RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBLN1P23142 703 aa25.64■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF10O15013 1369 aa25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.62■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCA3Q99758 1704 aa25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 SSH2Q76I76 1423 aa25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAMTS2O95450 1211 aa25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABTB2Q8N961 1025 aa25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIK3C2AO00443 1686 aa25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFE2L2Q16236 605 aa25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.58■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.58■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.58■■□□□ 1.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF428Q96B54 188 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 NME9Q86XW9 330 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMOX1P09601 288 aa25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL13P35225 146 aa25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMC5Q8IY18 1101 aa25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 NLRP6P59044 892 aa25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 C8orf37Q96NL8 207 aa25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 COG3Q96JB2 828 aa25.5■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFT57Q9NWB7 429 aa25.5■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 VAMP4O75379 141 aa25.49■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 GNAI1P63096 354 aa25.49■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF853P0CG23 659 aa25.48■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOX12O15370 315 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 NGLY1Q96IV0 654 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-205ENST00000564630 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 MBIPQ9NS73 344 aa25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 FSD2A1L4K1 749 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUCB1Q02818 461 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPYL6Q8N831 410 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 AFF2P51816 1311 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLIT3O75094 1523 aa25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 GCP02774 474 aa25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA0232Q92628 1395 aa25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFAP44Q96MT7 982 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP54Q70EL1 1684 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP31Q70CQ4 1352 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHRNA2Q15822 529 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM83GA6ND36 823 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC4O15439 1325 aa25.39■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 LNPKQ9C0E8 428 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFAT5O94916 1531 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP21Q9UK80 565 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 GCC1Q96CN9 775 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLIT2O94813 1529 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 MCM4P33991 863 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTEAQ6S8J7 498 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.33■■□□□ 1.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 BTG4Q9NY30 223 aa25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms