RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	DDB1	Q16531	1140 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	ACE	P12821	1306 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	GC	P02774	474 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TOM1L1-223	ENST00000576932	EVX2	Q03828	476 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARX	Q96QS3	562 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLIT3	O75094	1523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	GABBR2	O75899	941 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TOM1L1-223	ENST00000576932	COL18A1	P39060	1754 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	GPR162	Q16538	588 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	USP6	P35125	1406 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	EXOC5	O00471	708 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	IER5L	Q5T953	404 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25	4e-8	■■□□□ 11.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	ABCC6	O95255	1503 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TOM1L1-223	ENST00000576932	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932		G3V3G9	751 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	GRIN3B	O60391	1043 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	POLD1	P28340	1107 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	BTAF1	O14981	1849 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1L1-223	ENST00000576932	HSPA6	P17066	643 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	NFAT5	O94916	1531 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	SEC24B	O95487	1268 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLCG2	P16885	1265 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TOM1L1-223	ENST00000576932	IL2RB	P14784	551 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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