RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 ZBTB7AO95365 584 aa35.29■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.29■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.28■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.28■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 SHANK3Q9BYB0 1731 aa35.27■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 LRRC4BQ9NT99 713 aa35.26■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
SPNS1-209ENST00000567771 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa35.25■■■■□ 3.23
SPNS1-209ENST00000567771 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
SPNS1-209ENST00000567771 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.24■■■■□ 3.23
SPNS1-209ENST00000567771 PAPPAQ13219 1627 aa35.24■■■■□ 3.23
SPNS1-209ENST00000567771 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
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SPNS1-209ENST00000567771 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.21■■■■□ 3.23
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SPNS1-209ENST00000567771 ZNF827Q17R98 1081 aa35.2■■■■□ 3.23
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SPNS1-209ENST00000567771 SLC27A3Q5K4L6 730 aa35.18■■■■□ 3.22
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SPNS1-209ENST00000567771 KCNQ4P56696 695 aa35.14■■■■□ 3.22
SPNS1-209ENST00000567771 AKT1S1Q96B36 256 aa35.14■■■■□ 3.22
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SPNS1-209ENST00000567771 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.11■■■■□ 3.21
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SPNS1-209ENST00000567771 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
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SPNS1-209ENST00000567771 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
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SPNS1-209ENST00000567771 SYT17Q9BSW7 474 aa34.99■■■■□ 3.19
SPNS1-209ENST00000567771 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.98■■■■□ 3.19
SPNS1-209ENST00000567771 ARXQ96QS3 562 aa34.98■■■■□ 3.19
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SPNS1-209ENST00000567771 SLC16A10Q8TF71 515 aa34.97■■■■□ 3.19
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SPNS1-209ENST00000567771 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
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SPNS1-209ENST00000567771 COL24A1Q17RW2 1714 aa34.84■■■■□ 3.17
SPNS1-209ENST00000567771 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.83■■■■□ 3.17
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SPNS1-209ENST00000567771 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.69■■■■□ 3.14
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SPNS1-209ENST00000567771 LINC00116Q8NCU8 138 aa34.69■■■■□ 3.14
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SPNS1-209ENST00000567771 DCAF5Q96JK2 942 aa34.68■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 ERVV-2B6SEH9 535 aa34.67■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 ITPK1Q13572 414 aa34.67■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.67■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 NLGN2Q8NFZ4 835 aa34.67■■■■□ 3.14
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