RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	UBX4	P54730	416 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RER2	P35196	286 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	VBA5	P36172	582 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	GDH3	P39708	457 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NTA1	P40354	457 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SPC105	P53148	917 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	HDA2	Q06629	674 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MPD2	Q99316	277 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TRS33	Q99394	268 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	STE6	P12866	1290 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	POL4	P25615	582 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PCL2	P25693	308 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RIM11	P38615	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PEA2	P40091	420 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ESL1	P40456	1118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ISU1	Q03020	165 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ADI1	Q03677	179 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	BSC2	Q05611	235 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	THI73	Q07904	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	BDS1	Q08347	646 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	CYT1	P07143	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MSN1	P22148	382 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	THI4	P32318	326 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	GRX7	P38068	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YHL041W	P38730	149 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TIM54	P47045	478 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MET14	Q02196	202 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	FOB1	O13329	566 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MKS1	P34072	584 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NIT2	P47016	307 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YGR237C	P50089	785 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TFB2	Q02939	513 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TRS130	Q03660	1102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YKU80	Q04437	629 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RTT10	Q08924	1013 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MCD1	Q12158	566 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	IRR1	P40541	1150 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YAP1802	P53309	568 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YML131W	Q03102	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	DAL4	Q04895	635 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MCM1	P11746	286 aa		3.34	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YGL140C	P53120	1219 aa		3.34	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.88	not detected
AI2	Q0055	YCS4	Q06156	1176 aa		3.34	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HXT8	P40886	569 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YFL034W	P43564	1073 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SAM37	P50110	327 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HOL1	P53389	586 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SSL2	Q00578	843 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	IRC3	Q06683	689 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SSP2	Q08646	371 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YDR056C	Q12025	205 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	RPN12	P32496	274 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HSE1	P38753	452 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	UME1	Q03010	460 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	DAL3	P32459	195 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TFC4	P33339	1025 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	KTR4	P38131	464 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YGR125W	P53273	1036 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MDM1	Q01846	1127 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ENT2	Q05785	613 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YLR346C	Q06139	101 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	DBF20	P32328	564 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	UTR2	P32623	467 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PSY2	P40164	858 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	NIT1	P40447	199 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MET13	P53128	600 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	DFG5	Q05031	458 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88

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