RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425336.1

C21orf59-204, Transcript of UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

TSL 2

Gene C21orf59, Length 873 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59-204ENST00000425336 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.05■■■■□ 3.04
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C21orf59-204ENST00000425336 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.29■■■□□ 2.28
C21orf59-204ENST00000425336 NACADO15069 1562 aa29.08■■■□□ 2.25
C21orf59-204ENST00000425336 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.91■■■□□ 2.22
C21orf59-204ENST00000425336 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.81■■■□□ 2.2
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C21orf59-204ENST00000425336 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.53■■■□□ 2.16
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C21orf59-204ENST00000425336 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.06■■■□□ 2.08
C21orf59-204ENST00000425336 SCRIBQ14160 1630 aa28.02■■■□□ 2.08
C21orf59-204ENST00000425336 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.01■■■□□ 2.07
C21orf59-204ENST00000425336 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.95■■■□□ 2.06
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C21orf59-204ENST00000425336 CUX2O14529 1486 aa26.81■■□□□ 1.88
C21orf59-204ENST00000425336 ERCC6Q03468 1493 aa26.8■■□□□ 1.88
C21orf59-204ENST00000425336 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.73■■□□□ 1.87
C21orf59-204ENST00000425336 SMARCA4P51532 1647 aa26.67■■□□□ 1.86
C21orf59-204ENST00000425336 SMARCA2P51531 1590 aa26.65■■□□□ 1.86
C21orf59-204ENST00000425336 HMGXB3Q12766 1538 aa26.63■■□□□ 1.85
C21orf59-204ENST00000425336 NESP48681 1621 aa26.56■■□□□ 1.84
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C21orf59-204ENST00000425336 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.37■■□□□ 1.81
C21orf59-204ENST00000425336 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
C21orf59-204ENST00000425336 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.3■■□□□ 1.8
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C21orf59-204ENST00000425336 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.26■■□□□ 1.79
C21orf59-204ENST00000425336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.14■■□□□ 1.77
C21orf59-204ENST00000425336 CADPSQ9ULU8 1353 aa26■■□□□ 1.75
C21orf59-204ENST00000425336 WIZO95785 1651 aa25.97■■□□□ 1.75
C21orf59-204ENST00000425336 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.96■■□□□ 1.75
C21orf59-204ENST00000425336 WDR62O43379 1518 aa25.91■■□□□ 1.74
C21orf59-204ENST00000425336 TRIM41Q8WV44 630 aa25.86■■□□□ 1.73
C21orf59-204ENST00000425336 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.8■■□□□ 1.72
C21orf59-204ENST00000425336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.74■■□□□ 1.71
C21orf59-204ENST00000425336 CFTRP13569 1480 aa25.65■■□□□ 1.7
C21orf59-204ENST00000425336 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
C21orf59-204ENST00000425336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
C21orf59-204ENST00000425336 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
C21orf59-204ENST00000425336 OSCARQ8IYS5 282 aa25.51■■□□□ 1.67
C21orf59-204ENST00000425336 PRDM2Q13029 1718 aa25.49■■□□□ 1.67
C21orf59-204ENST00000425336 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
C21orf59-204ENST00000425336 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.28■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 IFT140Q96RY7 1462 aa25.28■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 TOPBP1Q92547 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
C21orf59-204ENST00000425336 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
C21orf59-204ENST00000425336 ARHGEF11O15085 1522 aa25.16■■□□□ 1.62
C21orf59-204ENST00000425336 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.12■■□□□ 1.61
C21orf59-204ENST00000425336 ABCC8Q09428 1581 aa25.11■■□□□ 1.61
C21orf59-204ENST00000425336 CHD1O14646 1710 aa25.08■■□□□ 1.61
C21orf59-204ENST00000425336 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
C21orf59-204ENST00000425336 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.65e-12■■□□□ 13.3
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C21orf59-204ENST00000425336 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
C21orf59-204ENST00000425336 FBLN2P98095 1184 aa24.92■■□□□ 1.58
C21orf59-204ENST00000425336 ARAP1Q96P48 1450 aa24.89■■□□□ 1.57
C21orf59-204ENST00000425336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.88■■□□□ 1.57
C21orf59-204ENST00000425336 SOGA1O94964 1423 aa24.81■■□□□ 1.56
C21orf59-204ENST00000425336 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
C21orf59-204ENST00000425336 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
C21orf59-204ENST00000425336 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.77■■□□□ 1.56
C21orf59-204ENST00000425336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.77■■□□□ 1.56
C21orf59-204ENST00000425336 WDR97A6NE52 1622 aa24.73■■□□□ 1.55
C21orf59-204ENST00000425336 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
C21orf59-204ENST00000425336 CUX1P39880 1505 aa24.7■■□□□ 1.54
C21orf59-204ENST00000425336 SYNJ1O43426 1573 aa24.68■■□□□ 1.54
C21orf59-204ENST00000425336 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
C21orf59-204ENST00000425336 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
C21orf59-204ENST00000425336 GRIN2BQ13224 1484 aa24.64■■□□□ 1.53
C21orf59-204ENST00000425336 PBRM1Q86U86 1689 aa24.61■■□□□ 1.53
C21orf59-204ENST00000425336 SYNJ2O15056 1496 aa24.59■■□□□ 1.53
C21orf59-204ENST00000425336 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.52■■□□□ 1.52
C21orf59-204ENST00000425336 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.46■■□□□ 1.51
C21orf59-204ENST00000425336 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.44■■□□□ 1.5
C21orf59-204ENST00000425336 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.33■■□□□ 1.49
C21orf59-204ENST00000425336 GRIN2AQ12879 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
C21orf59-204ENST00000425336 ADAMTS12P58397 1594 aa24.31■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 CEP170Q5SW79 1584 aa24.29■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.24■■□□□ 1.47
C21orf59-204ENST00000425336 NUP160Q12769 1436 aa24.24■■□□□ 1.47
C21orf59-204ENST00000425336 TOP2BQ02880 1626 aa24.22■■□□□ 1.47
C21orf59-204ENST00000425336 SHROOM2Q13796 1616 aa24.2■■□□□ 1.46
C21orf59-204ENST00000425336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
C21orf59-204ENST00000425336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.13■■□□□ 1.45
C21orf59-204ENST00000425336 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.1■■□□□ 1.45
C21orf59-204ENST00000425336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
C21orf59-204ENST00000425336 JPH4Q96JJ6 628 aa23.98■■□□□ 1.43
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