RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	FKS3	Q04952	1785 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	SWC3	P31376	625 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	HXT5	P38695	592 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	YPQ2	Q06328	317 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	NUP145	P49687	1317 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MCM1	P11746	286 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	RAD4	P14736	754 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	ROX1	P25042	368 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	UTR2	P32623	467 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	CTF4	Q01454	927 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	NSE3	Q05541	303 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	RAD50	P12753	1312 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MRP7	P12687	371 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	KCC4	P25389	1037 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	ISC10	P32645	267 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MGE1	P38523	228 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	FYV10	P40492	516 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	ZDS2	P54786	942 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	YOL057W	Q08225	711 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	ALE1	Q08548	619 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	RPB10	P22139	70 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	BRN1	P38170	754 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	HXT13	P39924	564 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MSN5	P52918	1224 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	UFD2	P54860	961 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	BOI2	P39969	1040 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	NNF1	P47149	201 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	YDR306C	Q06640	478 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MSP1	P28737	362 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	SLA1	P32790	1244 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MET1	P36150	593 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	ITC1	P53125	1264 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	HXT17	P53631	564 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	YNR014W	P53719	212 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	WTM2	Q12206	467 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	LYS2	P07702	1392 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRS33	YOR115C	MRPL33	P20084	86 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	NUP133	P36161	1157 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	TBS1	P38114	1094 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	SSN3	P39073	555 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	RMD1	Q03441	430 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	RSF2	P46974	1380 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	SWI1	P09547	1314 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	CDC16	P09798	840 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	VPS35	P34110	944 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	SCD5	P34758	872 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	DAK2	P43550	591 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	NPA3	P47122	385 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	DOS2	P54858	310 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	CDC55	Q00362	526 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	RSC4	Q02206	625 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	SUM1	P46676	1062 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	YGL081W	P53156	320 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	VPS64	Q03944	604 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	ENT1	Q12518	454 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	MCM2	P29469	868 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	YNL011C	P53980	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	DNM1	P54861	757 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	MEC3	Q02574	474 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	VPS16	Q03308	798 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	VPS20	Q04272	221 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	PIN2	Q12057	282 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	YKL133C	P36066	463 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	SPR28	Q04921	423 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TRS33	YOR115C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRS33	YOR115C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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