RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 73.1
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TNS3-201ENST00000311160 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.591e-16■■■■■ 56.5
TNS3-201ENST00000311160 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 47.1
TNS3-201ENST00000311160 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 44.9
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TNS3-201ENST00000311160 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.854e-7■■■■□ 21
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TNS3-201ENST00000311160 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.382e-7■■■□□ 18.6
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TNS3-201ENST00000311160 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.475e-6■■■□□ 17.8
TNS3-201ENST00000311160 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.722e-6■■■□□ 17.5
TNS3-201ENST00000311160 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.955e-7■■■□□ 17.1
TNS3-201ENST00000311160 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP12.47□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 16.9
TNS3-201ENST00000311160 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.861e-6■■■□□ 16.8
TNS3-201ENST00000311160 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 16.5
TNS3-201ENST00000311160 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.656e-7■■■□□ 16.3
TNS3-201ENST00000311160 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 16.2
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TNS3-201ENST00000311160 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.732e-6■■■□□ 15.5
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TNS3-201ENST00000311160 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 14.9
TNS3-201ENST00000311160 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.942e-7■■□□□ 14.4
TNS3-201ENST00000311160 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.747e-7■■□□□ 14.4
TNS3-201ENST00000311160 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.05□□□□□ -0.167e-6■■□□□ 14.2
TNS3-201ENST00000311160 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.277e-8■■□□□ 14.2
TNS3-201ENST00000311160 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.713e-6■■□□□ 13.9
TNS3-201ENST00000311160 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.659e-7■■□□□ 13.9
TNS3-201ENST00000311160 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.464e-6■■□□□ 13.4
TNS3-201ENST00000311160 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 13.4
TNS3-201ENST00000311160 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.737e-7■■□□□ 13.4
TNS3-201ENST00000311160 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.983e-6■■□□□ 13
TNS3-201ENST00000311160 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP10.9□□□□□ -0.665e-6■■□□□ 12.9
TNS3-201ENST00000311160 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.723e-6■■□□□ 12.7
TNS3-201ENST00000311160 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.78□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 12.7
TNS3-201ENST00000311160 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.823e-6■■□□□ 12.6
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TNS3-201ENST00000311160 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.533e-7■■□□□ 11.9
TNS3-201ENST00000311160 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.491e-9■■□□□ 11.7
TNS3-201ENST00000311160 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.696e-7■■□□□ 11.6
TNS3-201ENST00000311160 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.187e-7■□□□□ 11.2
TNS3-201ENST00000311160 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 11
TNS3-201ENST00000311160 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 10.7
TNS3-201ENST00000311160 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.739e-12■□□□□ 10.6
TNS3-201ENST00000311160 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.83□□□□□ -0.686e-8■□□□□ 10.1
TNS3-201ENST00000311160 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.91□□□□□ -0.662e-7■□□□□ 9.9
TNS3-201ENST00000311160 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.733e-7■□□□□ 9.6
TNS3-201ENST00000311160 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP12.56□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 8.6
TNS3-201ENST00000311160 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.68e-6■□□□□ 8.5
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