RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419386.1

ARRDC1-202, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARRDC1, Length 829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-202ENST00000419386 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.53■■■■■ 6
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ARRDC1-202ENST00000419386 NACADO15069 1562 aa44.42■■■■■ 4.7
ARRDC1-202ENST00000419386 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.2■■■■■ 4.67
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ARRDC1-202ENST00000419386 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
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ARRDC1-202ENST00000419386 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.86■■■■■ 4.45
ARRDC1-202ENST00000419386 SCRIBQ14160 1630 aa42.77■■■■■ 4.44
ARRDC1-202ENST00000419386 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.62■■■■■ 4.41
ARRDC1-202ENST00000419386 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.55■■■■■ 4.4
ARRDC1-202ENST00000419386 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
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ARRDC1-202ENST00000419386 NCAPD3P42695 1498 aa41.02■■■■■ 4.16
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ARRDC1-202ENST00000419386 SMARCA4P51532 1647 aa40.84■■■■■ 4.13
ARRDC1-202ENST00000419386 ERCC6Q03468 1493 aa40.78■■■■■ 4.12
ARRDC1-202ENST00000419386 CUX2O14529 1486 aa40.77■■■■■ 4.12
ARRDC1-202ENST00000419386 SMARCA2P51531 1590 aa40.73■■■■■ 4.11
ARRDC1-202ENST00000419386 HMGXB3Q12766 1538 aa40.68■■■■■ 4.1
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ARRDC1-202ENST00000419386 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.77■■■■□ 3.96
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ARRDC1-202ENST00000419386 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.39■■■■□ 3.9
ARRDC1-202ENST00000419386 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.32■■■■□ 3.89
ARRDC1-202ENST00000419386 CFTRP13569 1480 aa39.27■■■■□ 3.88
ARRDC1-202ENST00000419386 TRIM41Q8WV44 630 aa39.21■■■■□ 3.87
ARRDC1-202ENST00000419386 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.13■■■■□ 3.85
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ARRDC1-202ENST00000419386 OSCARQ8IYS5 282 aa38.89■■■■□ 3.82
ARRDC1-202ENST00000419386 PRDM2Q13029 1718 aa38.81■■■■□ 3.8
ARRDC1-202ENST00000419386 IFT140Q96RY7 1462 aa38.6■■■■□ 3.77
ARRDC1-202ENST00000419386 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
ARRDC1-202ENST00000419386 TOPBP1Q92547 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
ARRDC1-202ENST00000419386 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
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ARRDC1-202ENST00000419386 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
ARRDC1-202ENST00000419386 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
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ARRDC1-202ENST00000419386 FBLN2P98095 1184 aa38.03■■■■□ 3.68
ARRDC1-202ENST00000419386 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.03■■■■□ 3.68
ARRDC1-202ENST00000419386 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.02■■■■□ 3.68
ARRDC1-202ENST00000419386 SOGA1O94964 1423 aa37.96■■■■□ 3.67
ARRDC1-202ENST00000419386 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.96■■■■□ 3.67
ARRDC1-202ENST00000419386 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
ARRDC1-202ENST00000419386 ARAP1Q96P48 1450 aa37.88■■■■□ 3.65
ARRDC1-202ENST00000419386 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.82■■■■□ 3.64
ARRDC1-202ENST00000419386 WDR97A6NE52 1622 aa37.78■■■■□ 3.64
ARRDC1-202ENST00000419386 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
ARRDC1-202ENST00000419386 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
ARRDC1-202ENST00000419386 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
ARRDC1-202ENST00000419386 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.67■■■■□ 3.62
ARRDC1-202ENST00000419386 GRIN2BQ13224 1484 aa37.66■■■■□ 3.62
ARRDC1-202ENST00000419386 SYNJ1O43426 1573 aa37.62■■■■□ 3.61
ARRDC1-202ENST00000419386 SYNJ2O15056 1496 aa37.56■■■■□ 3.6
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ARRDC1-202ENST00000419386 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.49■■■■□ 3.59
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ARRDC1-202ENST00000419386 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.43■■■■□ 3.58
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ARRDC1-202ENST00000419386 NUP160Q12769 1436 aa37.06■■■■□ 3.52
ARRDC1-202ENST00000419386 CEP170Q5SW79 1584 aa37.06■■■■□ 3.52
ARRDC1-202ENST00000419386 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.05■■■■□ 3.52
ARRDC1-202ENST00000419386 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.02■■■■□ 3.52
ARRDC1-202ENST00000419386 SHROOM2Q13796 1616 aa36.92■■■■□ 3.5
ARRDC1-202ENST00000419386 IGF1RP08069 1367 aa36.78■■■■□ 3.48
ARRDC1-202ENST00000419386 KIF27Q86VH2 1401 aa36.78■■■■□ 3.48
ARRDC1-202ENST00000419386 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
ARRDC1-202ENST00000419386 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
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