RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398245.8

GUCD1-201, Transcript of guanylyl cyclase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene GUCD1, Length 1,593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1-201ENST00000398245 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.85■■■■■ 6.69
GUCD1-201ENST00000398245 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.37■■■■■ 5.65
GUCD1-201ENST00000398245 ABCC9O60706 1549 aa49.11■■■■■ 5.45
GUCD1-201ENST00000398245 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.52■■■■■ 5.2
GUCD1-201ENST00000398245 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
GUCD1-201ENST00000398245 NACADO15069 1562 aa47.27■■■■■ 5.16
GUCD1-201ENST00000398245 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.27■■■■■ 5.16
GUCD1-201ENST00000398245 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.02■■■■■ 5.12
GUCD1-201ENST00000398245 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.96■■■■■ 5.11
GUCD1-201ENST00000398245 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.34■■■■■ 5.01
GUCD1-201ENST00000398245 SCRIBQ14160 1630 aa46.1■■■■■ 4.97
GUCD1-201ENST00000398245 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.97■■■■■ 4.95
GUCD1-201ENST00000398245 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.9■■■■■ 4.94
GUCD1-201ENST00000398245 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.25■■■■■ 4.83
GUCD1-201ENST00000398245 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.83■■■■■ 4.77
GUCD1-201ENST00000398245 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
GUCD1-201ENST00000398245 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.41■■■■■ 4.7
GUCD1-201ENST00000398245 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.34■■■■■ 4.69
GUCD1-201ENST00000398245 SMARCA4P51532 1647 aa44.07■■■■■ 4.65
GUCD1-201ENST00000398245 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
GUCD1-201ENST00000398245 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.88■■■■■ 4.62
GUCD1-201ENST00000398245 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.73■■■■■ 4.59
GUCD1-201ENST00000398245 SMARCA2P51531 1590 aa43.66■■■■■ 4.58
GUCD1-201ENST00000398245 NCAPD3P42695 1498 aa43.62■■■■■ 4.57
GUCD1-201ENST00000398245 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.57■■■■■ 4.56
GUCD1-201ENST00000398245 WIZO95785 1651 aa43.46■■■■■ 4.55
GUCD1-201ENST00000398245 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
GUCD1-201ENST00000398245 HMGXB3Q12766 1538 aa43.42■■■■■ 4.54
GUCD1-201ENST00000398245 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
GUCD1-201ENST00000398245 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
GUCD1-201ENST00000398245 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
GUCD1-201ENST00000398245 NESP48681 1621 aa42.61■■■■■ 4.41
GUCD1-201ENST00000398245 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.46■■■■■ 4.39
GUCD1-201ENST00000398245 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.43■■■■■ 4.38
GUCD1-201ENST00000398245 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.39■■■■■ 4.38
GUCD1-201ENST00000398245 ERCC6Q03468 1493 aa42.24■■■■■ 4.35
GUCD1-201ENST00000398245 CFTRP13569 1480 aa42.2■■■■■ 4.35
GUCD1-201ENST00000398245 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.13■■■■■ 4.33
GUCD1-201ENST00000398245 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.11■■■■■ 4.33
GUCD1-201ENST00000398245 PRDM2Q13029 1718 aa41.96■■■■■ 4.31
GUCD1-201ENST00000398245 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.93■■■■■ 4.3
GUCD1-201ENST00000398245 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.84■■■■■ 4.29
GUCD1-201ENST00000398245 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
GUCD1-201ENST00000398245 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.7■■■■■ 4.27
GUCD1-201ENST00000398245 CUX2O14529 1486 aa41.61■■■■■ 4.25
GUCD1-201ENST00000398245 WDR62O43379 1518 aa41.55■■■■■ 4.24
GUCD1-201ENST00000398245 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
GUCD1-201ENST00000398245 TOPBP1Q92547 1522 aa41.31■■■■■ 4.2
