RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445811.5

PRPF31-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 31, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF31, Length 928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31-205ENST00000445811 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.02■■■■■ 4.96
PRPF31-205ENST00000445811 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.36■■■■■ 4.21
PRPF31-205ENST00000445811 ABCC9O60706 1549 aa41.13■■■■■ 4.18
PRPF31-205ENST00000445811 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.25■■■■□ 3.87
PRPF31-205ENST00000445811 NACADO15069 1562 aa38.98■■■■□ 3.83
PRPF31-205ENST00000445811 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.7■■■■□ 3.79
PRPF31-205ENST00000445811 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.52■■■■□ 3.76
PRPF31-205ENST00000445811 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.44■■■■□ 3.74
PRPF31-205ENST00000445811 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.37■■■■□ 3.73
PRPF31-205ENST00000445811 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.71
PRPF31-205ENST00000445811 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
PRPF31-205ENST00000445811 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.1■■■■□ 3.69
PRPF31-205ENST00000445811 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.02■■■■□ 3.68
PRPF31-205ENST00000445811 SCRIBQ14160 1630 aa37.68■■■■□ 3.62
PRPF31-205ENST00000445811 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.56■■■■□ 3.6
PRPF31-205ENST00000445811 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.21■■■■□ 3.55
PRPF31-205ENST00000445811 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PRPF31-205ENST00000445811 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.02■■■■□ 3.52
PRPF31-205ENST00000445811 SMARCA4P51532 1647 aa35.94■■■■□ 3.34
PRPF31-205ENST00000445811 NCAPD3P42695 1498 aa35.92■■■■□ 3.34
PRPF31-205ENST00000445811 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.86■■■■□ 3.33
PRPF31-205ENST00000445811 SMARCA2P51531 1590 aa35.8■■■■□ 3.32
PRPF31-205ENST00000445811 HMGXB3Q12766 1538 aa35.75■■■■□ 3.31
PRPF31-205ENST00000445811 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
PRPF31-205ENST00000445811 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.55■■■■□ 3.28
PRPF31-205ENST00000445811 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PRPF31-205ENST00000445811 ERCC6Q03468 1493 aa35.5■■■■□ 3.27
PRPF31-205ENST00000445811 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.47■■■■□ 3.27
PRPF31-205ENST00000445811 CUX2O14529 1486 aa35.39■■■■□ 3.26
PRPF31-205ENST00000445811 NESP48681 1621 aa35.38■■■■□ 3.25
PRPF31-205ENST00000445811 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.18■■■■□ 3.22
PRPF31-205ENST00000445811 WIZO95785 1651 aa35.13■■■■□ 3.21
PRPF31-205ENST00000445811 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.11■■■■□ 3.21
PRPF31-205ENST00000445811 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
PRPF31-205ENST00000445811 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
PRPF31-205ENST00000445811 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.89■■■■□ 3.18
PRPF31-205ENST00000445811 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.82■■■■□ 3.16
PRPF31-205ENST00000445811 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
PRPF31-205ENST00000445811 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
PRPF31-205ENST00000445811 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.63■■■■□ 3.13
PRPF31-205ENST00000445811 WDR62O43379 1518 aa34.56■■■■□ 3.12
PRPF31-205ENST00000445811 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.53■■■■□ 3.12
PRPF31-205ENST00000445811 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.49■■■■□ 3.11
PRPF31-205ENST00000445811 CFTRP13569 1480 aa34.48■■■■□ 3.11
PRPF31-205ENST00000445811 PRDM2Q13029 1718 aa34.39■■■■□ 3.1
PRPF31-205ENST00000445811 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
PRPF31-205ENST00000445811 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.2■■■■□ 3.06
