RNA–Protein interactions for RNA: YJL112W

MDV1, Transcript of Peripheral protein of cytosolic face of mitochondrial outer membrane, yeast

Gene MDV1, Length 2,145 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDV1	YJL112W	RTA1	P53047	317 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MDV1	YJL112W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
MDV1	YJL112W	BDS1	Q08347	646 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MDV1	YJL112W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
MDV1	YJL112W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	TEC1	P18412	486 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	PTP2	P29461	750 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	VTC2	P43585	828 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YJR115W	P47152	169 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	UBA2	P52488	636 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YNL058C	P53947	316 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	RCF1	Q03713	159 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	CAB1	Q04430	367 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	FMP25	Q08023	583 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SSP2	Q08646	371 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	MED1	Q12321	566 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	HSP42	Q12329	375 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	GUT2	P32191	649 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	PPH3	P32345	308 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	MCM10	P32354	571 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	ISC10	P32645	267 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YKL050C	P35736	922 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	FIG4	P42837	879 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	ISM1	P48526	1002 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	EEB1	Q02891	456 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SPC19	Q03954	165 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	ERF2	Q06551	359 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YLR001C	Q07895	862 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SDH5	Q08230	162 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YDR056C	Q12025	205 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	DBF20	P32328	564 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	TFC4	P33339	1025 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	NUP120	P35729	1037 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	BET3	P36149	193 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SAP185	P40856	1058 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	RSC4	Q02206	625 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	TRE2	Q08693	809 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	MSM1	P22438	575 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	RXT2	P38255	430 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YHL041W	P38730	149 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	CAJ1	P39101	391 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	IRR1	P40541	1150 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YFL034W	P43564	1073 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	ERP6	P53198	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SHE9	Q04172	456 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	BAS1	P22035	811 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	AAD3	P25612	363 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	KIP2	P28743	706 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	CHS3	P29465	1165 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	NUD1	P32336	851 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	MKK2	P32491	506 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	NIC96	P34077	839 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	PEX5	P35056	612 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	CWH41	P53008	833 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	VTI1	Q04338	217 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	DAL4	Q04895	635 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	BSC2	Q05611	235 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	EAF1	Q06337	982 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	ALR1	Q08269	859 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	RTT10	Q08924	1013 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	GCR1	P07261	785 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	MEF1	P25039	761 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	AGP1	P25376	633 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	NTH2	P35172	780 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	GDH3	P39708	457 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	MGS1	P40151	587 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	TMA108	P40462	946 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	HUL4	P40985	892 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SGM1	P47166	707 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YPL109C	Q02981	657 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	MLC2	Q06580	163 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	YDL206W	Q12424	762 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDV1	YJL112W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms