RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419542.3

PCBP1-AS1-214, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 1,309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SHROOM2Q13796 1616 aa23.84■■□□□ 1.41
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.69■■□□□ 1.38
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.5■■□□□ 1.35
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.25■■□□□ 1.31
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.18■■□□□ 1.3
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DIP2BQ9P265 1576 aa23.15■■□□□ 1.3
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.09■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TSPOAP1O95153 1857 aa23.07■■□□□ 1.28
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.05■■□□□ 1.28
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KCNH8Q96L42 1107 aa23.04■■□□□ 1.28
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.9■■□□□ 1.26
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CD109Q6YHK3 1445 aa22.86■■□□□ 1.25
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KDM6BO15054 1643 aa22.84■■□□□ 1.25
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HECW1Q76N89 1606 aa22.81■■□□□ 1.24
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.81■■□□□ 1.24
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.75■■□□□ 1.23
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.75■■□□□ 1.23
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CEP162Q5TB80 1403 aa22.73■■□□□ 1.23
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.73■■□□□ 1.23
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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PCBP1-AS1-214ENST00000419542 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.71■■□□□ 1.23
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.65■■□□□ 1.22
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.63■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.63■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KIF14Q15058 1648 aa22.58■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.57■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NEO1Q92859 1461 aa22.57■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.57■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FANCAO15360 1455 aa22.56■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RAPGEF3O95398 923 aa22.56■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PLCH2O75038 1416 aa22.53■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 AKNAQ7Z591 1439 aa22.52■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.51■■□□□ 1.19
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.49■■□□□ 1.19
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.49■■□□□ 1.19
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.46■■□□□ 1.19
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.45■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.45■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ADGRL1O94910 1474 aa22.43■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.42■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.41■■□□□ 1.18
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