RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP4	YPR178W	HFM1	P51979	1187 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	LSC2	P53312	427 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YOR296W	Q08748	1289 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	TIP41	Q12199	356 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	HAT1	Q12341	374 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	CYB2	P00175	591 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	RAD53	P22216	821 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YSW1	P38280	609 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	MAD1	P40957	749 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	ALG2	P43636	503 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	TRS85	P46944	698 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	HDA1	P53973	706 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	UME1	Q03010	460 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	ENT1	Q12518	454 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PSO2	P30620	661 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	ANP1	P32629	500 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	SIC1	P38634	284 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	TDA3	P38758	523 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	VPS72	Q03388	795 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YRF1-6	P53819	1859 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	SWI3	P32591	825 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	LYS14	P40971	790 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	OPY2	Q06810	360 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	REB1	P21538	810 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	HXT1	P32465	570 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YDR338C	Q05497	695 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	SDH5	Q08230	162 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PLP2	Q12017	286 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YOR111W	Q99210	232 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.28	□□□□□ -0.6	not detected
PRP4	YPR178W	DAL7	P21826	554 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	MAK31	P23059	88 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	RIM101	P33400	625 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	MYO3	P36006	1272 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	VTI1	Q04338	217 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	INM2	Q05533	292 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	SEC39	Q12745	709 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	SOV1	Q04748	898 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YLR001C	Q07895	862 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	YAP7	Q08182	245 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	COB	P00163	385 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	YGL138C	P53122	345 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	DAS2	Q12084	232 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	RPC25	P35718	212 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	UGA2	P38067	497 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	RTS1	P38903	757 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	CSM2	P40465	213 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	YIR042C	P40586	236 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	IES1	P43579	692 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	VTC2	P43585	828 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	THI3	Q07471	609 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	NYV1	Q12255	253 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	ISW1	P38144	1129 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	ENV11	P53246	860 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	ENV9	Q08651	330 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	PMR1	P13586	950 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	SEC8	P32855	1065 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	ERG7	P38604	731 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	YOL075C	Q08234	1294 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	FOB1	O13329	566 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	MGM1	P32266	881 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	MRX1	P40050	688 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	THI6	P41835	540 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	UBA2	P52488	636 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	GIS4	Q04233	774 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	TOS4	Q06266	489 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	SPO75	Q07798	868 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61

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