RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 ARID3CA6NKF2 412 aa12.13□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.47
TNS1-201ENST00000171887 A0A0G2JS52 829 aa12.07□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 PLCB2Q00722 1185 aa12.06□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.06□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 P3H3Q8IVL6 736 aa12.04□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.04□□□□□ -0.48
TNS1-201ENST00000171887 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 DRC7Q8IY82 874 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 MIER1Q8N108 512 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 FGD1P98174 961 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 CLSTN1O94985 981 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-201ENST00000171887 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 HSCBQ8IWL3 235 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 ARID3AQ99856 593 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.52e-8■□□□□ 9.6
TNS1-201ENST00000171887 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 RGS3P49796 1198 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 KCNJ4P48050 445 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 C14orf37Q86TY3 774 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-201ENST00000171887 CFAP53Q96M91 514 aa11.9□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 49.3
TNS1-201ENST00000171887 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 PTMSP20962 102 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 PLEKHG5O94827 1062 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 MCCP23508 829 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-201ENST00000171887 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 GOLGA2Q08379 1002 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 NPHP1O15259 732 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 MS4A1P11836 297 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 GBP4Q96PP9 640 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 USP35Q9P2H5 1018 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 SCRIBQ14160 1630 aa11.8□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.79□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.79□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 CDCA8Q53HL2 280 aa11.79□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.78□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.78□□□□□ -0.52
TNS1-201ENST00000171887 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 CFAP44Q96MT7 982 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 NEUROD2Q15784 382 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 TPM4P67936 248 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 TSPY4P0CV99 314 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 TSPY10P0CW01 314 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 ABCC9O60706 1549 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-201ENST00000171887 NUDCQ9Y266 331 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 PHF14O94880 888 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 PDE4CQ08493 712 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 CLIP1P30622 1438 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 TPM3P06753 285 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS1-201ENST00000171887 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms