RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

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Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.72■■■■□ 3.47
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.68■■■□□ 2.82
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCC9O60706 1549 aa31.46■■■□□ 2.63
ACTBP8-201ENST00000403258 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
ACTBP8-201ENST00000403258 NACADO15069 1562 aa30.56■■■□□ 2.48
ACTBP8-201ENST00000403258 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.53■■■□□ 2.48
ACTBP8-201ENST00000403258 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.52■■■□□ 2.48
ACTBP8-201ENST00000403258 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.48■■■□□ 2.47
ACTBP8-201ENST00000403258 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.32■■■□□ 2.44
ACTBP8-201ENST00000403258 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.93■■■□□ 2.38
ACTBP8-201ENST00000403258 SCRIBQ14160 1630 aa29.69■■■□□ 2.34
ACTBP8-201ENST00000403258 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.56■■■□□ 2.32
ACTBP8-201ENST00000403258 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.36■■■□□ 2.29
ACTBP8-201ENST00000403258 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
ACTBP8-201ENST00000403258 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
ACTBP8-201ENST00000403258 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.57■■■□□ 2.16
ACTBP8-201ENST00000403258 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.51■■■□□ 2.15
ACTBP8-201ENST00000403258 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.49■■■□□ 2.15
ACTBP8-201ENST00000403258 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
ACTBP8-201ENST00000403258 SMARCA4P51532 1647 aa28.48■■■□□ 2.15
ACTBP8-201ENST00000403258 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.28■■■□□ 2.12
ACTBP8-201ENST00000403258 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTBP8-201ENST00000403258 SMARCA2P51531 1590 aa28.23■■■□□ 2.11
ACTBP8-201ENST00000403258 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.18■■■□□ 2.1
ACTBP8-201ENST00000403258 NCAPD3P42695 1498 aa28.14■■■□□ 2.09
ACTBP8-201ENST00000403258 HMGXB3Q12766 1538 aa28.11■■■□□ 2.09
ACTBP8-201ENST00000403258 WIZO95785 1651 aa28.03■■■□□ 2.08
ACTBP8-201ENST00000403258 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
ACTBP8-201ENST00000403258 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
ACTBP8-201ENST00000403258 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
ACTBP8-201ENST00000403258 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTBP8-201ENST00000403258 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.36■■□□□ 1.97
ACTBP8-201ENST00000403258 NESP48681 1621 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTBP8-201ENST00000403258 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.28■■□□□ 1.96
ACTBP8-201ENST00000403258 PRDM2Q13029 1718 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTBP8-201ENST00000403258 CFTRP13569 1480 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.14■■□□□ 1.94
ACTBP8-201ENST00000403258 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.13■■□□□ 1.93
ACTBP8-201ENST00000403258 ERCC6Q03468 1493 aa27.11■■□□□ 1.93
ACTBP8-201ENST00000403258 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27■■□□□ 1.91
ACTBP8-201ENST00000403258 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
ACTBP8-201ENST00000403258 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTBP8-201ENST00000403258 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTBP8-201ENST00000403258 WDR62O43379 1518 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTBP8-201ENST00000403258 CUX2O14529 1486 aa26.8■■□□□ 1.88
ACTBP8-201ENST00000403258 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCC8Q09428 1581 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTBP8-201ENST00000403258 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTBP8-201ENST00000403258 TOPBP1Q92547 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTBP8-201ENST00000403258 CUX1P39880 1505 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTBP8-201ENST00000403258 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTBP8-201ENST00000403258 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
ACTBP8-201ENST00000403258 TOP2BQ02880 1626 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTBP8-201ENST00000403258 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ACTBP8-201ENST00000403258 SYNJ1O43426 1573 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTBP8-201ENST00000403258 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTBP8-201ENST00000403258 IFT140Q96RY7 1462 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTBP8-201ENST00000403258 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ACTBP8-201ENST00000403258 WDR97A6NE52 1622 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTBP8-201ENST00000403258 SOGA1O94964 1423 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTBP8-201ENST00000403258 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTBP8-201ENST00000403258 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTBP8-201ENST00000403258 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTBP8-201ENST00000403258 PBRM1Q86U86 1689 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTBP8-201ENST00000403258 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
ACTBP8-201ENST00000403258 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ACTBP8-201ENST00000403258 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTBP8-201ENST00000403258 GRIN2BQ13224 1484 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTBP8-201ENST00000403258 TRIM41Q8WV44 630 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTBP8-201ENST00000403258 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACTBP8-201ENST00000403258 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTBP8-201ENST00000403258 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF27Q86VH2 1401 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTBP8-201ENST00000403258 CHD1O14646 1710 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTBP8-201ENST00000403258 ADAMTS12P58397 1594 aa25.81■■□□□ 1.72
ACTBP8-201ENST00000403258 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTBP8-201ENST00000403258 CUL7Q14999 1698 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTBP8-201ENST00000403258 SYNJ2O15056 1496 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTBP8-201ENST00000403258 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.7■■□□□ 1.7
ACTBP8-201ENST00000403258 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTBP8-201ENST00000403258 IGF1RP08069 1367 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTBP8-201ENST00000403258 GRIN2AQ12879 1464 aa25.64■■□□□ 1.69
ACTBP8-201ENST00000403258 EEA1Q15075 1411 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTBP8-201ENST00000403258 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ACTBP8-201ENST00000403258 OSCARQ8IYS5 282 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTBP8-201ENST00000403258 FBLN2P98095 1184 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTBP8-201ENST00000403258 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTBP8-201ENST00000403258 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTBP8-201ENST00000403258 CEP170Q5SW79 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTBP8-201ENST00000403258 NUP160Q12769 1436 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTBP8-201ENST00000403258 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTBP8-201ENST00000403258 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTBP8-201ENST00000403258 PRXQ9BXM0 1461 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTBP8-201ENST00000403258 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF21BO75037 1637 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTBP8-201ENST00000403258 SHROOM2Q13796 1616 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTBP8-201ENST00000403258 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.37■■□□□ 1.65
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