RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	FIG4	P42837	879 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	EPL1	P43572	832 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	ERO1	Q03103	563 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	COG8	Q04632	607 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	SRF1	Q12516	437 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YJR115W	P47152	169 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YKE2	P52553	114 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	MSN5	P52918	1224 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	HDA1	P53973	706 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	APC11	Q12157	165 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.06	□□□□□ -1.28	not detected
YCK1	YHR135C	MDL2	P33311	773 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RER2	P35196	286 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	DID4	P36108	232 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YBL036C	P38197	257 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	GSM1	P42950	618 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YFH7	P43591	353 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	EAF6	P47128	113 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	PEX14	P53112	341 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	ELG1	Q12050	791 aa		7.06	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	CYB2	P00175	591 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RDS1	P25611	832 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	TTI1	P36097	1038 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	ERT1	P38140	529 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YHL050C	P38721	697 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	7.05	□□□□□ -1.28	not detected
YCK1	YHR135C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	IOC3	P43596	787 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	UFD2	P54860	961 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YPL150W	Q12152	901 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	GUT2	P32191	649 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RPN12	P32496	274 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YHL017W	P38745	532 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	JJJ2	P46997	583 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RSC1	P53236	928 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	NSG2	P53898	299 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	TFB3	Q03290	321 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YLR407W	Q06070	228 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	EST2	Q06163	884 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	GAS5	Q08193	484 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	PSK2	Q08217	1101 aa		7.05	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	SNF3	P10870	884 aa		7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	MET22	P32179	357 aa		7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RFC5	P38251	354 aa		7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	AKR1	P39010	764 aa		7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	BUD6	P41697	788 aa		7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	MYO1	P08964	1928 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	GEF1	P37020	779 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	MAL33	P38157	468 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RKM3	P38222	552 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	KIN4	Q01919	800 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	UBX2	Q04228	584 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	YLR346C	Q06139	101 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	AIM44	Q99299	758 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	FLO11	P08640	1367 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.02	□□□□□ -1.29	not detected
YCK1	YHR135C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RSM25	P40496	264 aa		7.02	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YDR444W	Q04093	687 aa		7.02	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	TFC6	Q06339	672 aa		7.02	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	ARG82	P07250	355 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	YKL222C	P35995	705 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	SIS2	P36024	562 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	PIP2	P52960	996 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	GRX6	Q12438	231 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	ANP1	P32629	500 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	CSM2	P40465	213 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	TRS33	Q99394	268 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RIT1	P23796	513 aa		7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	ELM1	P32801	640 aa		7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	MYO3	P36006	1272 aa		7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	RTS1	P38903	757 aa		7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	SSL2	Q00578	843 aa		7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	LCD1	Q04377	747 aa		7	□□□□□ -1.29
YCK1	YHR135C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29

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