PRPF31-205ENST00000445811 TOPBP1Q92547 1522 aa33.86■■■■□ 3.01
PRPF31-205ENST00000445811 IFT140Q96RY7 1462 aa33.8■■■■□ 3
PRPF31-205ENST00000445811 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.78■■■■□ 3
PRPF31-205ENST00000445811 ABCC8Q09428 1581 aa33.77■■■■□ 3
PRPF31-205ENST00000445811 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
PRPF31-205ENST00000445811 OSCARQ8IYS5 282 aa33.69■■■□□ 2.98
PRPF31-205ENST00000445811 TRIM41Q8WV44 630 aa33.69■■■□□ 2.98
PRPF31-205ENST00000445811 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
PRPF31-205ENST00000445811 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PRPF31-205ENST00000445811 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
PRPF31-205ENST00000445811 CHD1O14646 1710 aa33.45■■■□□ 2.95
PRPF31-205ENST00000445811 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.945e-9■■■■□ 19.6
PRPF31-205ENST00000445811 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.42■■■□□ 2.94
PRPF31-205ENST00000445811 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.42■■■□□ 2.94
PRPF31-205ENST00000445811 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.42■■■□□ 2.94
PRPF31-205ENST00000445811 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.37■■■□□ 2.93
PRPF31-205ENST00000445811 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.34■■■□□ 2.93
PRPF31-205ENST00000445811 CUX1P39880 1505 aa33.33■■■□□ 2.93
PRPF31-205ENST00000445811 SOGA1O94964 1423 aa33.31■■■□□ 2.92
PRPF31-205ENST00000445811 ARHGEF11O15085 1522 aa33.28■■■□□ 2.92
PRPF31-205ENST00000445811 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
PRPF31-205ENST00000445811 WDR97A6NE52 1622 aa33.26■■■□□ 2.91
PRPF31-205ENST00000445811 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
PRPF31-205ENST00000445811 FBLN2P98095 1184 aa33.16■■■□□ 2.9
PRPF31-205ENST00000445811 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.15■■■□□ 2.9
PRPF31-205ENST00000445811 PBRM1Q86U86 1689 aa33.1■■■□□ 2.89
PRPF31-205ENST00000445811 GRIN2BQ13224 1484 aa33.05■■■□□ 2.88
PRPF31-205ENST00000445811 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
PRPF31-205ENST00000445811 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.97■■■□□ 2.87
PRPF31-205ENST00000445811 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
PRPF31-205ENST00000445811 SYNJ1O43426 1573 aa32.96■■■□□ 2.87
PRPF31-205ENST00000445811 ARAP1Q96P48 1450 aa32.95■■■□□ 2.87
PRPF31-205ENST00000445811 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.94■■■□□ 2.86
PRPF31-205ENST00000445811 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.94■■■□□ 2.86
PRPF31-205ENST00000445811 SYNJ2O15056 1496 aa32.93■■■□□ 2.86
PRPF31-205ENST00000445811 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.92■■■□□ 2.86
PRPF31-205ENST00000445811 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
PRPF31-205ENST00000445811 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.91■■■□□ 2.86
PRPF31-205ENST00000445811 TOP2BQ02880 1626 aa32.86■■■□□ 2.85
PRPF31-205ENST00000445811 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
PRPF31-205ENST00000445811 ADAMTS12P58397 1594 aa32.7■■■□□ 2.83
PRPF31-205ENST00000445811 GRIN2AQ12879 1464 aa32.64■■■□□ 2.82
PRPF31-205ENST00000445811 CEP170Q5SW79 1584 aa32.57■■■□□ 2.8
PRPF31-205ENST00000445811 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.56■■■□□ 2.8
PRPF31-205ENST00000445811 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
PRPF31-205ENST00000445811 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.51■■■□□ 2.8
PRPF31-205ENST00000445811 NUP160Q12769 1436 aa32.5■■■□□ 2.79
PRPF31-205ENST00000445811 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.47■■■□□ 2.79
PRPF31-205ENST00000445811 SHROOM2Q13796 1616 aa32.43■■■□□ 2.78
PRPF31-205ENST00000445811 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.26■■■□□ 2.75
PRPF31-205ENST00000445811 CUL7Q14999 1698 aa32.18■■■□□ 2.74
PRPF31-205ENST00000445811 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
PRPF31-205ENST00000445811 KIF27Q86VH2 1401 aa32.14■■■□□ 2.74
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