RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W GYL1Q04322 720 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W IRC3Q06683 689 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TAF3Q12297 353 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W BMH1P29311 267 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PXA2P34230 853 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W HEL1P36113 551 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RFC5P38251 354 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RRP8P38961 392 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W BDH2P39713 417 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TFB3Q03290 321 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MET7Q08645 548 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PET122P10355 254 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RPN12P32496 274 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YEL043WP32618 956 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W GRX4P32642 244 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SET1P38827 1080 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PEX18P38855 283 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CAJ1P39101 391 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W JJJ2P46997 583 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SGM1P47166 707 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W GIC2Q06648 383 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YOL098CQ12496 1037 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ENT1Q12518 454 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SMC6Q12749 1114 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.57□□□□□ -1.52not detected
CYK3YDL117W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ECM4P36156 370 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W UGA2P38067 497 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MXR1P40029 184 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YGL242CP53066 181 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YLR271WQ06152 274 aa5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MHP1P43638 1398 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W NUP170P38181 1502 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TPS2P31688 896 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RPC34P32910 317 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SLA2P33338 968 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YBR242WP38331 238 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data5.56□□□□□ -1.52not detected
CYK3YDL117W RGA1P39083 1007 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W NUP60P39705 539 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ADA2Q02336 434 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SRC1Q03707 834 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PDS5Q04264 1277 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YMR018WQ04364 514 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MGR3Q04472 501 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TUF1P02992 437 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W VPH2P32341 215 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PPG1P32838 368 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W STE13P33894 931 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W FUI1P38196 639 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RLP7P40693 322 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YGR266WP53326 701 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SSL2Q00578 843 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W DPH6Q12429 685 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W DRS2P39524 1355 aa5.56□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SLX5P32828 619 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YRO2P38079 344 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RXT2P38255 430 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YHB1P39676 399 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SSN8P47821 323 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ITR1P30605 584 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W FMP10P40098 244 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MVP1P40959 511 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W FYV8P46949 817 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W URB2P47108 1174 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MPS2P53159 387 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ALG12P53730 551 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ESBP6P53918 673 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W DML1Q03652 475 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W POB3Q04636 552 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W YLH47Q06493 454 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RSC3Q06639 885 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W OSH2Q12451 1283 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SCC2Q04002 1493 aa5.55□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RPS3P05750 240 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W FUS1P11710 512 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TRM1P15565 570 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MGM1P32266 881 aa5.54□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W GLN1P32288 370 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.1 ms