RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 ADAMTS12P58397 1594 aa43.54■■■■■ 4.56
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CCZ1-201ENST00000325974 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.35■■■■■ 4.53
CCZ1-201ENST00000325974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.32■■■■■ 4.53
CCZ1-201ENST00000325974 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CCZ1-201ENST00000325974 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
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CCZ1-201ENST00000325974 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.13■■■■■ 4.5
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CCZ1-201ENST00000325974 GRIN2AQ12879 1464 aa43.11■■■■■ 4.49
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CCZ1-201ENST00000325974 MAP3K1Q13233 1512 aa43■■■■■ 4.47
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CCZ1-201ENST00000325974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
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CCZ1-201ENST00000325974 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.91■■■■■ 4.46
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CCZ1-201ENST00000325974 CEP170Q5SW79 1584 aa42.84■■■■■ 4.45
CCZ1-201ENST00000325974 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.83■■■■■ 4.45
CCZ1-201ENST00000325974 FBLN2P98095 1184 aa42.8■■■■■ 4.44
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CCZ1-201ENST00000325974 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.34■■■■■ 4.37
CCZ1-201ENST00000325974 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
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CCZ1-201ENST00000325974 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.27■■■■■ 4.36
CCZ1-201ENST00000325974 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
CCZ1-201ENST00000325974 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
CCZ1-201ENST00000325974 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.19■■■■■ 4.34
CCZ1-201ENST00000325974 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
CCZ1-201ENST00000325974 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
CCZ1-201ENST00000325974 SHROOM2Q13796 1616 aa42.18■■■■■ 4.34
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CCZ1-201ENST00000325974 ATP10BO94823 1461 aa41.77■■■■■ 4.28
CCZ1-201ENST00000325974 MIA2Q96PC5 1412 aa41.73■■■■■ 4.27
CCZ1-201ENST00000325974 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
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CCZ1-201ENST00000325974 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.71■■■■■ 4.27
CCZ1-201ENST00000325974 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.65■■■■■ 4.26
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CCZ1-201ENST00000325974 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.61■■■■■ 4.25
CCZ1-201ENST00000325974 KIF14Q15058 1648 aa41.6■■■■■ 4.25
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CCZ1-201ENST00000325974 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.53■■■■■ 4.24
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CCZ1-201ENST00000325974 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
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CCZ1-201ENST00000325974 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
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CCZ1-201ENST00000325974 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 AKNAQ7Z591 1439 aa41.29■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 DAPK1P53355 1430 aa41.29■■■■■ 4.2
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