RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464570.1

MIB2-205, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-205ENST00000464570 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.05■■■■■ 6.88
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MIB2-205ENST00000464570 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.38■■■■■ 5.5
MIB2-205ENST00000464570 NACADO15069 1562 aa49.08■■■■■ 5.45
MIB2-205ENST00000464570 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.86■■■■■ 5.41
MIB2-205ENST00000464570 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.46■■■■■ 5.35
MIB2-205ENST00000464570 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.33■■■■■ 5.33
MIB2-205ENST00000464570 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
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MIB2-205ENST00000464570 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.84■■■■■ 5.25
MIB2-205ENST00000464570 SCRIBQ14160 1630 aa47.45■■■■■ 5.19
MIB2-205ENST00000464570 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.29■■■■■ 5.16
MIB2-205ENST00000464570 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.72■■■■■ 5.07
MIB2-205ENST00000464570 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
MIB2-205ENST00000464570 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
MIB2-205ENST00000464570 SMARCA4P51532 1647 aa45.27■■■■■ 4.84
MIB2-205ENST00000464570 NCAPD3P42695 1498 aa45.23■■■■■ 4.83
MIB2-205ENST00000464570 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.16■■■■■ 4.82
MIB2-205ENST00000464570 SMARCA2P51531 1590 aa45.13■■■■■ 4.82
MIB2-205ENST00000464570 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
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MIB2-205ENST00000464570 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.79■■■■■ 4.76
MIB2-205ENST00000464570 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.72■■■■■ 4.75
MIB2-205ENST00000464570 ERCC6Q03468 1493 aa44.65■■■■■ 4.74
MIB2-205ENST00000464570 NESP48681 1621 aa44.45■■■■■ 4.71
MIB2-205ENST00000464570 CUX2O14529 1486 aa44.41■■■■■ 4.7
MIB2-205ENST00000464570 WIZO95785 1651 aa44.27■■■■■ 4.68
MIB2-205ENST00000464570 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.26■■■■■ 4.68
MIB2-205ENST00000464570 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.01■■■■■ 4.64
MIB2-205ENST00000464570 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
MIB2-205ENST00000464570 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.96■■■■■ 4.63
MIB2-205ENST00000464570 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.91■■■■■ 4.62
MIB2-205ENST00000464570 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.88■■■■■ 4.61
MIB2-205ENST00000464570 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.61
MIB2-205ENST00000464570 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
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MIB2-205ENST00000464570 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.48■■■■■ 4.55
MIB2-205ENST00000464570 WDR62O43379 1518 aa43.46■■■■■ 4.55
MIB2-205ENST00000464570 CFTRP13569 1480 aa43.45■■■■■ 4.55
MIB2-205ENST00000464570 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.43■■■■■ 4.54
MIB2-205ENST00000464570 PRDM2Q13029 1718 aa43.27■■■■■ 4.52
MIB2-205ENST00000464570 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.16■■■■■ 4.5
MIB2-205ENST00000464570 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
MIB2-205ENST00000464570 TOPBP1Q92547 1522 aa42.64■■■■■ 4.42
MIB2-205ENST00000464570 ABCC8Q09428 1581 aa42.6■■■■■ 4.41
MIB2-205ENST00000464570 IFT140Q96RY7 1462 aa42.58■■■■■ 4.41
MIB2-205ENST00000464570 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.56■■■■■ 4.4
MIB2-205ENST00000464570 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
MIB2-205ENST00000464570 OSCARQ8IYS5 282 aa42.38■■■■■ 4.37
MIB2-205ENST00000464570 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
MIB2-205ENST00000464570 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
MIB2-205ENST00000464570 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
MIB2-205ENST00000464570 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
MIB2-205ENST00000464570 TRIM41Q8WV44 630 aa42.21■■■■■ 4.35
MIB2-205ENST00000464570 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.08■■■■■ 4.338e-10■■■■□ 21.9
MIB2-205ENST00000464570 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.04■■■■■ 4.32
MIB2-205ENST00000464570 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.02■■■■■ 4.32
MIB2-205ENST00000464570 SOGA1O94964 1423 aa42.02■■■■■ 4.32
MIB2-205ENST00000464570 CUX1P39880 1505 aa42.01■■■■■ 4.32
MIB2-205ENST00000464570 CHD1O14646 1710 aa42■■■■■ 4.31
MIB2-205ENST00000464570 WDR97A6NE52 1622 aa41.91■■■■■ 4.3
MIB2-205ENST00000464570 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
MIB2-205ENST00000464570 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
MIB2-205ENST00000464570 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
MIB2-205ENST00000464570 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
MIB2-205ENST00000464570 FBLN2P98095 1184 aa41.79■■■■■ 4.28
MIB2-205ENST00000464570 ARHGEF11O15085 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
MIB2-205ENST00000464570 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.72■■■■■ 4.27
MIB2-205ENST00000464570 GRIN2BQ13224 1484 aa41.65■■■■■ 4.26
MIB2-205ENST00000464570 PBRM1Q86U86 1689 aa41.64■■■■■ 4.26
MIB2-205ENST00000464570 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
MIB2-205ENST00000464570 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.54■■■■■ 4.24
MIB2-205ENST00000464570 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.54■■■■■ 4.24
MIB2-205ENST00000464570 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
MIB2-205ENST00000464570 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.51■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.51■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 SYNJ1O43426 1573 aa41.49■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 TOP2BQ02880 1626 aa41.47■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 SYNJ2O15056 1496 aa41.47■■■■■ 4.23
MIB2-205ENST00000464570 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.23
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MIB2-205ENST00000464570 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.37■■■■■ 4.21
MIB2-205ENST00000464570 ARAP1Q96P48 1450 aa41.34■■■■■ 4.21
MIB2-205ENST00000464570 ADAMTS12P58397 1594 aa41.18■■■■■ 4.18
MIB2-205ENST00000464570 GRIN2AQ12879 1464 aa41.11■■■■■ 4.17
MIB2-205ENST00000464570 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
MIB2-205ENST00000464570 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.01■■■■■ 4.16
MIB2-205ENST00000464570 CEP170Q5SW79 1584 aa40.97■■■■■ 4.15
MIB2-205ENST00000464570 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
MIB2-205ENST00000464570 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
MIB2-205ENST00000464570 SHROOM2Q13796 1616 aa40.77■■■■■ 4.12
MIB2-205ENST00000464570 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.77■■■■■ 4.12
MIB2-205ENST00000464570 KIF27Q86VH2 1401 aa40.65■■■■■ 4.1
MIB2-205ENST00000464570 CUL7Q14999 1698 aa40.6■■■■■ 4.09
MIB2-205ENST00000464570 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.6■■■■■ 4.09
MIB2-205ENST00000464570 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
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