RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468255.5

CSNK2B-206, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

TSL 5

Gene CSNK2B, Length 1,792 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-206ENST00000468255 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.13■■■□□ 2.57
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.69■■□□□ 1.86
CSNK2B-206ENST00000468255 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CSNK2B-206ENST00000468255 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.03■■□□□ 1.76
CSNK2B-206ENST00000468255 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.81■■□□□ 1.72
CSNK2B-206ENST00000468255 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CSNK2B-206ENST00000468255 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.28■■□□□ 1.64
CSNK2B-206ENST00000468255 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.12■■□□□ 1.61
CSNK2B-206ENST00000468255 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.11■■□□□ 1.61
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCC9O60706 1549 aa25.1■■□□□ 1.61
CSNK2B-206ENST00000468255 NACADO15069 1562 aa24.61■■□□□ 1.53
CSNK2B-206ENST00000468255 SCRIBQ14160 1630 aa24.61■■□□□ 1.53
CSNK2B-206ENST00000468255 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CSNK2B-206ENST00000468255 HRCP23327 699 aa24.44■■□□□ 1.5
CSNK2B-206ENST00000468255 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.43■■□□□ 1.5
CSNK2B-206ENST00000468255 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK2B-206ENST00000468255 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.19■■□□□ 1.46
CSNK2B-206ENST00000468255 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK2B-206ENST00000468255 TRIM41Q8WV44 630 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK2B-206ENST00000468255 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK2B-206ENST00000468255 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK2B-206ENST00000468255 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CSNK2B-206ENST00000468255 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CSNK2B-206ENST00000468255 WIZO95785 1651 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK2B-206ENST00000468255 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CSNK2B-206ENST00000468255 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CSNK2B-206ENST00000468255 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CSNK2B-206ENST00000468255 SMARCA4P51532 1647 aa23.7■■□□□ 1.38
CSNK2B-206ENST00000468255 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.63■■□□□ 1.37
CSNK2B-206ENST00000468255 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CSNK2B-206ENST00000468255 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CSNK2B-206ENST00000468255 SMARCA2P51531 1590 aa23.52■■□□□ 1.36
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK2B-206ENST00000468255 EEA1Q15075 1411 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK2B-206ENST00000468255 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK2B-206ENST00000468255 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.34■■□□□ 1.33
CSNK2B-206ENST00000468255 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCC8Q09428 1581 aa23.28■■□□□ 1.32
CSNK2B-206ENST00000468255 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
CSNK2B-206ENST00000468255 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.21■■□□□ 1.31
CSNK2B-206ENST00000468255 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.12■■□□□ 1.29
CSNK2B-206ENST00000468255 CEP162Q5TB80 1403 aa23.12■■□□□ 1.29
CSNK2B-206ENST00000468255 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.09■■□□□ 1.29
CSNK2B-206ENST00000468255 SOGA1O94964 1423 aa23.08■■□□□ 1.29
CSNK2B-206ENST00000468255 GOLGA3Q08378 1498 aa23.07■■□□□ 1.28
CSNK2B-206ENST00000468255 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.07■■□□□ 1.28
CSNK2B-206ENST00000468255 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.04■■□□□ 1.28
CSNK2B-206ENST00000468255 KIF21BO75037 1637 aa22.99■■□□□ 1.27
CSNK2B-206ENST00000468255 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CSNK2B-206ENST00000468255 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK2B-206ENST00000468255 SYNJ1O43426 1573 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK2B-206ENST00000468255 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.91■■□□□ 1.26
CSNK2B-206ENST00000468255 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CSNK2B-206ENST00000468255 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CSNK2B-206ENST00000468255 TOP2BQ02880 1626 aa22.78■■□□□ 1.24
CSNK2B-206ENST00000468255 HMGXB3Q12766 1538 aa22.77■■□□□ 1.24
CSNK2B-206ENST00000468255 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.75■■□□□ 1.23
CSNK2B-206ENST00000468255 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CSNK2B-206ENST00000468255 CLIP1P30622 1438 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK2B-206ENST00000468255 NCAPD3P42695 1498 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK2B-206ENST00000468255 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK2B-206ENST00000468255 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK2B-206ENST00000468255 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.62■■□□□ 1.21
CSNK2B-206ENST00000468255 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.58■■□□□ 1.21
CSNK2B-206ENST00000468255 PRXQ9BXM0 1461 aa22.53■■□□□ 1.2
CSNK2B-206ENST00000468255 APLP2Q06481 763 aa22.52■■□□□ 1.2
CSNK2B-206ENST00000468255 CFTRP13569 1480 aa22.47■■□□□ 1.19
CSNK2B-206ENST00000468255 PRDM2Q13029 1718 aa22.46■■□□□ 1.19
CSNK2B-206ENST00000468255 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CSNK2B-206ENST00000468255 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CSNK2B-206ENST00000468255 CUX1P39880 1505 aa22.44■■□□□ 1.18
CSNK2B-206ENST00000468255 KIF27Q86VH2 1401 aa22.43■■□□□ 1.18
CSNK2B-206ENST00000468255 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CSNK2B-206ENST00000468255 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CSNK2B-206ENST00000468255 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.34■■□□□ 1.17
CSNK2B-206ENST00000468255 ARAP1Q96P48 1450 aa22.33■■□□□ 1.17
CSNK2B-206ENST00000468255 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CSNK2B-206ENST00000468255 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CSNK2B-206ENST00000468255 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CSNK2B-206ENST00000468255 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CSNK2B-206ENST00000468255 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.17■■□□□ 1.14
CSNK2B-206ENST00000468255 MAP3K1Q13233 1512 aa22.17■■□□□ 1.14
CSNK2B-206ENST00000468255 CUX2O14529 1486 aa22.14■■□□□ 1.14
CSNK2B-206ENST00000468255 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.14■■□□□ 1.13
CSNK2B-206ENST00000468255 NEUROD1Q13562 356 aa22.12■■□□□ 1.13
CSNK2B-206ENST00000468255 IGF1RP08069 1367 aa22.08■■□□□ 1.13
CSNK2B-206ENST00000468255 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CSNK2B-206ENST00000468255 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CSNK2B-206ENST00000468255 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.02■■□□□ 1.12
CSNK2B-206ENST00000468255 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.02■■□□□ 1.12
CSNK2B-206ENST00000468255 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
CSNK2B-206ENST00000468255 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.01■■□□□ 1.11
CSNK2B-206ENST00000468255 TIAM1Q13009 1591 aa21.99■■□□□ 1.11
CSNK2B-206ENST00000468255 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
CSNK2B-206ENST00000468255 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.95■■□□□ 1.1
CSNK2B-206ENST00000468255 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK2B-206ENST00000468255 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.92■■□□□ 1.1
CSNK2B-206ENST00000468255 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.9■■□□□ 1.1
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.9■■□□□ 1.1
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