RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415600.6

PTPRU-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-203ENST00000415600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.37■■■■■ 5.65
PTPRU-203ENST00000415600 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.08■■■■■ 4.81
PTPRU-203ENST00000415600 ABCC9O60706 1549 aa44.7■■■■■ 4.75
PTPRU-203ENST00000415600 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.8■■■■■ 4.44
PTPRU-203ENST00000415600 NACADO15069 1562 aa42.6■■■■■ 4.41
PTPRU-203ENST00000415600 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.46■■■■■ 4.39
PTPRU-203ENST00000415600 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.13■■■■■ 4.34
PTPRU-203ENST00000415600 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
PTPRU-203ENST00000415600 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.69■■■■■ 4.26
PTPRU-203ENST00000415600 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
PTPRU-203ENST00000415600 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.62■■■■■ 4.25
PTPRU-203ENST00000415600 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.52■■■■■ 4.24
PTPRU-203ENST00000415600 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.36■■■■■ 4.21
PTPRU-203ENST00000415600 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.1■■■■■ 4.17
PTPRU-203ENST00000415600 SCRIBQ14160 1630 aa41.04■■■■■ 4.16
PTPRU-203ENST00000415600 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
PTPRU-203ENST00000415600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.4■■■■■ 4.06
PTPRU-203ENST00000415600 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.3■■■■■ 4.04
PTPRU-203ENST00000415600 NCAPD3P42695 1498 aa39.28■■■■□ 3.88
PTPRU-203ENST00000415600 SMARCA4P51532 1647 aa39.21■■■■□ 3.87
PTPRU-203ENST00000415600 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.18■■■■□ 3.86
PTPRU-203ENST00000415600 SMARCA2P51531 1590 aa39.18■■■■□ 3.86
PTPRU-203ENST00000415600 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
PTPRU-203ENST00000415600 HMGXB3Q12766 1538 aa39.03■■■■□ 3.84
PTPRU-203ENST00000415600 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
PTPRU-203ENST00000415600 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.85■■■■□ 3.81
PTPRU-203ENST00000415600 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.74■■■■□ 3.79
PTPRU-203ENST00000415600 ERCC6Q03468 1493 aa38.71■■■■□ 3.79
PTPRU-203ENST00000415600 CUX2O14529 1486 aa38.51■■■■□ 3.75
PTPRU-203ENST00000415600 NESP48681 1621 aa38.43■■■■□ 3.74
PTPRU-203ENST00000415600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.36■■■■□ 3.73
PTPRU-203ENST00000415600 WIZO95785 1651 aa38.28■■■■□ 3.72
PTPRU-203ENST00000415600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.21■■■■□ 3.71
PTPRU-203ENST00000415600 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.13■■■■□ 3.7
PTPRU-203ENST00000415600 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
PTPRU-203ENST00000415600 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.06■■■■□ 3.68
PTPRU-203ENST00000415600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
PTPRU-203ENST00000415600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.96■■■■□ 3.67
PTPRU-203ENST00000415600 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
PTPRU-203ENST00000415600 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.79■■■■□ 3.64
PTPRU-203ENST00000415600 CFTRP13569 1480 aa37.74■■■■□ 3.63
PTPRU-203ENST00000415600 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.72■■■■□ 3.63
PTPRU-203ENST00000415600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPRU-203ENST00000415600 WDR62O43379 1518 aa37.64■■■■□ 3.62
PTPRU-203ENST00000415600 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.46■■■■□ 3.59
PTPRU-203ENST00000415600 PRDM2Q13029 1718 aa37.34■■■■□ 3.57
PTPRU-203ENST00000415600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
PTPRU-203ENST00000415600 ABCC8Q09428 1581 aa37.06■■■■□ 3.52
PTPRU-203ENST00000415600 IFT140Q96RY7 1462 aa36.97■■■■□ 3.51
PTPRU-203ENST00000415600 TOPBP1Q92547 1522 aa36.97■■■■□ 3.51
PTPRU-203ENST00000415600 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.89■■■■□ 3.5
PTPRU-203ENST00000415600 OSCARQ8IYS5 282 aa36.84■■■■□ 3.49
PTPRU-203ENST00000415600 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
PTPRU-203ENST00000415600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
PTPRU-203ENST00000415600 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
PTPRU-203ENST00000415600 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PTPRU-203ENST00000415600 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
PTPRU-203ENST00000415600 TRIM41Q8WV44 630 aa36.53■■■■□ 3.44
PTPRU-203ENST00000415600 SOGA1O94964 1423 aa36.51■■■■□ 3.43
PTPRU-203ENST00000415600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
PTPRU-203ENST00000415600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.43■■■■□ 3.42
PTPRU-203ENST00000415600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.42■■■■□ 3.42
PTPRU-203ENST00000415600 CUX1P39880 1505 aa36.4■■■■□ 3.42
PTPRU-203ENST00000415600 WDR97A6NE52 1622 aa36.38■■■■□ 3.41
PTPRU-203ENST00000415600 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PTPRU-203ENST00000415600 FBLN2P98095 1184 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPRU-203ENST00000415600 CHD1O14646 1710 aa36.21■■■■□ 3.39
PTPRU-203ENST00000415600 GRIN2BQ13224 1484 aa36.17■■■■□ 3.38
PTPRU-203ENST00000415600 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.17■■■■□ 3.38
PTPRU-203ENST00000415600 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.17■■■■□ 3.38
PTPRU-203ENST00000415600 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.17■■■■□ 3.38
PTPRU-203ENST00000415600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.15■■■■□ 3.38
PTPRU-203ENST00000415600 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
PTPRU-203ENST00000415600 ARHGEF11O15085 1522 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPRU-203ENST00000415600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
PTPRU-203ENST00000415600 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.07■■■■□ 3.37
PTPRU-203ENST00000415600 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.07■■■■□ 3.36
PTPRU-203ENST00000415600 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
PTPRU-203ENST00000415600 SYNJ2O15056 1496 aa36■■■■□ 3.35
PTPRU-203ENST00000415600 SYNJ1O43426 1573 aa35.96■■■■□ 3.35
PTPRU-203ENST00000415600 TOP2BQ02880 1626 aa35.96■■■■□ 3.35
PTPRU-203ENST00000415600 PBRM1Q86U86 1689 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPRU-203ENST00000415600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.93■■■■□ 3.34
PTPRU-203ENST00000415600 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.92■■■■□ 3.34
PTPRU-203ENST00000415600 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.9■■■■□ 3.34
PTPRU-203ENST00000415600 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.84■■■■□ 3.33
PTPRU-203ENST00000415600 ARAP1Q96P48 1450 aa35.76■■■■□ 3.32
PTPRU-203ENST00000415600 GRIN2AQ12879 1464 aa35.66■■■■□ 3.3
PTPRU-203ENST00000415600 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.65■■■■□ 3.3
PTPRU-203ENST00000415600 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.65■■■■□ 3.3
PTPRU-203ENST00000415600 ADAMTS12P58397 1594 aa35.65■■■■□ 3.3
PTPRU-203ENST00000415600 NUP160Q12769 1436 aa35.52■■■■□ 3.28
PTPRU-203ENST00000415600 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
PTPRU-203ENST00000415600 CEP170Q5SW79 1584 aa35.44■■■■□ 3.26
PTPRU-203ENST00000415600 KIF27Q86VH2 1401 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPRU-203ENST00000415600 SHROOM2Q13796 1616 aa35.28■■■■□ 3.24
PTPRU-203ENST00000415600 IGF1RP08069 1367 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRU-203ENST00000415600 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.21■■■■□ 3.23
PTPRU-203ENST00000415600 JPH4Q96JJ6 628 aa35.21■■■■□ 3.23
PTPRU-203ENST00000415600 CUL7Q14999 1698 aa35.2■■■■□ 3.23
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