RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597816.5

LTBP4-218, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene LTBP4, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-218ENST00000597816 EYA1Q99502 592 aa21.96■■□□□ 1.11
LTBP4-218ENST00000597816 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 MEGF6O75095 1541 aa21.95■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 NBPF14Q5TI25 921 aa21.93■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 PROM2Q8N271 834 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 NCAPD2Q15021 1401 aa21.89■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.89■■□□□ 1.1
LTBP4-218ENST00000597816 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 SPG7Q9UQ90 795 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 MTHFSP49914 203 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 TXNRD1Q16881 649 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 NHSQ6T4R5 1651 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 RREB1Q92766 1687 aa21.86■■□□□ 1.09
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LTBP4-218ENST00000597816 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 CYP27B1O15528 508 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.84■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 IL13P35225 146 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBP4-218ENST00000597816 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.83■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 BTAF1O14981 1849 aa21.81■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.8■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.8■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.79■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.79■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.78■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 PHKG2P15735 406 aa21.77■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.77■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.77■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 STK32BQ9NY57 414 aa21.77■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.77■■□□□ 1.08
LTBP4-218ENST00000597816 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.76■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.76■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 SLC15A2Q16348 729 aa21.75■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.74■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 KDRP35968 1356 aa21.73■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 PIGBQ92521 554 aa21.72■■□□□ 1.07
LTBP4-218ENST00000597816 HMOX1P09601 288 aa21.7■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 CFAP53Q96M91 514 aa21.7■■□□□ 1.06
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LTBP4-218ENST00000597816 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.69■■□□□ 1.06
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LTBP4-218ENST00000597816 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.69■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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LTBP4-218ENST00000597816 KCNQ4P56696 695 aa21.68■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 ITGB4P16144 1822 aa21.68■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 SPON1Q9HCB6 807 aa21.67■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 AKT1S1Q96B36 256 aa21.66■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.66■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 LRP5O75197 1615 aa21.66■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 PALLDQ8WX93 1383 aa21.65■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 ZNF827Q17R98 1081 aa21.65■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 LY75O60449 1722 aa21.65■■□□□ 1.06
LTBP4-218ENST00000597816 NUDCQ9Y266 331 aa21.64■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.63■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.63■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 PAPPAQ13219 1627 aa21.62■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 CABP4P57796 275 aa21.62■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.62■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 ATG3Q9NT62 314 aa21.61■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 ZBTB7AO95365 584 aa21.6■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 SIK1P57059 783 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 CASZ1Q86V15 1759 aa21.59■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.58■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LTBP4-218ENST00000597816 RALBP1Q15311 655 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 MTFR1LQ9H019 292 aa21.57■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 LGR6Q9HBX8 967 aa21.56■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.55■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LTBP4-218ENST00000597816 ATP6V1AP38606 617 aa21.55■■□□□ 1.04
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