RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356783.9

TNNT1-202, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 934 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-202ENST00000356783 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.09■■■□□ 2.89
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TNNT1-202ENST00000356783 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.93■■■□□ 2.06
TNNT1-202ENST00000356783 NACADO15069 1562 aa27.87■■■□□ 2.05
TNNT1-202ENST00000356783 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.72■■■□□ 2.03
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TNNT1-202ENST00000356783 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
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TNNT1-202ENST00000356783 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.36■■□□□ 1.81
TNNT1-202ENST00000356783 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.11■■□□□ 1.77
TNNT1-202ENST00000356783 SMARCA4P51532 1647 aa25.79■■□□□ 1.72
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TNNT1-202ENST00000356783 SMARCA2P51531 1590 aa25.62■■□□□ 1.69
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TNNT1-202ENST00000356783 HMGXB3Q12766 1538 aa25.62■■□□□ 1.69
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TNNT1-202ENST00000356783 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.09■■□□□ 1.61
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TNNT1-202ENST00000356783 ERCC6Q03468 1493 aa24.97■■□□□ 1.59
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TNNT1-202ENST00000356783 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.81■■□□□ 1.56
TNNT1-202ENST00000356783 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.78■■□□□ 1.56
TNNT1-202ENST00000356783 PRDM2Q13029 1718 aa24.75■■□□□ 1.55
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TNNT1-202ENST00000356783 WDR62O43379 1518 aa24.64■■□□□ 1.53
TNNT1-202ENST00000356783 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.61■■□□□ 1.53
TNNT1-202ENST00000356783 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.57■■□□□ 1.52
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TNNT1-202ENST00000356783 TOPBP1Q92547 1522 aa24.19■■□□□ 1.46
TNNT1-202ENST00000356783 ABCC8Q09428 1581 aa24.16■■□□□ 1.46
TNNT1-202ENST00000356783 IFT140Q96RY7 1462 aa24.07■■□□□ 1.44
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TNNT1-202ENST00000356783 SOGA1O94964 1423 aa23.73■■□□□ 1.39
TNNT1-202ENST00000356783 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.397e-7■■■■□ 24.2
TNNT1-202ENST00000356783 TOP2BQ02880 1626 aa23.7■■□□□ 1.39
TNNT1-202ENST00000356783 PBRM1Q86U86 1689 aa23.67■■□□□ 1.38
TNNT1-202ENST00000356783 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.67■■□□□ 1.38
TNNT1-202ENST00000356783 SYNJ1O43426 1573 aa23.66■■□□□ 1.38
TNNT1-202ENST00000356783 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.65■■□□□ 1.38
TNNT1-202ENST00000356783 OSCARQ8IYS5 282 aa23.65■■□□□ 1.38
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TNNT1-202ENST00000356783 GRIN2BQ13224 1484 aa23.57■■□□□ 1.36
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TNNT1-202ENST00000356783 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
TNNT1-202ENST00000356783 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.55■■□□□ 1.36
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TNNT1-202ENST00000356783 SHROOM2Q13796 1616 aa23.22■■□□□ 1.31
TNNT1-202ENST00000356783 CUL7Q14999 1698 aa23.16■■□□□ 1.3
TNNT1-202ENST00000356783 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.11■■□□□ 1.29
TNNT1-202ENST00000356783 KIF27Q86VH2 1401 aa23.08■■□□□ 1.29
TNNT1-202ENST00000356783 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.06■■□□□ 1.28
TNNT1-202ENST00000356783 IGF1RP08069 1367 aa23.02■■□□□ 1.28
TNNT1-202ENST00000356783 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23■■□□□ 1.27
TNNT1-202ENST00000356783 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.9■■□□□ 1.26
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