RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433924.5

SLC20A1-204, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 4

Gene SLC20A1, Length 638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-204ENST00000433924 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.1■■■□□ 2.57
SLC20A1-204ENST00000433924 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28■■■□□ 2.07
SLC20A1-204ENST00000433924 ABCC9O60706 1549 aa27.68■■■□□ 2.02
SLC20A1-204ENST00000433924 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC20A1-204ENST00000433924 NACADO15069 1562 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC20A1-204ENST00000433924 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC20A1-204ENST00000433924 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC20A1-204ENST00000433924 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC20A1-204ENST00000433924 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SLC20A1-204ENST00000433924 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
SLC20A1-204ENST00000433924 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.68■■□□□ 1.7
SLC20A1-204ENST00000433924 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.65■■□□□ 1.7
SLC20A1-204ENST00000433924 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC20A1-204ENST00000433924 SCRIBQ14160 1630 aa25.52■■□□□ 1.68
SLC20A1-204ENST00000433924 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC20A1-204ENST00000433924 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC20A1-204ENST00000433924 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC20A1-204ENST00000433924 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC20A1-204ENST00000433924 SMARCA4P51532 1647 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC20A1-204ENST00000433924 SMARCA2P51531 1590 aa24.2■■□□□ 1.47
SLC20A1-204ENST00000433924 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SLC20A1-204ENST00000433924 NCAPD3P42695 1498 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC20A1-204ENST00000433924 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC20A1-204ENST00000433924 HMGXB3Q12766 1538 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC20A1-204ENST00000433924 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SLC20A1-204ENST00000433924 PEG3Q9GZU2 1588 aa24■■□□□ 1.43
SLC20A1-204ENST00000433924 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.98■■□□□ 1.43
SLC20A1-204ENST00000433924 ERCC6Q03468 1493 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC20A1-204ENST00000433924 NESP48681 1621 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC20A1-204ENST00000433924 WIZO95785 1651 aa23.81■■□□□ 1.4
SLC20A1-204ENST00000433924 CUX2O14529 1486 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC20A1-204ENST00000433924 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC20A1-204ENST00000433924 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.7■■□□□ 1.39
SLC20A1-204ENST00000433924 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SLC20A1-204ENST00000433924 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC20A1-204ENST00000433924 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SLC20A1-204ENST00000433924 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SLC20A1-204ENST00000433924 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC20A1-204ENST00000433924 PRDM2Q13029 1718 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC20A1-204ENST00000433924 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC20A1-204ENST00000433924 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.35■■□□□ 1.33
SLC20A1-204ENST00000433924 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC20A1-204ENST00000433924 WDR62O43379 1518 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC20A1-204ENST00000433924 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC20A1-204ENST00000433924 CFTRP13569 1480 aa23.25■■□□□ 1.31
SLC20A1-204ENST00000433924 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.12■■□□□ 1.29
SLC20A1-204ENST00000433924 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SLC20A1-204ENST00000433924 TOPBP1Q92547 1522 aa22.86■■□□□ 1.25
SLC20A1-204ENST00000433924 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.85■■□□□ 1.25
SLC20A1-204ENST00000433924 ABCC8Q09428 1581 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC20A1-204ENST00000433924 IFT140Q96RY7 1462 aa22.79■■□□□ 1.24
SLC20A1-204ENST00000433924 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SLC20A1-204ENST00000433924 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SLC20A1-204ENST00000433924 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC20A1-204ENST00000433924 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC20A1-204ENST00000433924 CHD1O14646 1710 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC20A1-204ENST00000433924 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC20A1-204ENST00000433924 OSCARQ8IYS5 282 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC20A1-204ENST00000433924 TRIM41Q8WV44 630 aa22.58■■□□□ 1.21
SLC20A1-204ENST00000433924 CUX1P39880 1505 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC20A1-204ENST00000433924 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC20A1-204ENST00000433924 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.26e-8■■■■□ 23.2
SLC20A1-204ENST00000433924 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC20A1-204ENST00000433924 WDR97A6NE52 1622 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC20A1-204ENST00000433924 SOGA1O94964 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC20A1-204ENST00000433924 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC20A1-204ENST00000433924 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC20A1-204ENST00000433924 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC20A1-204ENST00000433924 PBRM1Q86U86 1689 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC20A1-204ENST00000433924 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SLC20A1-204ENST00000433924 FBLN2P98095 1184 aa22.38■■□□□ 1.17
SLC20A1-204ENST00000433924 ARHGEF11O15085 1522 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC20A1-204ENST00000433924 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC20A1-204ENST00000433924 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.33■■□□□ 1.17
SLC20A1-204ENST00000433924 GRIN2BQ13224 1484 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC20A1-204ENST00000433924 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SLC20A1-204ENST00000433924 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC20A1-204ENST00000433924 TOP2BQ02880 1626 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC20A1-204ENST00000433924 SYNJ1O43426 1573 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC20A1-204ENST00000433924 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC20A1-204ENST00000433924 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC20A1-204ENST00000433924 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
SLC20A1-204ENST00000433924 SYNJ2O15056 1496 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC20A1-204ENST00000433924 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC20A1-204ENST00000433924 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SLC20A1-204ENST00000433924 ADAMTS12P58397 1594 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC20A1-204ENST00000433924 ARAP1Q96P48 1450 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC20A1-204ENST00000433924 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC20A1-204ENST00000433924 GRIN2AQ12879 1464 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC20A1-204ENST00000433924 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC20A1-204ENST00000433924 CEP170Q5SW79 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
SLC20A1-204ENST00000433924 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC20A1-204ENST00000433924 NUP160Q12769 1436 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC20A1-204ENST00000433924 SHROOM2Q13796 1616 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC20A1-204ENST00000433924 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC20A1-204ENST00000433924 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC20A1-204ENST00000433924 CUL7Q14999 1698 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC20A1-204ENST00000433924 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC20A1-204ENST00000433924 KIF27Q86VH2 1401 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC20A1-204ENST00000433924 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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