RNA–Protein interactions for RNA: YBR047W

FMP23, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene FMP23, Length 528 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP23	YBR047W	LAP2	Q10740	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP23	YBR047W	EXO5	P38289	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP23	YBR047W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP23	YBR047W	TRM2	P33753	639 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	NEM1	P38757	446 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	YNR063W	P53749	607 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	SGD1	Q06132	899 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	LAM1	P38851	1228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	CDC55	Q00362	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	PUS9	Q12069	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	YJL045W	P47052	634 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	GCN5	Q03330	439 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	MEF2	P39677	819 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	MSE1	P48525	536 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	ENV11	P53246	860 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
FMP23	YBR047W	XKS1	P42826	600 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	ROT1	Q03691	256 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	RSC58	Q07979	502 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	YML122C	Q03207	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FMP23	YBR047W	PEX13	P80667	386 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	MNL2	Q12205	849 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	HCM1	P25364	564 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	YSC84	P32793	468 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	LEO1	P38439	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	ACF4	P47129	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	HNT2	P49775	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	ATG1	P53104	897 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	MSH3	P25336	1018 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	RSB1	Q08417	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	COQ4	O13525	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	CCZ1	P38273	704 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	SUN4	P53616	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	SLI1	P53304	468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	RSM26	P47141	266 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	TMA10	Q06177	86 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FMP23	YBR047W	VPS53	P47061	822 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	AIM21	P40563	679 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	PLB2	Q03674	706 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	RXT3	Q07458	294 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
FMP23	YBR047W	DOM34	P33309	386 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	SQT1	P35184	431 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	SAM37	P50110	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	CTF4	Q01454	927 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	DUS4	Q06063	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	GPB2	P39717	880 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	NTO1	Q12311	748 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	SPO21	Q12411	609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	CMP2	P14747	604 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	KIP1	P28742	1111 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	ADD66	P36040	267 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	RSM24	Q03976	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	GAL10	P04397	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	RAD53	P22216	821 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	LST4	P34239	828 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	PHO23	P50947	330 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	GPB1	Q08886	897 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FMP23	YBR047W	STE11	P23561	717 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	CDC20	P26309	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	TNA1	P53322	534 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	RKM2	Q03942	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	UGA4	P32837	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	RFC5	P38251	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	PEX28	P38848	579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	PIK1	P39104	1066 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	PTC5	Q12511	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	BAP2	P38084	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
FMP23	YBR047W	FRT1	Q99332	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP23	YBR047W	ULP1	Q02724	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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