RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595194.1

GTPBP3-208, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-208	ENST00000595194	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
GTPBP3-208	ENST00000595194	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
GTPBP3-208	ENST00000595194	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GTPBP3-208	ENST00000595194	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
GTPBP3-208	ENST00000595194	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GTPBP3-208	ENST00000595194	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GTPBP3-208	ENST00000595194	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GTPBP3-208	ENST00000595194	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GTPBP3-208	ENST00000595194	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	NSD2	O96028	1365 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	PTGER2	P43116	358 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	PANK3	Q9H999	370 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GTPBP3-208	ENST00000595194	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	KCNQ4	P56696	695 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	CYP27B1	O15528	508 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	EYA1	Q99502	592 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GTPBP3-208	ENST00000595194	LY75	O60449	1722 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.28	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
GTPBP3-208	ENST00000595194	ARX	Q96QS3	562 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	PIGB	Q92521	554 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.2	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.2	■■■□□ 2.11
GTPBP3-208	ENST00000595194	PHKG2	P15735	406 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	ITGB4	P16144	1822 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	UTRN	P46939	3433 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	YY1	P25490	414 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	POLD1	P28340	1107 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	MSH5	O43196	834 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	C5	P01031	1676 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GTPBP3-208	ENST00000595194	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	SIK1	P57059	783 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	AK7	Q96M32	723 aa		28.09	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GTPBP3-208	ENST00000595194	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	IL13	P35225	146 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	MTHFS	P49914	203 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GTPBP3-208	ENST00000595194	ITPK1	Q13572	414 aa		28.02	■■■□□ 2.08

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