RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440445.5

AFF3-211, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene AFF3, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3-211ENST00000440445 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.34■■■■■ 8.21
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AFF3-211ENST00000440445 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.19■■■■■ 6.59
AFF3-211ENST00000440445 NACADO15069 1562 aa55.96■■■■■ 6.55
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AFF3-211ENST00000440445 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.45■■■■■ 6.47
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AFF3-211ENST00000440445 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.92■■■■■ 6.38
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AFF3-211ENST00000440445 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.96■■■■■ 6.23
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AFF3-211ENST00000440445 NESP48681 1621 aa50.54■■■■■ 5.68
AFF3-211ENST00000440445 WIZO95785 1651 aa50.51■■■■■ 5.68
AFF3-211ENST00000440445 CUX2O14529 1486 aa50.41■■■■■ 5.66
AFF3-211ENST00000440445 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.4■■■■■ 5.66
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AFF3-211ENST00000440445 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.58■■■■■ 5.53
AFF3-211ENST00000440445 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.5■■■■■ 5.51
AFF3-211ENST00000440445 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.48■■■■■ 5.51
AFF3-211ENST00000440445 WDR62O43379 1518 aa49.47■■■■■ 5.51
AFF3-211ENST00000440445 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.33■■■■■ 5.49
AFF3-211ENST00000440445 PRDM2Q13029 1718 aa49.26■■■■■ 5.48
AFF3-211ENST00000440445 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.04■■■■■ 5.44
AFF3-211ENST00000440445 TOPBP1Q92547 1522 aa48.62■■■■■ 5.37
AFF3-211ENST00000440445 ABCC8Q09428 1581 aa48.61■■■■■ 5.37
AFF3-211ENST00000440445 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.52■■■■■ 5.36
AFF3-211ENST00000440445 IFT140Q96RY7 1462 aa48.49■■■■■ 5.35
AFF3-211ENST00000440445 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.31■■■■■ 5.32
AFF3-211ENST00000440445 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.3■■■■■ 5.32
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AFF3-211ENST00000440445 SOGA1O94964 1423 aa47.91■■■■■ 5.26
AFF3-211ENST00000440445 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.91■■■■■ 5.26
AFF3-211ENST00000440445 WDR97A6NE52 1622 aa47.81■■■■■ 5.24
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AFF3-211ENST00000440445 TRIM41Q8WV44 630 aa47.6■■■■■ 5.21
AFF3-211ENST00000440445 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.48■■■■■ 5.19
AFF3-211ENST00000440445 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.48■■■■■ 5.19
AFF3-211ENST00000440445 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.48■■■■■ 5.19
AFF3-211ENST00000440445 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.48■■■■■ 5.19
AFF3-211ENST00000440445 GRIN2BQ13224 1484 aa47.47■■■■■ 5.19
AFF3-211ENST00000440445 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
AFF3-211ENST00000440445 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.46■■■■■ 5.19
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AFF3-211ENST00000440445 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.42■■■■■ 5.18
AFF3-211ENST00000440445 TOP2BQ02880 1626 aa47.41■■■■■ 5.18
AFF3-211ENST00000440445 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.39■■■■■ 5.18
AFF3-211ENST00000440445 ARHGEF11O15085 1522 aa47.39■■■■■ 5.18
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AFF3-211ENST00000440445 PBRM1Q86U86 1689 aa47.35■■■■■ 5.17
AFF3-211ENST00000440445 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.35■■■■■ 5.17
AFF3-211ENST00000440445 SYNJ1O43426 1573 aa47.32■■■■■ 5.17
AFF3-211ENST00000440445 SYNJ2O15056 1496 aa47.26■■■■■ 5.16
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AFF3-211ENST00000440445 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.8■■■■■ 5.08
AFF3-211ENST00000440445 NUP160Q12769 1436 aa46.71■■■■■ 5.07
AFF3-211ENST00000440445 CEP170Q5SW79 1584 aa46.66■■■■■ 5.06
AFF3-211ENST00000440445 SHROOM2Q13796 1616 aa46.47■■■■■ 5.03
AFF3-211ENST00000440445 KIF27Q86VH2 1401 aa46.47■■■■■ 5.03
AFF3-211ENST00000440445 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.38■■■■■ 5.01
AFF3-211ENST00000440445 IGF1RP08069 1367 aa46.35■■■■■ 5.01
AFF3-211ENST00000440445 CUL7Q14999 1698 aa46.33■■■■■ 5.01
AFF3-211ENST00000440445 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.27■■■■■ 5
AFF3-211ENST00000440445 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
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