RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618318.1

RPRD1B-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, human

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1B-208	ENST00000618318	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	ZNF428	Q96B54	188 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	MS4A1	P11836	297 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	C8orf37	Q96NL8	207 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	IFT57	Q9NWB7	429 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	KDR	P35968	1356 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	SLIT3	O75094	1523 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	LRP5	O75197	1615 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	NFAT5	O94916	1531 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPRD1B-208	ENST00000618318	ATRN	O75882	1429 aa		10.15	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	NGLY1	Q96IV0	654 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	EP400	Q96L91	3159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	PXDN	Q92626	1479 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	CPD	O75976	1380 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	PEAK1	Q9H792	1746 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	ZNF853	P0CG23	659 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	AAMP	Q13685	434 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	NBPF4	Q96M43	638 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	ERBB3	P21860	1342 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	CHL1	O00533	1208 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	EVA1C	P58658	441 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	AKT1S1	Q96B36	256 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79	2e-7	■■■■□ 19.7
RPRD1B-208	ENST00000618318	SPG7	Q9UQ90	795 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	ALS2	Q96Q42	1657 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	ABCC6	O95255	1503 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	PLIN1	O60240	522 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	BCAR3	O75815	825 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	ADAMTS2	O95450	1211 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	MBIP	Q9NS73	344 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	USP21	Q9UK80	565 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	FAM83G	A6ND36	823 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	DCTN1	Q14203	1278 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	MCM10	Q7L590	875 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	KIAA0232	Q92628	1395 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	MAP3K5	Q99683	1374 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	GLI3	P10071	1580 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPRD1B-208	ENST00000618318	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPRD1B-208	ENST00000618318	VAMP4	O75379	141 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPRD1B-208	ENST00000618318	CHRNA2	Q15822	529 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPRD1B-208	ENST00000618318	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8

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