RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421752.1

NUP62CL-202, Transcript of nucleoporin 62 C-terminal like, humanhuman

TSL 2

Gene NUP62CL, Length 618 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CL-202ENST00000421752 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.45■■■■□ 3.1
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NUP62CL-202ENST00000421752 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.22■■■□□ 2.59
NUP62CL-202ENST00000421752 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.61■■■□□ 2.49
NUP62CL-202ENST00000421752 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.08■■■□□ 2.41
NUP62CL-202ENST00000421752 NACADO15069 1562 aa29.7■■■□□ 2.35
NUP62CL-202ENST00000421752 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
NUP62CL-202ENST00000421752 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.39■■■□□ 2.3
NUP62CL-202ENST00000421752 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.35■■■□□ 2.29
NUP62CL-202ENST00000421752 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.23■■■□□ 2.27
NUP62CL-202ENST00000421752 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.06■■■□□ 2.24
NUP62CL-202ENST00000421752 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.85■■■□□ 2.21
NUP62CL-202ENST00000421752 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.82■■■□□ 2.2
NUP62CL-202ENST00000421752 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.79■■■□□ 2.2
NUP62CL-202ENST00000421752 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.65■■■□□ 2.18
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NUP62CL-202ENST00000421752 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.42■■■□□ 2.14
NUP62CL-202ENST00000421752 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
NUP62CL-202ENST00000421752 SCRIBQ14160 1630 aa28.4■■■□□ 2.14
NUP62CL-202ENST00000421752 CUX2O14529 1486 aa27.85■■■□□ 2.05
NUP62CL-202ENST00000421752 ERCC6Q03468 1493 aa27.64■■■□□ 2.01
NUP62CL-202ENST00000421752 NCAPD3P42695 1498 aa27.44■■□□□ 1.98
NUP62CL-202ENST00000421752 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.25■■□□□ 1.95
NUP62CL-202ENST00000421752 NESP48681 1621 aa27.23■■□□□ 1.95
NUP62CL-202ENST00000421752 HMGXB3Q12766 1538 aa27.16■■□□□ 1.94
NUP62CL-202ENST00000421752 SMARCA2P51531 1590 aa27.12■■□□□ 1.93
NUP62CL-202ENST00000421752 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NUP62CL-202ENST00000421752 TRIM41Q8WV44 630 aa27.08■■□□□ 1.93
NUP62CL-202ENST00000421752 SMARCA4P51532 1647 aa27.02■■□□□ 1.92
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NUP62CL-202ENST00000421752 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.93■■□□□ 1.9
NUP62CL-202ENST00000421752 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.85■■□□□ 1.89
NUP62CL-202ENST00000421752 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.81■■□□□ 1.88
NUP62CL-202ENST00000421752 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NUP62CL-202ENST00000421752 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.78■■□□□ 1.88
NUP62CL-202ENST00000421752 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.62■■□□□ 1.85
NUP62CL-202ENST00000421752 WDR62O43379 1518 aa26.58■■□□□ 1.85
NUP62CL-202ENST00000421752 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.57■■□□□ 1.84
NUP62CL-202ENST00000421752 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.53■■□□□ 1.84
NUP62CL-202ENST00000421752 OSCARQ8IYS5 282 aa26.43■■□□□ 1.82
NUP62CL-202ENST00000421752 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.36■■□□□ 1.81
NUP62CL-202ENST00000421752 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.27■■□□□ 1.8
NUP62CL-202ENST00000421752 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NUP62CL-202ENST00000421752 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NUP62CL-202ENST00000421752 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NUP62CL-202ENST00000421752 WIZO95785 1651 aa26.16■■□□□ 1.78
NUP62CL-202ENST00000421752 CFTRP13569 1480 aa26.11■■□□□ 1.77
NUP62CL-202ENST00000421752 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
NUP62CL-202ENST00000421752 ARHGEF11O15085 1522 aa26.04■■□□□ 1.76