GUCD1-201ENST00000398245 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.26■■■■■ 4.2
GUCD1-201ENST00000398245 ABCC8Q09428 1581 aa41.23■■■■■ 4.19
GUCD1-201ENST00000398245 CUX1P39880 1505 aa41.13■■■■■ 4.17
GUCD1-201ENST00000398245 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
GUCD1-201ENST00000398245 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
GUCD1-201ENST00000398245 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.94■■■■■ 4.14
GUCD1-201ENST00000398245 IFT140Q96RY7 1462 aa40.91■■■■■ 4.14
GUCD1-201ENST00000398245 SYNJ1O43426 1573 aa40.89■■■■■ 4.14
GUCD1-201ENST00000398245 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.85■■■■■ 4.13
GUCD1-201ENST00000398245 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
GUCD1-201ENST00000398245 TOP2BQ02880 1626 aa40.83■■■■■ 4.13
GUCD1-201ENST00000398245 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.83■■■■■ 4.13
GUCD1-201ENST00000398245 SOGA1O94964 1423 aa40.81■■■■■ 4.12
GUCD1-201ENST00000398245 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
GUCD1-201ENST00000398245 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
GUCD1-201ENST00000398245 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.099e-10■■■■■ 41.2
GUCD1-201ENST00000398245 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
GUCD1-201ENST00000398245 WDR97A6NE52 1622 aa40.58■■■■■ 4.09
GUCD1-201ENST00000398245 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.51■■■■■ 4.08
GUCD1-201ENST00000398245 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.35■■■■■ 4.05
GUCD1-201ENST00000398245 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.34■■■■■ 4.05
GUCD1-201ENST00000398245 PBRM1Q86U86 1689 aa40.28■■■■■ 4.04
GUCD1-201ENST00000398245 GRIN2BQ13224 1484 aa40.26■■■■■ 4.04
GUCD1-201ENST00000398245 TRIM41Q8WV44 630 aa40.25■■■■■ 4.03
GUCD1-201ENST00000398245 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.22■■■■■ 4.03
GUCD1-201ENST00000398245 CHD1O14646 1710 aa40.1■■■■■ 4.01
GUCD1-201ENST00000398245 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
GUCD1-201ENST00000398245 FBLN2P98095 1184 aa40.1■■■■■ 4.01
GUCD1-201ENST00000398245 KIF27Q86VH2 1401 aa40.05■■■■■ 4
GUCD1-201ENST00000398245 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.03■■■■■ 4
GUCD1-201ENST00000398245 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.01■■■■■ 4
GUCD1-201ENST00000398245 OSCARQ8IYS5 282 aa40.01■■■■□ 3.99
GUCD1-201ENST00000398245 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.99■■■■□ 3.99
GUCD1-201ENST00000398245 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
GUCD1-201ENST00000398245 SYNJ2O15056 1496 aa39.96■■■■□ 3.99
GUCD1-201ENST00000398245 ADAMTS12P58397 1594 aa39.94■■■■□ 3.98
GUCD1-201ENST00000398245 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.92■■■■□ 3.98
GUCD1-201ENST00000398245 IGF1RP08069 1367 aa39.88■■■■□ 3.97
GUCD1-201ENST00000398245 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.85■■■■□ 3.97
GUCD1-201ENST00000398245 GRIN2AQ12879 1464 aa39.77■■■■□ 3.96
GUCD1-201ENST00000398245 CUL7Q14999 1698 aa39.73■■■■□ 3.95
GUCD1-201ENST00000398245 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.65■■■■□ 3.94
GUCD1-201ENST00000398245 CEP170Q5SW79 1584 aa39.6■■■■□ 3.93
GUCD1-201ENST00000398245 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.59■■■■□ 3.93
GUCD1-201ENST00000398245 NUP160Q12769 1436 aa39.55■■■■□ 3.92
GUCD1-201ENST00000398245 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
GUCD1-201ENST00000398245 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.44■■■■□ 3.9
GUCD1-201ENST00000398245 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.44■■■■□ 3.9
GUCD1-201ENST00000398245 EEA1Q15075 1411 aa39.43■■■■□ 3.9
GUCD1-201ENST00000398245 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.38■■■■□ 3.89
GUCD1-201ENST00000398245 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.38■■■■□ 3.89
GUCD1-201ENST00000398245 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.38■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms