RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.77■■■■□ 3.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.52■■■□□ 2.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC9O60706 1549 aa31.71■■■□□ 2.67
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NACADO15069 1562 aa30.65■■■□□ 2.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.63■■■□□ 2.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.62■■■□□ 2.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.61■■■□□ 2.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.5■■■□□ 2.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.43■■■□□ 2.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCRIBQ14160 1630 aa29.65■■■□□ 2.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.6■■■□□ 2.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.59■■■□□ 2.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.53■■■□□ 2.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.98■■■□□ 2.23
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.65■■■□□ 2.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.58■■■□□ 2.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMARCA4P51532 1647 aa28.42■■■□□ 2.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCAPD3P42695 1498 aa28.34■■■□□ 2.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.34■■■□□ 2.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMARCA2P51531 1590 aa28.29■■■□□ 2.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.28■■■□□ 2.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.22■■■□□ 2.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGXB3Q12766 1538 aa28.16■■■□□ 2.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WIZO95785 1651 aa27.87■■■□□ 2.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.52■■■□□ 2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.48■■□□□ 1.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NESP48681 1621 aa27.45■■□□□ 1.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.41■■□□□ 1.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.39■■□□□ 1.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERCC6Q03468 1493 aa27.38■■□□□ 1.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFTRP13569 1480 aa27.37■■□□□ 1.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.15■■□□□ 1.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.1■■□□□ 1.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CUX2O14529 1486 aa27.08■■□□□ 1.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.03■■□□□ 1.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.98■■□□□ 1.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR62O43379 1518 aa26.91■■□□□ 1.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRDM2Q13029 1718 aa26.86■■□□□ 1.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC8Q09428 1581 aa26.8■■□□□ 1.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOPBP1Q92547 1522 aa26.7■■□□□ 1.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.67■■□□□ 1.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFT140Q96RY7 1462 aa26.57■■□□□ 1.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CUX1P39880 1505 aa26.53■■□□□ 1.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.44■■□□□ 1.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOGA1O94964 1423 aa26.43■■□□□ 1.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.35■■□□□ 1.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOP2BQ02880 1626 aa26.34■■□□□ 1.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNJ1O43426 1573 aa26.29■■□□□ 1.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.28■■□□□ 1.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR97A6NE52 1622 aa26.25■■□□□ 1.79
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.24■■□□□ 1.79
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIN2BQ13224 1484 aa26.11■■□□□ 1.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.11■■□□□ 1.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.07■■□□□ 1.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.03■■□□□ 1.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSCARQ8IYS5 282 aa26.01■■□□□ 1.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26■■□□□ 1.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM41Q8WV44 630 aa26■■□□□ 1.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF27Q86VH2 1401 aa25.97■■□□□ 1.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNJ2O15056 1496 aa25.91■■□□□ 1.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBLN2P98095 1184 aa25.91■■□□□ 1.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGF1RP08069 1367 aa25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PBRM1Q86U86 1689 aa25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTS12P58397 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIN2AQ12879 1464 aa25.74■■□□□ 1.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHD1O14646 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.68■■□□□ 1.7
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP160Q12769 1436 aa25.66■■□□□ 1.7
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CUL7Q14999 1698 aa25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.63■■□□□ 1.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EEA1Q15075 1411 aa25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP170Q5SW79 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF11O15085 1522 aa25.49■■□□□ 1.67
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRXQ9BXM0 1461 aa25.49■■□□□ 1.67
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