1590 aa49.63■■■■■ 5.54
FBXL3-204ENST00000472949 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.63■■■■■ 5.54
FBXL3-204ENST00000472949 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.47■■■■■ 5.51
FBXL3-204ENST00000472949 HMGXB3Q12766 1538 aa49.39■■■■■ 5.5
FBXL3-204ENST00000472949 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.27■■■■■ 5.48
FBXL3-204ENST00000472949 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.11■■■■■ 5.45
FBXL3-204ENST00000472949 WIZO95785 1651 aa49.1■■■■■ 5.45
FBXL3-204ENST00000472949 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
FBXL3-204ENST00000472949 NESP48681 1621 aa48.42■■■■■ 5.34
FBXL3-204ENST00000472949 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.32■■■■■ 5.33
FBXL3-204ENST00000472949 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.24■■■■■ 5.31
FBXL3-204ENST00000472949 ERCC6Q03468 1493 aa48.22■■■■■ 5.31
FBXL3-204ENST00000472949 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.04■■■■■ 5.28
FBXL3-204ENST00000472949 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.03■■■■■ 5.28
FBXL3-204ENST00000472949 CFTRP13569 1480 aa47.95■■■■■ 5.27
FBXL3-204ENST00000472949 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
FBXL3-204ENST00000472949 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.83■■■■■ 5.25
FBXL3-204ENST00000472949 CUX2O14529 1486 aa47.7■■■■■ 5.23
FBXL3-204ENST00000472949 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
FBXL3-204ENST00000472949 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.65■■■■■ 5.22
FBXL3-204ENST00000472949 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.58■■■■■ 5.21
FBXL3-204ENST00000472949 PRDM2Q13029 1718 aa47.55■■■■■ 5.2
FBXL3-204ENST00000472949 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.51■■■■■ 5.2
FBXL3-204ENST00000472949 WDR62O43379 1518 aa47.33■■■■■ 5.17
FBXL3-204ENST00000472949 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
FBXL3-204ENST00000472949 ABCC8Q09428 1581 aa46.94■■■■■ 5.11
FBXL3-204ENST00000472949 TOPBP1Q92547 1522 aa46.9■■■■■ 5.1
FBXL3-204ENST00000472949 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.84■■■■■ 5.09
FBXL3-204ENST00000472949 IFT140Q96RY7 1462 aa46.61■■■■■ 5.05
FBXL3-204ENST00000472949 CUX1P39880 1505 aa46.55■■■■■ 5.04
FBXL3-204ENST00000472949 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
FBXL3-204ENST00000472949 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.39■■■■■ 5.02
FBXL3-204ENST00000472949 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
FBXL3-204ENST00000472949 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
FBXL3-204ENST00000472949 SOGA1O94964 1423 aa46.35■■■■■ 5.01
FBXL3-204ENST00000472949 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.3■■■■■ 5
FBXL3-204ENST00000472949 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.3■■■■■ 5
FBXL3-204ENST00000472949 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.23■■■■■ 4.99
FBXL3-204ENST00000472949 TOP2BQ02880 1626 aa46.17■■■■■ 4.98
FBXL3-204ENST00000472949 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.16■■■■■ 4.98
FBXL3-204ENST00000472949 SYNJ1O43426 1573 aa46.14■■■■■ 4.98
FBXL3-204ENST00000472949 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
FBXL3-204ENST00000472949 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.13■■■■■ 4.983e-6■■■■□ 25.2
FBXL3-204ENST00000472949 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
FBXL3-204ENST00000472949 WDR97A6NE52 1622 aa46.02■■■■■ 4.96
FBXL3-204ENST00000472949 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.97■■■■■ 4.95
FBXL3-204ENST00000472949 OSCARQ8IYS5 282 aa45.81■■■■■ 4.92
FBXL3-204ENST00000472949 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.8■■■■■ 4.92
FBXL3-204ENST00000472949 GRIN2BQ13224 1484 aa45.79■■■■■ 4.92
FBXL3-204ENST00000472949 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.74■■■■■ 4.91
FBXL3-204ENST00000472949 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.68■■■■■ 4.9
FBXL3-204ENST00000472949 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
FBXL3-204ENST00000472949 PBRM1Q86U86 1689 aa45.64■■■■■ 4.9
FBXL3-204ENST00000472949 FBLN2P98095 1184 aa45.59■■■■■ 4.89
FBXL3-204ENST00000472949 CHD1O14646 1710 aa45.57■■■■■ 4.89
FBXL3-204ENST00000472949 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
FBXL3-204ENST00000472949 SYNJ2O15056 1496 aa45.47■■■■■ 4.87
FBXL3-204ENST00000472949 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.42■■■■■ 4.86
FBXL3-204ENST00000472949 KIF27Q86VH2 1401 aa45.35■■■■■ 4.85
FBXL3-204ENST00000472949 TRIM41Q8WV44 630 aa45.3■■■■■ 4.84
FBXL3-204ENST00000472949 ADAMTS12P58397 1594 aa45.29■■■■■ 4.84
FBXL3-204ENST00000472949 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.28■■■■■ 4.84
FBXL3-204ENST00000472949 IGF1RP08069 1367 aa45.18■■■■■ 4.82
FBXL3-204ENST00000472949 GRIN2AQ12879 1464 aa45.17■■■■■ 4.82
FBXL3-204ENST00000472949 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.09■■■■■ 4.81
FBXL3-204ENST00000472949 CUL7Q14999 1698 aa44.99■■■■■ 4.79
FBXL3-204ENST00000472949 NUP160Q12769 1436 aa44.99■■■■■ 4.79
FBXL3-204ENST00000472949 ARHGEF11O15085 1522 aa44.97■■■■■ 4.79
FBXL3-204ENST00000472949 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
FBXL3-204ENST00000472949 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
FBXL3-204ENST00000472949 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
FBXL3-204ENST00000472949 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.93■■■■■ 4.78
FBXL3-204ENST00000472949 CEP170Q5SW79 1584 aa44.92■■■■■ 4.78
FBXL3-204ENST00000472949 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.91■■■■■ 4.78
FBXL3-204ENST00000472949 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.79■■■■■ 4.76
FBXL3-204ENST00000472949 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.63■■■■■ 4.73
FBXL3-204ENST00000472949 SHROOM2Q13796 1616 aa44.62■■■■■ 4.73
FBXL3-204ENST00000472949 ARAP1Q96P48 1450 aa44.62■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms