RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W YHL026CP38740 315 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YPR204WQ08995 1032 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W LEU5P38702 357 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YJR061WP40355 935 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SBE2P42223 864 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SIZ1Q04195 904 aa3.48□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W TIF1P10081 395 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W LIP5P32875 414 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W ARP4P80428 489 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YMR206WQ03695 313 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W MPH3P0CE00 602 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W POA1P38218 177 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W UGA3P26370 528 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PMI40P29952 429 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W FAU1P40099 211 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PRY3P47033 881 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SOL4P53315 255 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YML083CQ04526 418 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W IOC2Q12072 812 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W PCK1P10963 549 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W YCG1Q06680 1035 aa3.47□□□□□ -1.85
SIN3YOL004W SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PPZ1P26570 692 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YUR1P26725 428 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W CBF2P32504 956 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ERC1P38767 581 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W UBP12P39538 1254 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W CDA1Q06702 301 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YLL067CQ07888 1374 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MNN4P36044 1178 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YBL028CP38202 106 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PIP2P52960 996 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SEC15P22224 910 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W COY1P34237 679 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W RAD55P38953 406 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MDR1P53258 950 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W DOS2P54858 310 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PEX29Q03370 554 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YOR389WQ08912 624 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YPL272CQ08984 517 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YPL278CQ08990 100 aa3.46□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MRM1P25270 412 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W NOC2P39744 710 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W APL6P46682 809 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W GIS4Q04233 774 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PDR3P33200 976 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PIM1P36775 1133 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MPD2Q99316 277 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W CTF3Q12748 733 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W LYS2P07702 1392 aa3.45□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.44□□□□□ -1.86not detected
SIN3YOL004W CST26P38226 397 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MRPL32P25348 183 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PPG1P32838 368 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W FPR3P38911 411 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SKP2P42843 763 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YGL082WP53155 381 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YGR035CP53222 116 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PCL8Q08966 492 aa3.44□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data3.43□□□□□ -1.86not detected
SIN3YOL004W VPS35P34110 944 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W UBS1P38290 277 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W NUP42P49686 430 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W HFI1Q12060 488 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W RRD2Q12461 358 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W GID8P40208 455 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ARP9Q05123 467 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W COX6P00427 148 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SES1P07284 462 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ATG32P40458 529 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W GSM1P42950 618 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TAF10Q12030 206 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SEC39Q12745 709 aa3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W NAR1P23503 491 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W IPP1P00817 287 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W BRF1P29056 596 aa3.42□□□□□ -1.86
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