NUP62CL-202ENST00000421752 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
NUP62CL-202ENST00000421752 IFT140Q96RY7 1462 aa25.86■■□□□ 1.73
NUP62CL-202ENST00000421752 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.86■■□□□ 1.73
NUP62CL-202ENST00000421752 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
NUP62CL-202ENST00000421752 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
NUP62CL-202ENST00000421752 PRDM2Q13029 1718 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP62CL-202ENST00000421752 ARAP1Q96P48 1450 aa25.72■■□□□ 1.71
NUP62CL-202ENST00000421752 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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NUP62CL-202ENST00000421752 TOPBP1Q92547 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
NUP62CL-202ENST00000421752 CHD1O14646 1710 aa25.64■■□□□ 1.7
NUP62CL-202ENST00000421752 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
NUP62CL-202ENST00000421752 ABCC8Q09428 1581 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP62CL-202ENST00000421752 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
NUP62CL-202ENST00000421752 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.52■■□□□ 1.68
NUP62CL-202ENST00000421752 FBLN2P98095 1184 aa25.52■■□□□ 1.68
NUP62CL-202ENST00000421752 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.51■■□□□ 1.67
NUP62CL-202ENST00000421752 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NUP62CL-202ENST00000421752 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
NUP62CL-202ENST00000421752 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.36■■□□□ 1.65
NUP62CL-202ENST00000421752 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.28■■□□□ 1.64
NUP62CL-202ENST00000421752 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.28■■□□□ 1.64
NUP62CL-202ENST00000421752 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NUP62CL-202ENST00000421752 SYNJ1O43426 1573 aa25.27■■□□□ 1.64
NUP62CL-202ENST00000421752 SOGA1O94964 1423 aa25.23■■□□□ 1.63
NUP62CL-202ENST00000421752 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NUP62CL-202ENST00000421752 WDR97A6NE52 1622 aa25.21■■□□□ 1.63
NUP62CL-202ENST00000421752 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NUP62CL-202ENST00000421752 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.14■■□□□ 1.61
NUP62CL-202ENST00000421752 SYNJ2O15056 1496 aa25.11■■□□□ 1.61
NUP62CL-202ENST00000421752 GRIN2BQ13224 1484 aa25.11■■□□□ 1.61
NUP62CL-202ENST00000421752 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.1■■□□□ 1.61
NUP62CL-202ENST00000421752 CUX1P39880 1505 aa24.96■■□□□ 1.59
NUP62CL-202ENST00000421752 PBRM1Q86U86 1689 aa24.94■■□□□ 1.58
NUP62CL-202ENST00000421752 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP62CL-202ENST00000421752 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.81■■□□□ 1.56
NUP62CL-202ENST00000421752 GRIN2AQ12879 1464 aa24.79■■□□□ 1.56
NUP62CL-202ENST00000421752 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.79■■□□□ 1.56
NUP62CL-202ENST00000421752 CEP170Q5SW79 1584 aa24.79■■□□□ 1.56
NUP62CL-202ENST00000421752 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.78■■□□□ 1.56
NUP62CL-202ENST00000421752 NUP160Q12769 1436 aa24.74■■□□□ 1.55
NUP62CL-202ENST00000421752 SHROOM2Q13796 1616 aa24.71■■□□□ 1.55
NUP62CL-202ENST00000421752 ADAMTS12P58397 1594 aa24.68■■□□□ 1.54
NUP62CL-202ENST00000421752 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
NUP62CL-202ENST00000421752 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.58■■□□□ 1.53
NUP62CL-202ENST00000421752 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.58■■□□□ 1.52
NUP62CL-202ENST00000421752 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.57■■□□□ 1.52
NUP62CL-202ENST00000421752 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.56■■□□□ 1.52
NUP62CL-202ENST00000421752 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
NUP62CL-202ENST00000421752 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
NUP62CL-202ENST00000421752 MAPKBP1O60336 1514 aa24.5■■□□□ 1.51
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