RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589686.5

CIRBP-224, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 2

Gene CIRBP, Length 532 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-224	ENST00000589686	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	NHS	Q6T4R5	1651 aa		28.7	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	NBPF14	Q5TI25	921 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	EYA1	Q99502	592 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CIRBP-224	ENST00000589686	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	PROM2	Q8N271	834 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	TXNRD1	Q16881	649 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	BTAF1	O14981	1849 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.58	■■■□□ 2.17	4e-13	■□□□□ 8.8
CIRBP-224	ENST00000589686	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-224	ENST00000589686	CYP27B1	O15528	508 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-224	ENST00000589686	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-224	ENST00000589686	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-224	ENST00000589686	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-224	ENST00000589686	MTHFS	P49914	203 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-224	ENST00000589686	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-224	ENST00000589686	LRP5	O75197	1615 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	IL13	P35225	146 aa		28.5	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.5	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CIRBP-224	ENST00000589686	PHKG2	P15735	406 aa		28.45	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.45	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.45	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	KDR	P35968	1356 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.4	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.4	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	LY75	O60449	1722 aa		28.39	■■■□□ 2.14
CIRBP-224	ENST00000589686	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	SPON1	Q9HCB6	807 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	ITGB4	P16144	1822 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	PIGB	Q92521	554 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	KCNQ4	P56696	695 aa		28.36	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.36	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	HMOX1	P09601	288 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CIRBP-224	ENST00000589686	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.3	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.12
CIRBP-224	ENST00000589686	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	CABP4	P57796	275 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.24	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	SIK1	P57059	783 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	C5	P01031	1676 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CIRBP-224	ENST00000589686	PTGER2	P43116	358 aa		28.2	■■■□□ 2.1
CIRBP-224	ENST00000589686	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
CIRBP-224	ENST00000589686	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CIRBP-224	ENST00000589686	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
CIRBP-224	ENST00000589686	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CIRBP-224	ENST00000589686	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CIRBP-224	ENST00000589686	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.17	■■■□□ 2.1

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