RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358990.3

ANKRD46-202, Transcript of ankyrin repeat domain 46, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD46, Length 661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD46-202ENST00000358990 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.62■■□□□ 1.85
ANKRD46-202ENST00000358990 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD46-202ENST00000358990 ABCC9O60706 1549 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD46-202ENST00000358990 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD46-202ENST00000358990 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD46-202ENST00000358990 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD46-202ENST00000358990 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD46-202ENST00000358990 NACADO15069 1562 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD46-202ENST00000358990 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
ANKRD46-202ENST00000358990 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD46-202ENST00000358990 SCRIBQ14160 1630 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD46-202ENST00000358990 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
ANKRD46-202ENST00000358990 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD46-202ENST00000358990 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.15■□□□□ 0.98
ANKRD46-202ENST00000358990 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
ANKRD46-202ENST00000358990 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.69■□□□□ 0.9
ANKRD46-202ENST00000358990 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.68■□□□□ 0.9
ANKRD46-202ENST00000358990 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD46-202ENST00000358990 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD46-202ENST00000358990 SMARCA4P51532 1647 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD46-202ENST00000358990 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD46-202ENST00000358990 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ANKRD46-202ENST00000358990 NCAPD3P42695 1498 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD46-202ENST00000358990 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD46-202ENST00000358990 SMARCA2P51531 1590 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD46-202ENST00000358990 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD46-202ENST00000358990 HMGXB3Q12766 1538 aa20.25■□□□□ 0.83
ANKRD46-202ENST00000358990 WIZO95785 1651 aa20.25■□□□□ 0.83
ANKRD46-202ENST00000358990 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ANKRD46-202ENST00000358990 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD46-202ENST00000358990 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD46-202ENST00000358990 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.89■□□□□ 0.77
ANKRD46-202ENST00000358990 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.85■□□□□ 0.77
ANKRD46-202ENST00000358990 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.76■□□□□ 0.75
ANKRD46-202ENST00000358990 CFTRP13569 1480 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD46-202ENST00000358990 NESP48681 1621 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD46-202ENST00000358990 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.68■□□□□ 0.74
ANKRD46-202ENST00000358990 ERCC6Q03468 1493 aa19.55■□□□□ 0.72
ANKRD46-202ENST00000358990 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.54■□□□□ 0.72
ANKRD46-202ENST00000358990 PRDM2Q13029 1718 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD46-202ENST00000358990 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD46-202ENST00000358990 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.43■□□□□ 0.7
ANKRD46-202ENST00000358990 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.38■□□□□ 0.69
ANKRD46-202ENST00000358990 ABCC8Q09428 1581 aa19.37■□□□□ 0.69
ANKRD46-202ENST00000358990 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ANKRD46-202ENST00000358990 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ANKRD46-202ENST00000358990 CUX2O14529 1486 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD46-202ENST00000358990 WDR62O43379 1518 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD46-202ENST00000358990 TOPBP1Q92547 1522 aa19.25■□□□□ 0.67
ANKRD46-202ENST00000358990 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
ANKRD46-202ENST00000358990 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.23■□□□□ 0.67
ANKRD46-202ENST00000358990 CUX1P39880 1505 aa19.18■□□□□ 0.66
ANKRD46-202ENST00000358990 TOP2BQ02880 1626 aa19.11■□□□□ 0.65
ANKRD46-202ENST00000358990 SOGA1O94964 1423 aa19.11■□□□□ 0.65
ANKRD46-202ENST00000358990 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
ANKRD46-202ENST00000358990 IFT140Q96RY7 1462 aa19.09■□□□□ 0.65
ANKRD46-202ENST00000358990 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.08■□□□□ 0.65
ANKRD46-202ENST00000358990 TRIM41Q8WV44 630 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD46-202ENST00000358990 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.08■□□□□ 0.64
ANKRD46-202ENST00000358990 SYNJ1O43426 1573 aa19.06■□□□□ 0.64
ANKRD46-202ENST00000358990 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.03■□□□□ 0.64
ANKRD46-202ENST00000358990 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.02■□□□□ 0.63
ANKRD46-202ENST00000358990 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ANKRD46-202ENST00000358990 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.95■□□□□ 0.62
ANKRD46-202ENST00000358990 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
ANKRD46-202ENST00000358990 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ANKRD46-202ENST00000358990 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
ANKRD46-202ENST00000358990 WDR97A6NE52 1622 aa18.9■□□□□ 0.62
ANKRD46-202ENST00000358990 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.85■□□□□ 0.61
ANKRD46-202ENST00000358990 KIF27Q86VH2 1401 aa18.83■□□□□ 0.61
ANKRD46-202ENST00000358990 GRIN2BQ13224 1484 aa18.81■□□□□ 0.6
ANKRD46-202ENST00000358990 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ANKRD46-202ENST00000358990 IGF1RP08069 1367 aa18.78■□□□□ 0.6
ANKRD46-202ENST00000358990 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.77■□□□□ 0.6
ANKRD46-202ENST00000358990 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD46-202ENST00000358990 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ANKRD46-202ENST00000358990 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ANKRD46-202ENST00000358990 EEA1Q15075 1411 aa18.7■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.7■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 OSCARQ8IYS5 282 aa18.68■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.67■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 FBLN2P98095 1184 aa18.67■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 PBRM1Q86U86 1689 aa18.66■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.66■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.66■□□□□ 0.58
ANKRD46-202ENST00000358990 SYNJ2O15056 1496 aa18.64■□□□□ 0.57
ANKRD46-202ENST00000358990 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ANKRD46-202ENST00000358990 CUL7Q14999 1698 aa18.57■□□□□ 0.56
ANKRD46-202ENST00000358990 ADAMTS12P58397 1594 aa18.55■□□□□ 0.56
ANKRD46-202ENST00000358990 PRXQ9BXM0 1461 aa18.53■□□□□ 0.56
ANKRD46-202ENST00000358990 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.53■□□□□ 0.56
ANKRD46-202ENST00000358990 GRIN2AQ12879 1464 aa18.52■□□□□ 0.56
ANKRD46-202ENST00000358990 CHD1O14646 1710 aa18.5■□□□□ 0.55
ANKRD46-202ENST00000358990 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.47■□□□□ 0.55
ANKRD46-202ENST00000358990 NUP160Q12769 1436 aa18.47■□□□□ 0.55
ANKRD46-202ENST00000358990 JPH4Q96JJ6 628 aa18.41■□□□□ 0.54
ANKRD46-202ENST00000358990 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.4■□□□□ 0.54
ANKRD46-202ENST00000358990 CEP170Q5SW79 1584 aa18.37■□□□□ 0.53
ANKRD46-202ENST00000358990 KIF21BO75037 1637 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms