RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS72	Q15906	364 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.04	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF521	Q96K83	1311 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		12.03	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49	1e-6	■□□□□ 10.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCTN1	Q14203	1278 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCM10	Q7L590	875 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12.01	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K5	Q99683	1374 aa		12	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP27B1	O15528	508 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATRN	O75882	1429 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHKG2	P15735	406 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOC5	O00471	708 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDB1	Q16531	1140 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLI3	P10071	1580 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0G2JS52	829 aa		11.96	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576		E9PSI1	815 aa		11.96	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYT1	Q01538	1121 aa		11.96	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.96	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL16	Q14005	1332 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.94	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.94	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEF	Q10587	303 aa		11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.93	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	EP400	Q96L91	3159 aa		11.92	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNAI1	P63096	354 aa		11.92	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.92	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.92	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.92	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHL1	O00533	1208 aa		11.91	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.91	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.91	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		11.91	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.9	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms