RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeastyeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4YBR257W MET4P32389 672 aa6.6□□□□□ -1.35
POP4YBR257W CIC1P38779 376 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
POP4YBR257W XKS1P42826 600 aa6.6□□□□□ -1.35
POP4YBR257W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
POP4YBR257W RET1P22276 1149 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
POP4YBR257W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
POP4YBR257W SHU2P38957 223 aa6.58□□□□□ -1.36
POP4YBR257W PEX13P80667 386 aa6.58□□□□□ -1.36
POP4YBR257W ULP1Q02724 621 aa6.58□□□□□ -1.36
POP4YBR257W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
POP4YBR257W RDH54P38086 958 aa6.57□□□□□ -1.36
POP4YBR257W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
POP4YBR257W DAL4Q04895 635 aa6.57□□□□□ -1.36
POP4YBR257W WHI5Q12416 295 aa6.57□□□□□ -1.36
POP4YBR257W AIM3P38266 947 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
POP4YBR257W ETP1P38748 585 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
POP4YBR257W DAK2P43550 591 aa6.56□□□□□ -1.36
POP4YBR257W YKL222CP35995 705 aa6.55□□□□□ -1.36
POP4YBR257W FLR1P38124 548 aa6.55□□□□□ -1.36
POP4YBR257W YJL045WP47052 634 aa6.55□□□□□ -1.36
POP4YBR257W MRPL22P53881 309 aa6.55□□□□□ -1.36
POP4YBR257W VPS35P34110 944 aa6.54□□□□□ -1.36
POP4YBR257W YHL012WP38709 493 aa6.54□□□□□ -1.36
POP4YBR257W PEX28P38848 579 aa6.54□□□□□ -1.36
POP4YBR257W FAA3P39002 694 aa6.54□□□□□ -1.36
POP4YBR257W PPX1P38698 397 aa6.53□□□□□ -1.36
POP4YBR257W GIP4P39732 760 aa6.53□□□□□ -1.36
POP4YBR257W RSM26P47141 266 aa6.53□□□□□ -1.36
POP4YBR257W YNR063WP53749 607 aa6.53□□□□□ -1.36
POP4YBR257W YPL109CQ02981 657 aa6.53□□□□□ -1.36
POP4YBR257W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data6.52□□□□□ -1.37not detected
POP4YBR257W VMA4P22203 233 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
POP4YBR257W AFG2P32794 780 aa6.52□□□□□ -1.37
POP4YBR257W YGL140CP53120 1219 aa6.52□□□□□ -1.37
POP4YBR257W GCD6P32501 712 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POP4YBR257W QNS1P38795 714 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POP4YBR257W PIC2P40035 300 aa6.5□□□□□ -1.37
POP4YBR257W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POP4YBR257W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POP4YBR257W SEC23P15303 768 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
POP4YBR257W MDL2P33311 773 aa6.49□□□□□ -1.37
POP4YBR257W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
POP4YBR257W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
POP4YBR257W HXK1P04806 485 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
POP4YBR257W SQT1P35184 431 aa6.48□□□□□ -1.37
POP4YBR257W RIM8P53179 542 aa6.48□□□□□ -1.37
POP4YBR257W ADI1Q03677 179 aa6.48□□□□□ -1.37
POP4YBR257W KAR2P16474 682 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
POP4YBR257W HSE1P38753 452 aa6.47□□□□□ -1.37
POP4YBR257W RKM2Q03942 479 aa6.47□□□□□ -1.37
POP4YBR257W YPL277CQ08989 487 aa6.47□□□□□ -1.37
POP4YBR257W SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
POP4YBR257W YSC84P32793 468 aa6.46□□□□□ -1.38
POP4YBR257W AIM26P32858 118 aa6.46□□□□□ -1.38
POP4YBR257W ADD66P36040 267 aa6.46□□□□□ -1.38
POP4YBR257W LAP2Q10740 671 aa6.46□□□□□ -1.38
POP4YBR257W CHD1P32657 1468 aa6.46□□□□□ -1.38
POP4YBR257W SOD2P00447 233 aa6.45□□□□□ -1.38
POP4YBR257W RSC58Q07979 502 aa6.45□□□□□ -1.38
POP4YBR257W TY1B-DR4Q07793 1604 aa6.44□□□□□ -1.38
POP4YBR257W STM1P39015 273 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POP4YBR257W GPB2P39717 880 aa6.44□□□□□ -1.38
POP4YBR257W KIP1P28742 1111 aa6.43□□□□□ -1.38
POP4YBR257W TOD6P34219 525 aa6.43□□□□□ -1.38
POP4YBR257W EST2Q06163 884 aa6.43□□□□□ -1.38
POP4YBR257W HDA2Q06629 674 aa6.43□□□□□ -1.38
POP4YBR257W RPS13P05756 151 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POP4YBR257W RPT1P33299 467 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POP4YBR257W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
POP4YBR257W VPS53P47061 822 aa6.42□□□□□ -1.38
POP4YBR257W YDR132CQ03900 495 aa6.42□□□□□ -1.38
POP4YBR257W IPL1P38991 367 aa6.41□□□□□ -1.38
POP4YBR257W SNF5P18480 905 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W BAP2P38084 609 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W ALG3P38179 458 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W THI12P42883 340 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W THI5P43534 340 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W THI11P47183 340 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W SNO2P53823 222 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W THI13Q07748 340 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W OXR1Q08952 273 aa6.4□□□□□ -1.38
POP4YBR257W MMS22Q06164 1454 aa6.4□□□□□ -1.39
POP4YBR257W DED1P06634 604 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
POP4YBR257W YFL054CP43549 646 aa6.39□□□□□ -1.39
POP4YBR257W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data6.39□□□□□ -1.39not detected
POP4YBR257W ATG14P38270 344 aa6.38□□□□□ -1.39
POP4YBR257W GNP1P48813 663 aa6.38□□□□□ -1.39
POP4YBR257W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
POP4YBR257W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
POP4YBR257W SPO21Q12411 609 aa6.38□□□□□ -1.39
POP4YBR257W HSL1P34244 1518 aa6.38□□□□□ -1.39
POP4YBR257W SPS1P08458 490 aa6.37□□□□□ -1.39
POP4YBR257W FOL2P51601 243 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
POP4YBR257W ROD1Q02805 837 aa6.37□□□□□ -1.39
POP4YBR257W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
POP4YBR257W PTC5Q12511 572 aa6.37□□□□□ -1.39
POP4YBR257W HXT13P39924 564 aa6.36□□□□□ -1.39
POP4YBR257W HXT17P53631 564 aa6.36□□□□□ -1.39
POP4YBR257W HXT15P54854 567 aa6.36□□□□□ -1.39
POP4YBR257W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.1 ms