RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A PLB2Q03674 706 aa3.69□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A CWC15Q03772 175 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A CDC20P26309 610 aa3.68□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A HNT2P49775 206 aa3.68□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A RSC58Q07979 502 aa3.68□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A LSO1Q3E827 93 aa3.67□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A OAR1P35731 278 aa3.66□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A MSS4P38994 779 aa3.66□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A YAR028WP39548 234 aa3.66□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A HRK1Q08732 759 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YBL008W-AYBL008W-A DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A MOH1P38191 138 aa3.65□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A SLS1P42900 643 aa3.65□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A PNP1Q05788 311 aa3.65□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A SAP155P43612 1002 aa3.64□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A HGH1P48362 394 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A UBA2P52488 636 aa3.64□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A RXT3Q07458 294 aa3.64□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A PUP1P25043 261 aa3.63□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A YJL045WP47052 634 aa3.63□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A RSA3Q05942 220 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A YAF9P53930 226 aa3.62□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A MCM5P29496 775 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A YKL077WP36081 392 aa3.61□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A NEM1P38757 446 aa3.61□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A RSC4Q02206 625 aa3.61□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A GPB1Q08886 897 aa3.61□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A CDC6P09119 513 aa3.6□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A DCG1P32460 244 aa3.6□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A EXO5P38289 585 aa3.6□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A SEC26P41810 973 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A PMT7Q06644 662 aa3.6□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A HSE1P38753 452 aa3.59□□□□□ -1.83
YBL008W-AYBL008W-A GAL10P04397 699 aa3.58□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A YSC84P32793 468 aa3.58□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A IOC3P43596 787 aa3.57□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A NUT1P53114 1132 aa3.57□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A YLR224WQ05947 369 aa3.57□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A SRM1P21827 482 aa3.56□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A CPS1P27614 576 aa3.56□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A CMP2P14747 604 aa3.55□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A YAP6Q03935 383 aa3.55□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A LAP2Q10740 671 aa3.55□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A SPO21Q12411 609 aa3.55□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A FLP1P03870 423 aa3.54□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A MTR4P47047 1073 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A VPS62P53285 467 aa3.54□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A COQ4O13525 335 aa3.53□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A QNS1P38795 714 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YBL008W-AYBL008W-A FUR4P05316 633 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A CCZ1P38273 704 aa3.52□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A RSM24Q03976 319 aa3.52□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A SHU2P38957 223 aa3.51□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A XKS1P42826 600 aa3.51□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A STU2P46675 888 aa3.51□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.51□□□□□ -1.85not detected
YBL008W-AYBL008W-A RSB1Q08417 382 aa3.51□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A NOB1Q08444 459 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A BAP2P38084 609 aa3.5□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A BOL3P39724 118 aa3.5□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A RVS167P39743 482 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A YNR063WP53749 607 aa3.5□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A EMC1P25574 760 aa3.49□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A UFD2P54860 961 aa3.49□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A YML083CQ04526 418 aa3.49□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A BSC2Q05611 235 aa3.48□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A AIM39Q08223 395 aa3.48□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A HMI1Q12039 706 aa3.48□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A ATG14P38270 344 aa3.47□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A GCV2P49095 1034 aa3.47□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A MON1P53129 644 aa3.47□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A TMN2Q04562 672 aa3.47□□□□□ -1.85
YBL008W-AYBL008W-A VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data3.47□□□□□ -1.85not detected
YBL008W-AYBL008W-A PIK1P39104 1066 aa3.46□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A YER158CP40095 573 aa3.46□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A TNA1P53322 534 aa3.46□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A NOG1Q02892 647 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A AFT2Q08957 416 aa3.46□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A NDJ1Q12366 352 aa3.46□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A RFC5P38251 354 aa3.45□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A PLB1P39105 664 aa3.45□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A VPS53P47061 822 aa3.45□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A YNL011CP53980 444 aa3.45□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A HOS3Q02959 697 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A YAP7Q08182 245 aa3.45□□□□□ -1.86
YBL008W-AYBL008W-A NOP12Q08208 459 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 134 ms